mia-3dimagefilter - Online în cloud

PROGRAM:

NUME

mia-3dimagefilter - Filtrează imagini 3D.

REZUMAT

mia-3dimagefilter -i -o [Opțiuni]

DESCRIERE

mia-3dimagefilter Acest program este folosit pentru a filtra și converti imagini 3D în scala de gri.

OPŢIUNI

-i --in-file=(intrare, obligatorie); io
imaginile de intrare care urmează să fie filtrate Pentru tipurile de fișiere acceptate, vezi
PLUGINE: 3dimage/io

-o --out-file=(ieșire, obligatorie); io
Imaginile de ieșire care au fost filtrate Pentru tipurile de fișiere acceptate, vezi
PLUGINE: 3dimage/io

Ajutor & Informație
-V --verbose=avertisment
verbozitatea rezultatelor, mesaje tipărite de nivel dat și priorități mai mari.
Prioritățile acceptate începând de la cel mai de jos nivel sunt:
info ‐ Mesaje de nivel scăzut
urmări ‐ Urmărirea apelului de funcție
eşua ‐ Raportați eșecurile testelor
de avertizare - Avertizări
eroare - Raportează erori
depana - Ieșire de depanare
mesaj ‐ Mesaje normale
fatal ‐ Raportați numai erori fatale

--drepturi de autor
tipăriți informații despre drepturile de autor

-h --ajutor
imprimați acest ajutor

-? --utilizare
imprimați un scurt ajutor

--versiune
tipăriți numărul versiunii și ieșiți

Prelucrare
--fire=-1
Numărul maxim de fire de execuție de utilizat pentru procesare, acest număr ar trebui să fie mai mic
sau egal cu numărul de nuclee de procesor logic din mașină. (-1:
estimare automată). Numărul maxim de fire de execuție de utilizat pentru procesare, Aceasta
numărul trebuie să fie mai mic sau egal cu numărul de nuclee de procesor logic în
Mașina. (-1: estimare automată).

PLUG-URI: 1d/nucleu spațial

cdiff Se utilizează nucleul de filtru de diferență centrală, condițiile de limită în oglindă.

(fara parametri)

gauss nucleul filtrului spațial Gauss, parametrii acceptați sunt:

w = 1; uint în [0, inf)
jumătate din lățimea filtrului.

PLUG-URI: 1d/splinebc

oglindă Condiții la limită de interpolare spline care se oglindesc pe graniță

(fara parametri)

repeta Condiții la limită de interpolare spline care repetă valoarea la limită

(fara parametri)

zero Condiții la limită de interpolare spline care presupun zero pentru valorile din afara

(fara parametri)

PLUG-URI: 1d/splinekernel

bspline Crearea nucleului B-spline, parametrii acceptați sunt:

d = 3; int în [0, 5]
Gradul spline.

omoms Crearea nucleului OMoms-spline, parametrii acceptați sunt:

d = 3; int în [3, 3]
Gradul spline.

PLUG-URI: 3dimage/combinator

absdiff Combinator de imagini „absdiff”

(fara parametri)

adăuga Combinatorul de imagini „adăugați”

(fara parametri)

div Combinator de imagini „div”

(fara parametri)

mul Combinator de imagini „mul”

(fara parametri)

sub Combinator de imagini „sub”

(fara parametri)

PLUG-URI: imagine 3d/filtru

bandpass filtru trece-bandă de intensitate, parametrii acceptați sunt:

max = 3.40282e+38; pluti
maxim al benzii.

minute = 0; pluti
minim al benzii.

binariza filtrul de binarizare a imaginii, parametrii acceptați sunt:

max = 3.40282e+38; pluti
maximul intervalului acceptat.

minute = 0; pluti
minim de interval acceptat.

