Aceasta este comanda EDTSurf care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
EDTSurf - construcția rapidă și precisă a suprafețelor macromoleculare
REZUMAT
EDTSurf -i pdbname...
DESCRIERE
EDTSurf este un program open source pentru a construi suprafețe triangulate pentru macromolecule. Aceasta
generează trei suprafețe macromoleculare majore: suprafața van der Waals, accesibilă solventului
suprafață și suprafață moleculară (suprafață exclusă de solvent). EDTsurf identifică și carii
care se află în interiorul macromoleculelor.
OPŢIUNI
-o outname
-t 1-MC 2-VCMC
-s 1-VWS 2-SAS 3-MS 4-SES
-c 1-pur 2-atomi 3-lanț
-p raza sondei [0,2.0]
-f factor de scară (0,20.0]
-h 1-in și out 2-out 3-in
output1: outname.ply
output2: outname.asa
output3: outname-cav.pdb
Utilizați EDTSurf online folosind serviciile onworks.net