Este é o aplicativo do Windows chamado ShuffleFastaSeq, cuja versão mais recente pode ser baixada como ShuffleFastaSeq.exe. Ele pode ser executado online no provedor de hospedagem gratuito OnWorks para estações de trabalho.
Baixe e execute online este aplicativo chamado ShuffleFastaSeq com OnWorks gratuitamente.
Siga estas instruções para executar este aplicativo:
- 1. Baixe este aplicativo em seu PC.
- 2. Entre em nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que você deseja.
- 3. Carregue este aplicativo em tal gerenciador de arquivos.
- 4. Inicie qualquer emulador on-line OS OnWorks a partir deste site, mas um emulador on-line melhor do Windows.
- 5. No sistema operacional OnWorks Windows que você acabou de iniciar, acesse nosso gerenciador de arquivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX com o nome de usuário que deseja.
- 6. Baixe o aplicativo e instale-o.
- 7. Baixe o Wine de seus repositórios de software de distribuição Linux. Depois de instalado, você pode clicar duas vezes no aplicativo para executá-lo com o Wine. Você também pode experimentar o PlayOnLinux, uma interface sofisticada do Wine que o ajudará a instalar programas e jogos populares do Windows.
Wine é uma forma de executar software Windows no Linux, mas sem a necessidade de Windows. Wine é uma camada de compatibilidade do Windows de código aberto que pode executar programas do Windows diretamente em qualquer desktop Linux. Essencialmente, o Wine está tentando reimplementar o suficiente do Windows do zero para que possa executar todos os aplicativos do Windows sem realmente precisar do Windows.
SCREENSHOTS
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ShuffleFastaSeq
DESCRIÇÃO
ShuffleFastaSeq é um aplicativo de formulário do Windows, escrito em C#, para embaralhar sequências formatadas em FASTA. A permutação aleatória é obtida usando uma variação simples do algoritmo de Fisher-Yates implementado por Durstenfeld (https://en.wikipedia.org/wiki/Fisher%E2%80%93Yates_shuffle) ( Knuth DE. A arte da programação de computadores: algoritmos seminuméricos. 3ª ed. Boston: Addison-Wesley; 1997). O arquivo de entrada contém uma ou mais sequências no formato FASTA. O número de embaralhamentos (n) para cada sequência pode ser definido; por padrão, n é 100. O arquivo de saída contém n cópias embaralhadas no formato FASTA para cada sequência de entrada.
Por exemplo (n=3):
Arquivo de entrada:
>a
AGGT
>b
GCCCATTC
Arquivo de saída:
>a
TCGAG
>a
CGAGT
>a
TGCGA
>b
CACTCCGT
>b
CCCGTATC
>b
CCTTCAGC
Público
Ciência / Pesquisa
Interface com o usuário
Win32 (MSWindows)
Linguagem de Programação
C#
Categorias
Este é um aplicativo que também pode ser obtido em https://sourceforge.net/projects/shufflefastaseq/. Ele foi hospedado no OnWorks para ser executado on-line da maneira mais fácil a partir de um de nossos sistemas operacionais gratuitos.