închide Parametrii de apropiere morfologici suportati sunt:

aluzie = negru; şir
un indiciu asupra conținutului imaginii principale (negru|alb).

forma = [sfera:r=2]; fabrică
element de structurare. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/shape

combiner Combinați două imagini cu operatorul combinator dat. dacă „reverse” este setat la
false, primul operator este imaginea trecută prin conducta filtrului și
a doua imagine este încărcată din fișierul dat cu parametrul 'image' the
în momentul în care filtrul este rulat, parametrii acceptați sunt:

imagine =(intrare, obligatoriu, șir)
a doua imagine care este necesară în combinator.

op =(obligatoriu, din fabrică)
Combinatorul de imagini care urmează să fie aplicat imaginilor. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: imagine 3d/combinator

inversa = 0; bool
inversează ordinea în care imaginile au trecut la combinator.

converti filtrul de conversie a formatului de pixeli ai imaginii, parametrii acceptați sunt:

a = 1; pluti
parametrul de conversie liniară a.

b = 0; pluti
parametrul de conversie liniară b.

Hartă = opta; dict
cartografierea conversiei. Valorile acceptate sunt:
opta ‐ aplicați o transformare liniară care mapează domeniul de intrare real la
întregul interval de ieșire
gamă ‐ aplicați transformarea liniară care mapează tipul de date de intrare
interval la intervalul de tip de date de ieșire
copiaţi ‐ copiați datele la conversie
liniar ‐ se aplică transformarea liniară x -> a*x+b
optstat ‐ aplicați o transformare liniară care se mapează pe baza mediei de intrare și
variație la întreaga gamă de ieșire

repn = ubyte; dict
tip de pixel de ieșire. Valorile acceptate sunt:
nici unul ‐ nu este definit niciun tip de pixel
pluti ‐ virgulă mobilă 32 de biți
sbyte ‐ semnat pe 8 biți
ulong ‐ nesemnat pe 64 de biți
dubla ‐ virgulă mobilă 64 de biți
Sint ‐ semnat pe 32 biți
scurt ‐ nesemnat pe 16 de biți
sscurt ‐ semnat pe 16 biți
int ‐ nesemnat pe 32 de biți
slong ‐ semnat pe 64 biți
pic ‐ date binare
ubyte ‐ nesemnat pe 8 de biți

cultură Decupați o regiune a unei imagini, regiunea este întotdeauna fixată la imaginea originală
dimensiunea în sensul că se păstrează intervalul dat., parametrii acceptați sunt:

capăt = [[4294967295,4294967295,4294967295]]; transmisibil în flux
sfârșitul intervalului de decupare, maxim = (-1,-1,-1).

Începe = [[0,0,0]]; transmisibil în flux
începutul intervalului de decupare.

delată Filtrul de dilatare a stivei de imagini 3D, parametrii acceptați sunt:

aluzie = negru; şir
un indiciu asupra conținutului imaginii principale (negru|alb).

forma = [sfera:r=2]; fabrică
element de structurare. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/shape

distanţă Evaluați transformarea la distanță 3D a unei imagini. Dacă imaginea este o mască binară,
atunci rezultatul transformării distanței în fiecare punct corespunde euclidianului
distanta pana la masca. Dacă imaginea de intrare are o valoare scalară a pixelului, atunci
acest scalar este interpretat ca câmp înălțime și valoarea per pixel se adaugă la
distanţă.

(fara parametri)

downscale Reducerea imaginii de intrare utilizând o dimensiune de bloc dată pentru a defini reducerea reducerii
factor. Înainte de scalare, imaginea este filtrată printr-un filtru de netezire la
eliminați datele de înaltă frecvență și evitați artefactele de aliasing., acceptat
parametrii sunt:

b = [[1,1,1]]; 3dbounds
dimensiunea blocului.

bx = 1; uint în [1, inf)
dimensiunea blocului în direcția x.

by = 1; uint în [1, inf)
dimensiunea blocului în direcția y.

bz = 1; uint în [1, inf)
dimensiunea blocului în direcția z.

nucleu = gauss; şir
nucleul filtrului de netezire care urmează să fie aplicat, dimensiunea filtrului este estimată
pe baza dimensiunii blocului..

eroda Filtrul de erodare a stivei de imagini 3D, parametrii acceptați sunt:

aluzie = negru; şir
un indiciu asupra conținutului imaginii principale (negru|alb).

forma = [sfera:r=2]; fabrică
element de structurare. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/shape

gauss filtru gauss 3D izotrop, parametrii acceptați sunt:

w = 1; int în [0, inf)
parametrul lățimii filtrului.

