Aceasta este comanda fastaq-trim_contigs care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
fastaq_trim_contigs - Decupează un număr stabilit de baze de la sfârșitul fiecărui contig
DESCRIERE
utilizare: fastaq_trim_contigs [opțiuni]
Decupează un număr stabilit de baze de la capătul fiecărui contig, astfel încât golurile devin mai mari și contig
capetele sunt îndepărtate. Bazele sunt înlocuite cu Ns. Orice secvență care se termină ca toți N-urile se pierde
pozitional argumente:
infile Numele fișierului de intrare
outfile
Numele fișierului de ieșire
facultativ argumente:
-h, --Ajutor
afișați acest mesaj de ajutor și ieșiți
--trim_number TRIM_NUMBER
Numărul de baze de tăiat în jurul fiecărei goluri și capete ale fiecărei secvențe [100]
Utilizați fastaq-trim_contigs online folosind serviciile onworks.net
