Aceasta este comanda bp_multi_hmmsearch.plp care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
multi_hmmsearch - efectuați o căutare hmm în mai multe fișiere FASTA folosind
un fișier INDEX
REZUMAT
multi_hmmsearch -p fișier_hmm [-i] -f fișier_index
DESCRIERE
Din punct de vedere tehnic, nu este un script Bio::Tools::Run, deoarece acesta nu folosește niciun Bioperl sau Bioperl-run
componente dar este util.
obligatoriu Opțiuni:
-p Profil HMM de utilizat pentru căutare.
-f Fișier INDEX care conține o listă de fișiere FASTA pentru multiplu
căutare.
Special Opțiuni:
-i Creați un nou fișier index cu fișierele hmms rezultate. Aceasta este
util dacă doriți să treceți această listă ca argumente de intrare în
alte programe.
-h Afișați această documentație.
PARERE
Mailing liste
Feedback-ul utilizatorilor este o parte integrantă a evoluției acestui și a altor module Bioperl. Trimite
comentariile și sugestiile dvs. de preferință către lista de corespondență Bioperl. Participarea ta
este mult apreciat.
[e-mail protejat] - Discutie generala
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - Despre listele de corespondență
Raportarea Bugs
Raportați erorile către sistemul de urmărire a erorilor Bioperl pentru a ne ajuta să ținem evidența erorilor și a acestora
rezoluţie. Rapoartele de erori pot fi trimise prin intermediul web:
http://redmine.open-bio.org/projects/bioperl/
Utilizați bp_multi_hmmsearch.plp online folosind serviciile onworks.net
