Aceasta este comanda cassiopee care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
cassiopee - pagină de manual pentru Cassiopee versiunea 1.0
REZUMAT
casiopee [Opțiuni]
DESCRIERE
Utilizare:
-l: adâncimea maximă a indicelui / dimensiunea maximă a modelului
-u: salvați indexul pentru utilizare ulterioară
-s: secvență de indexat
-p: model de căutat
-f: fișierul care conține modelul de căutat
-o: fisier de iesire
-r: aplicați reducerea arborilor
-m: mod de căutare: 0=ADN, 1=ARN, 2=Proteină
-a: permite căutarea ambiguității alfabetice
-n: max consecutiv N potriviri permise în căutare
-e: înlocuirea maximă permisă potriviri în căutare
-i: max indel permise potriviri în căutare
-g: generează un fișier punct al graficului
-d: adâncimea maximă a graficului
-t: format de ieșire: 0:tsv (implicit), 1:json
-x: poziție minimă în succesiune
-y: poziția maximă în succesiune
-v: arată versiunea
-h: arată acest mesaj
Utilizați Cassiopee online folosind serviciile onworks.net
