LAdump - Online în cloud

PROGRAM:

NUME

LAdump - afișați aliniamentele locale ale dalignerului într-un format simplu

REZUMAT

LAdump [-cdt] [-o] src1:db|dam [ src2:db|dam ] align:las [ citește: FILE | citește:gamă ... ]

DESCRIERE

Aprecieri LAshow(1), LAdump permite afișarea aliniamentelor locale (LA) ale unui subset al
grămadă într-un fișier .las și selectați ce informații să afișați despre ele. Diferența este
că informațiile sunt scrise într-un format ASCII „1-code” foarte simplu, ceea ce face ușor
pentru ca cineva să citească și să analizeze informațiile pentru o utilizare ulterioară. Pentru fiecare LA perechea de citiri
este scos pe o linie. -c solicită ca unul să scoată în continuare coordonatele LA
segmentele să fie scoase la ieșire. The -d opțiunea solicită ca numărul de diferență în LA să fie
ieșire și -t solicită ca informațiile de urmărire să fie scoase. In cele din urma, -o cereri de
ca numai LA-uri care sunt suprapuneri adecvate să fie scoase.

Formatul este foarte simplu. Fiecare informație solicitată apare pe o linie. The
primul caracter al fiecărei linii este un caracter „1-cod” care vă spune ce informații să aveți
așteaptă-te pe linie. Restul rândului conține informații unde se află fiecare articol
separate printr-un singur spațiu liber. Linia punctului de urmărire oferă numărul de puncte de urmărire
intervale în LA și este imediat urmată de atâtea rânduri care conțin o pereche de
numere întregi care oferă numărul de diferențe și deplasarea b în fiecare punct de urmărire succesiv
interval.

P #a #b - (#a,#b) au un LA între ele
C #ab #ae #bb #be - [#ab,#ae] se aliniază cu [#bb,#be]
D # - există # diferențe în LA
T #n - există #n intervale de puncte de urmărire pentru LA
(#d #y )^#n - există #d diferență care aliniază #y bp-urile lui B cu
următorul interval de dimensiune fixă ​​a lui A
+ X # - Suma totală de X (X = P sau T)
% X # - Cantitatea maximă de X în orice grămadă (X = P sau T)
@ T # - Numărul maxim de puncte de urmărire din orice urmă

Liniile cu 1 cod care încep cu +, % sau @ sunt întotdeauna primele linii din ieșire. ei
oferiți informații despre dimensiunea conținutului în ieșire. Mai exact, „+ X #” dă
numărul total de LA (X=P) sau numărul total de intervale de puncte de urmărire (X=T) din
fisierul . „% X #” oferă numărul maxim de LA (X=P) sau numărul maxim de puncte de urmărire
intervale (X=T) într-un dat teanc (colecție de LA-uri toate cu aceeași a-read (se aplică numai
la sortat În cele din urmă @ T # oferă numărul maxim de intervale de puncte de urmărire în orice urmă din interior
fișierul.

Utilizați LAdump online folosind serviciile onworks.net