Aceasta este comanda fsl-5.0-core care poate fi rulată în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks folosind una dintre multiplele noastre stații de lucru online gratuite, cum ar fi Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows sau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NUME
fsl - instrumente de analiză pentru imagistica cerebrală FMRI, RMN și DTI
DESCRIERE
FSL este un set de instrumente cuprinzător pentru analiza datelor imagistice medicale ale creierului. Aceasta
oferă instrumente pentru preprocesarea datelor, extragerea creierului, înregistrarea imaginilor, precum și a
spectru larg de analize statistice. FSL oferă o interfață grafică ușor de utilizat.
FSL necesită setarea corectă a unui număr de variabile de mediu. Pentru a realiza acest lucru,
vă rugăm să găsiți scriptul de configurare din /etc/fsl/5.0/fsl.sh. O modalitate de a face asta
automat este de a adăuga o linie care conține
. /etc/fsl/5.0/fsl.sh
la fișierul .bashrc dintr-un director principal al utilizatorilor (sau un fișier corespunzător pentru alte shell-uri
decât bash). Poate fi necesar să creați mai întâi un astfel de fișier.
Alternativ, pachetul Debian instalează linkuri simbolice pentru toate instrumentele FSL în / usr / bin acea
aveți grijă să încărcați automat configurația corespunzătoare. Numele legăturilor simbolice sunt
prefixată cu cea corespunzătoare FSL versiune pentru a preveni conflictele de nume de fișier și a permite
versiuni multiple pentru a coexista pe același sistem. De exemplu, cel feliat comanda este
disponibil ca fsl5.0-slicer. Vă rugăm să rețineți că pentru utilizare FSL instrumente prin aceste link-uri simbolice este
nu necesar pentru a efectua procedura de configurare descrisă mai sus. Cu toate acestea, această comoditate
caracteristica este specifică Debian. Scripturi care folosesc comenzi FSL și sunt destinate a fi partajate
cu alții ar trebui să se bazeze pe nume de comenzi fără prefix și pe variabila de mediu FSL
înființat.
FSL interfața cu utilizatorul se referă uneori la un FSLDIR. Pe sistemele Debian aceasta este
/usr/share/fsl/5.0 pentru FSL versiunea 5.0.
FSL documentația și ajutorul online sunt furnizate de fsl-5.0-doc pachet.
Întrebări referitoare la utilizarea FSL sau teoria conexă poate fi postată pe FSL discuții
listă (A se vedea http://www.jiscmail.ac.uk/lists/fsl.html).
PARALELIZARE
FSL poate fi configurat pentru a trimite joburi către un Sun Gridengine (SGE) care rulează. Deși nu toate
funcționalitatea implementată în FSL suportă acest tip de paralelizare, cea mai solicitantă
instrumentele de prelucrare (de ex. POSSUM și FDT) fac.
FSL ar trebui să poată utiliza SGE chiar dacă variabila de mediu SGE_ROOT nu este setată, ca în
cazul pachetului Debian al SGE. Pentru a activa procesarea în lot, setați pur și simplu
FSLPARALLEL=1
în shell-ul în care rulează FSL. Aceasta poate fi activată permanent în
/etc/fsl/5.0/fsl.sh
sau de la caz la caz.
Utilizați fsl-5.0-core online folosind serviciile onworks.net
