Aceasta este comanda cmtk-unwarp_image_phantom care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
unwarp_image_phantom - Creează o transformare pentru a deforma o imagine bazată pe o fantomă
descriere
REZUMAT
unwarp_image_phantom InputPhantom InputImage OutputXform
DESCRIERE
Acest instrument calculează fie o transformare polinomială, fie o deformare în formă liberă B-spline la
deformează o imagine. Transformarea se bazează pe repere așteptate și detectate într-un
imaginea unei fantome structurale dobândită pe același scaner. Utilizați „detect_adni_phantom”
instrument pentru a detecta repere ale ADNI Phantom într-o imagine și pentru a genera o fantomă
fișier de descriere potrivit pentru utilizarea cu acest instrument.
OPŢIUNI
Caritate Setul de instrumente Opţiuni (aceste sunt comun by toate CMTK instrumente)
--Ajutor
Scrieți lista cu opțiunile de bază ale liniei de comandă la ieșirea standard.
--ajută-toți
Scrieți lista completă a opțiunilor de linie de comandă de bază și avansate la ieșirea standard.
--wiki
Scrieți lista de opțiuni de linie de comandă la ieșirea standard în marcajul MediaWiki.
--om
Scrieți sursa paginii de manual în marcajul „nroff” la ieșirea standard.
--versiune
Scrieți versiunea setului de instrumente în ieșirea standard.
--ecou
Scrieți linia de comandă curentă la ieșirea standard.
--nivel-verbos
Setați nivelul de verbozitate.
--verbos, -v
Creșteți nivelul de verbozitate cu 1 (învechit; acceptat pentru compatibilitate cu versiunea anterioară).
--fire
Setați numărul maxim de fire paralele (pentru fire POSIX și OpenMP).
Montaj Opţiuni
--potrivire-invers
Potriviți transformarea inversă (cartarea locațiilor reale cu repere așteptate). Aceasta este
util pentru calcularea unei hărți de corecție a volumului jacobian (folosind „reformatx”) fără
trebuind să inverseze numeric transformarea nedeformată montată.
--potrivit-înainte
Potriviți transformarea înainte (cartarea estimată a locațiilor repere reale). Aceasta este
util pentru rectificarea imaginii prin reslicing (folosind „reformatx”). [Acest is il
Mod implicit]
Transformare modele
--splina
Se potrivește deformarea B-spline în formă liberă.
--poli
Potriviți transformarea polinomială. [Acest is il Mod implicit]
polinom Montaj Opţiuni (cu --poli)
--grad
Gradul transformării polinomului adaptat. [Mod implicit: 4]
B-Spline Montaj Opţiuni (cu --splina)
--final-cp-spacing
Spațierea dintre grila punctului de control final al transformării B-spline de ieșire. [Mod implicit: 0]
--final-cp-dims
Dimensiunile finale ale grilei punctelor de control (adică numărul de puncte de control) ale ieșirii B-
transformare spline. A fi furnizat ca „dimX, dimY, dimZ”. [Mod implicit: NICI UNUL]
--niveluri
Numărul de niveluri în procedura de aproximare B-spline pe mai multe niveluri. [Mod implicit: 1]
--iterații-pe-nivel
Numărul maxim de iterații de actualizare a coeficientului spline pe nivel în multi-nivel
Procedura de aproximare B-spline. [Mod implicit: 100]
--rms-threshold
Prag pentru îmbunătățirea relativă a reziduului de fiting RMS. Iterația potrivită
se încheie dacă (rmsAfterUpdate-rmsBeforeUpdate)/rmsBeforeUpdate < prag.
[Mod implicit: 0]
--no-fit-afine
Dezactivați potrivirea transformării afine pentru a inițializa spline. În schimb, potriviți spline
direct. Acest lucru dă de obicei rezultate mai proaste și este descurajat.
AUTORI
Torsten Rohlfing, cu contribuții de la Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff și Yaroslav Halchenko
Utilizați cmtk-unwarp_image_phantom online folosind serviciile onworks.net