gradnorm Imagine 3D la filtru normal de gradient

(fara parametri)

masca de crestere Utilizați o mască binară de intrare și o imagine de referință în scară de gri pentru a face creșterea regiunii
prin adăugarea pixelilor de vecinătate ai unui pixel deja adăugat dacă au un pixel mai mic
intensitatea care este peste pragul dat., parametrii acceptați sunt:

minute = 1; pluti
pragul inferior pentru creșterea măștilor.

ref =(intrare, obligatoriu, șir)
imagine de referință pentru creșterea regiunii măști.

forma = 6n; fabrică
masca de cartier. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/shape

inversa filtru invers de intensitate

(fara parametri)

izovoxel Acest filtru scalează o imagine pentru a face ca dimensiunea voxelului să fie izometrică și dimensiunea acesteia la
corespund valorii date, parametrii acceptați sunt:

interp = [bspline:d=3]; fabrică
nucleul de interpolare care trebuie utilizat. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinekernel

mărimea = 1; plutește în (0, inf)
dimensiunea voxelului țintă izometrică.

kmans Filtru K-Means de imagine 3D. În imaginea de ieșire, valoarea pixelului reprezintă
apartenența la clasă și centrele de clasă sunt stocate ca atribut în imagine.,
parametrii acceptați sunt:

c = 3; int în [2, inf)
numărul de clase.

etichetă Un filtru pentru a eticheta componentele conectate ale unei imagini binare., acceptat
parametrii sunt:

n = 6n; fabrică
masca de cartier. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/shape

labelmap Filtru de imagine pentru a remapa ID-urile etichetelor. Se aplică numai imaginilor cu valori întregi
intensități/etichete., parametrii acceptați sunt:

Hartă =(intrare, obligatoriu, șir)
Etichetați fișierul de mapare.

scara de etichete
Un filtru care creează numai voxeli de ieșire care sunt deja creați în intrare
imagine. Scalare se face prin utilizarea unui algoritm de vot care selectează ținta
valoarea pixelilor bazată pe cel mai mare număr de pixeli dintr-o anumită etichetă din
regiunea sursă corespunzătoare. Dacă regiunea cuprinde două etichete cu aceeași
count, cel cu numărul mai mic câștigă., parametrii acceptați sunt:

exagerat =(obligatoriu, 3dbounds)
dimensiunea țintă dată ca două valori separate de coma.

încărca Încărcați imaginea de intrare dintr-un fișier și utilizați-o pentru a înlocui imaginea curentă în fișierul
pipeline., parametrii acceptați sunt:

fişier =(intrare, obligatoriu, șir)
numele fișierului de intrare de încărcat din...

lvdownscale
Acesta este un filtru de reducere a votului de etichetă. Reduce o imagine 3D prin blocuri.
Pentru fiecare bloc eticheta (diferită de zero) care apare de cele mai multe ori în bloc este
emis ca pixel de ieșire în imaginea țintă. Dacă două etichete apar același număr
de ori, cel cu valoarea absolută mai mică câștigă., parametrii acceptați sunt:

b = [[1,1,1]]; 3dbounds
blocksize pentru reducere. Fiecare bloc va fi reprezentat de un pixel
in imaginea tinta..

masca Mascați o imagine, o imagine este luată din lista de parametri și cealaltă din
intrarea normală a filtrului. Ambele imagini trebuie să aibă aceleași dimensiuni și una trebuie
fi binar. Atributele imaginii care vine prin conducta filtrului sunt
conservate. Tipul de pixel de ieșire corespunde imaginii de intrare care nu este
binary., parametrii acceptați sunt:

intrare =(intrare, obligatoriu, șir)
al doilea nume de fișier imagine de intrare.

însemna Filtrul mediu al imaginii 3D, parametrii acceptați sunt:

w = 1; int în [1, inf)
jumătate din lățimea filtrului.

mediană filtru median 3d, parametrii acceptați sunt:

w = 1; int în [1, inf)
parametrul lățimii filtrului.

