usturoi - Online în Cloud

PROGRAM:

NUME

usturoi - program de vizualizare moleculară

REZUMAT

usturoi [adevărat Usturoi Opțiuni] [X11 Opțiuni] [nume de fișier]

DESCRIERE

Această pagină de manual documentează pe scurt usturoi, un program gratuit de vizualizare moleculară.
O documentație extinsă în format HTML și surse pot fi găsite la usturoi acasă,
<URL-ul:http://garlic.mefos.hr/garlic/>. Locație fizică: Facultatea de Medicină, Universitatea
din Osijek, Croația, Europa. Pachete precompilate pentru o serie de distribuții GNU/Linux
Sunt disponibile. Acestea includ Debian, SuSE, Mandriva, Linspire și o serie de altele
distribuții. Documentația HTML poate fi descărcată și dezambalată pentru uz local (recomandat
utilizare). Aici puteți găsi o descriere foarte scurtă a programului și lista de comenzi
opțiuni de linie.

usturoi este un program de vizualizare moleculară scris inițial pentru investigarea
proteine ​​membranare. Acum poate fi folosit pentru vizualizarea și editarea simplă a tuturor proteinelor și
molecule. Această versiune recunoaște formatul PDB versiunea 2.1; vezi fisierul sursa pdb_atom.c
pentru detalii despre acest format.

OPŢIUNI

Opțiunile liniei de comandă pot fi împărțite în două grupuri: adevărat (specific) usturoi Opțiuni și X11
Opțiuni. Opțiunile pot fi date în orice ordine. Toate opțiunile și valorile implicite codificate sunt
enumerate în tabelul de mai jos. Pentru fiecare parametru, valoarea definită prin linia de comandă este
folosit, dacă este disponibil. Dacă nu, valoarea definită în .usturoiul este utilizat fișierul. Dacă .usturoiul
fișierul nu este disponibil sau nu există nicio intrare corespunzătoare în acest fișier, codificat
este folosită valoarea implicită. Proba .usturoiul fișierul inclus în pachetul original conține
valorile egale cu valorile implicite hard-coded.

usturoi opţiuni:
-h, --Ajutor
Imprimați ajutorul și ieșiți.

-v, --versiune
Versiunea tipărită și ieșire.

-r, --Inregistreaza-te
Înregistrați usturoi: informați autorul că site-ul dvs. are usturoi instalat și că cineva
va folosi acest program. Prin înregistrare, îl încurajați pe autor să facă acest lucru
continua dezvoltarea usturoiului. De asemenea, puteți ajuta autorul să asigure suport pentru
dezvoltare ulterioară. Această opțiune trimite un mesaj scurt de e-mail, care conține doar
antetul mesajului de e-mail și cuvântul „Bună!”, către[e-mail protejat]>. Vă rog
executați garlic -r dacă veți folosi acest program. Dacă nu sunteți conectat la
Internet, luați în considerare trimiterea unui mesaj scurt de la alt sistem.

-nosys Ascunde pictograma sistemului de coordonate (colțul din stânga sus).

-fara control
Ascundeți fereastra de control (colțul din dreapta sus).

-stereo
Afișează imaginea stereo.

-dală mod
Modul implicit al plăcii. Modurile de plăci disponibile sunt: ​​oprit, plan (implicit), sferă,
jumătate de sferă, cilindru și jumătate de cilindru.

-decolorare mod
Modul implicit de estompare a culorii. Moduri disponibile: oprit, plan (implicit), sferă,
jumătate de sferă, cilindru și jumătate de cilindru.

-la fel de număr
Stil implicit de desen atomic (cod implicit: 2).

-bs număr
Stil implicit de desen pentru obligații (implicit codificat: 2).

-fs număr
Numărul implicit de suprafețe de decolorare a culorii. Planuri paralele, sfere concentrice sau
cilindrii concentrici pot fi utilizați ca suprafețe de estompare. Trei triplete RGB sunt
atribuite fiecărei suprafeţe. Suprafețele sunt distanțate uniform; cel putin unul si cel mult
opt ar trebui definite. Cel puțin trei culori (stânga, mijloc și dreapta) sunt
atribuite fiecărui atom vizibil. Aceste trei culori se bazează pe poziția lui a
atomul dat în raport cu cea mai apropiată suprafață (suprafețele) de decolorare și pe culorile atribuite
aceste suprafete. Culorile sunt combinate folosind ponderare liniară.

-lc culoare
Culoarea stângă la suprafața i-a; i este între zero și șapte. Șirul de culoare
ar trebui să fie compatibil cu X11R5. Albastrul, de exemplu, poate fi definit ca albastru sau ca
RGB:0000/0000/FFFF etc. De exemplu -lc4 RGB:BBBB/8888/4444 definește culoarea stângă
la suprafaţa al cărei indice este egal cu patru.

-mc culoare
Culoarea mijlocie la suprafața i-a.

-rc culoare
Culoarea corectă la suprafața i-a.

-buc, --print-config
Imprimați datele de configurare și ieșiți.

- pcn Tipăriți numele cursorului în stdout și ieșiți.

-Buturuga fișier jurnal
Scrieți comenzi și mesaje în fișierul jurnal. Fișierul va fi creat în curent
directorul de lucru. Dacă acest lucru nu este posibil, fișierul jurnal va fi creat în casa utilizatorilor
director.

X11 opţiune:
-afişa numele afisat
Server X de contactat.

-geometrie geom
Geometria ferestrei (implicit: aproape tot ecranul).

- ro culoare
Culoarea de fundal a ferestrei principale (implicit este negru).

-fg culoare
Culoarea primului plan al ferestrei principale (implicit: alb).

-fn fontname
font text; (implicit este 10x20).

-tbg culoare
Culoarea fundalului textului (implicit este negru).

-tfg culoare
Culoarea textului (implicit este alb).

-cursor cursorname
Numele cursorului; vedea /usr/include/X11/cursorfont.h pentru nume; eliminați prefixul XC_.

Utilizați usturoiul online folosind serviciile onworks.net