Aceasta este comanda bowtie2-inspect-s care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
bowtie2-inspect-s - extrage informații dintr-un index bowtie2
REZUMAT
papion2-inspectează [Opțiuni]*
DESCRIERE
Bowtie 2 versiunea 2.2.6 de Ben Langmead ([e-mail protejat], www.cs.jhu.edu/~langmea)
numele fișierului bt2 minus finalul .1.bt2/.2.bt2
În mod implicit, imprimă înregistrările FASTA ale secvențelor de nucleotide indexate la standard
afară. Cu -n, imprimă doar nume. Cu -s, imprimă doar un rezumat al indexului
parametrii și secvențele. Cu -e, păstrează culorile dacă este cazul.
OPŢIUNI
-a/--de-a lungul
Numărul de caractere în ieșirea FASTA (implicit: 60)
-n/--nume
Tipăriți numai numele secvenței de referință
-s/--rezumat
Imprimare rezumat incl. nume de ref, lungimi, proprietăți de index
-e/--bt2-ref
Reconstituiți referința din .bt2 (lent, păstrează culorile)
-v/--verbos
Ieșire detaliată (pentru depanare)
-h/--Ajutor
imprimați descrierea detaliată a instrumentului și a opțiunilor sale
--Ajutor tipăriți acest mesaj de utilizare
Utilizați online bowtie2-inspect-s folosind serviciile onworks.net
