Aceasta este comanda bp_chaos_plotp care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
bp_chaos_plot - o diagramă a haosului din secvențele de ADN și ARN
REZUMAT
bp_chaos_plot.pl -i/--input=INPUTFILE -f/--format=SEQFORMAT
-o/--output=OUTPUTFILE -g/--graphics=FORMAT GRAFIC
-w/--width=WIGHT -h/--height=ALTime
DESCRIERE
Acest script generează fișiere de imagine folosind biblioteca de imagini GD pentru a vizualiza nucleotidele
secvențe folosind diagrama haosului.
OPŢIUNI
Formatele grafice valide sunt în prezent gd, gd2, png, wbmp, jpeg și gif.
Dimensiunea implicită a fișierului imagine este 600x400.
Intrarea secvenței poate fi furnizată folosind oricare dintre cele trei metode:
argument nenumit
bp_chaos_plot nume de fișier
argument numit
bp_chaos_plot -i nume de fișier
intrare standard
bp_chaos_plot < nume de fișier
PARERE
Mailing liste
Feedback-ul utilizatorilor este o parte integrantă a evoluției acestui și a altor module Bioperl. Trimite
comentariile și sugestiile dvs. de preferință către lista de corespondență Bioperl. Participarea ta
este mult apreciat.
[e-mail protejat] - Discutie generala
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - Despre listele de corespondență
Raportarea Bugs
Raportați erorile către sistemul de urmărire a erorilor Bioperl pentru a ne ajuta să ținem evidența erorilor și a acestora
rezoluţie. Rapoartele de erori pot fi trimise prin intermediul web:
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
AUTOR - Jason Stajich
E-mail [e-mail protejat]
ISTORIE
Acest cod se bazează pe codul EMBOSS C pentru chaos.c de Ian Longden. Sunt incluse
documentație din codul EMBOSS:
Haosul produce un complot haos. Aplicația originală face parte din genomul ACEDB
pachet de baze de date, scris de ** Richard Durbin (MRC LMB, Marea Britanie) [e-mail protejat], și
Jean Thierry-Mieg (CRBM du CNRS, Franța) [e-mail protejat]
Utilizați bp_chaos_plotp online folosind serviciile onworks.net