MLV Filtrul de imagine 3D pentru media variației minime, parametrii acceptați sunt:

w = 1; int în [1, inf)
parametrul lățimii filtrului.

msnormalizer
Filtru de normalizare medie-sigma a imaginii 3D, parametrii acceptați sunt:

w = 1; int în [1, inf)
jumătate din lățimea filtrului.

deschide parametrii morfologici deschisi, suportati sunt:

aluzie = negru; şir
un indiciu asupra conținutului imaginii principale (negru|alb).

forma = [sfera:r=2]; fabrică
element de structurare. Pentru pluginuri acceptate, consultați PLUGINS:3dimage/shape

reorientează Filtrul de reorientare a imaginii 3D, parametrii acceptați sunt:

Hartă = xyz; dict
cartografierea de orientare care urmează să fie aplicată. Valorile acceptate sunt:
p-zxy ‐ permută x->y->z->x
r-x180 ‐ rotiți în jurul axei x în sensul acelor de ceasornic la 180 de grade
xyz ‐ păstrează orientarea
p-yzx ‐ permută x->z->y->x
r-z180 ‐ rotiți în jurul axei z în sensul acelor de ceasornic la 180 de grade
r-y270 ‐ rotiți în jurul axei y în sensul acelor de ceasornic la 270 de grade
f-xz ‐ flip xz
f-yz ‐ flip yz
r-x90 ‐ rotiți în jurul axei x în sensul acelor de ceasornic la 90 de grade
r-y90 ‐ rotiți în jurul axei y în sensul acelor de ceasornic la 90 de grade
r-x270 ‐ rotiți în jurul axei x în sensul acelor de ceasornic la 270 de grade
r-z270 ‐ rotiți în jurul axei z în sensul acelor de ceasornic la 270 de grade
r-z90 ‐ rotiți în jurul axei z în sensul acelor de ceasornic la 90 de grade
f-xy ‐ flip xy
r-y180 ‐ rotiți în jurul axei y în sensul acelor de ceasornic la 180 de grade

redimensiona Redimensionați o imagine. Datele originale sunt centrate în noua imagine de dimensiune.,
parametrii acceptați sunt:

mărimea = [[0,0,0]]; transmisibil în flux
dimensiune nouă a imaginii o dimensiune 0 indică pentru a păstra dimensiunea pentru
dimensiunea corespunzatoare..

sandp Filtru 3d de sare și piper, parametrii acceptați sunt:

treieră = 100; plutește în [0, inf)
valoarea pragului.

w = 1; int în [1, inf)
parametrul lățimii filtrului.

scară Filtru de imagine 3D care se scalează la o dimensiune țintă dată, parametrii acceptați sunt:

interp = [bspline:d=3]; fabrică
nucleul de interpolare care trebuie utilizat. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/splinekernel

s = [[0,0,0]]; 3dbounds
dimensiunea țintă pentru a seta toate componentele simultan (componenta 0: utilizați imaginea de intrare
mărimea).

sx = 0; uint în [0, inf)
dimensiunea țintă în direcția x (0: utilizați dimensiunea imaginii de intrare).

sy = 0; uint în [0, inf)
dimensiunea țintă în direcția y (0: utilizați dimensiunea imaginii de intrare).

sz = 0; uint în [0, inf)
dimensiunea țintă în direcția y (0: utilizați dimensiunea imaginii de intrare).

selectbig Un filtru care creează o mască binară reprezentând intensitatea cu cea mai mare
pixel count.Valoarea pixelului 0 va fi ignorată, iar dacă două intensități au
același număr de pixeli, atunci rezultatul este nedefinit. Pixelul de intrare trebuie să aibă un
tip de pixel integral.

(fara parametri)

sepconv Filtru de convoluție separat pentru intensitatea imaginii 3D, parametrii acceptați sunt:

kx = [gauss:w=1]; fabrică
nucleul de filtrare în direcția x. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/spacialkernel

ky = [gauss:w=1]; fabrică
nucleul de filtrare în direcția y. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/spacialkernel

kz = [gauss:w=1]; fabrică
nucleul de filtrare în direcția z. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: 1d/spacialkernel

saw cap de apă însămânțat. Algoritmul extrage exact atât de multe regiuni ca inițial
etichetele sunt date în imaginea semințelor., parametrii acceptați sunt:

grad = 0; bool
Interpretați imaginea de intrare ca gradient. .

marca = 0; bool
Marcați bazinele hidrografice segmentate cu o valoare specială de scară de gri.

n = [sfera:r=1]; fabrică
Cartier pentru regiunea Watershead în creștere. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: imagine/formă 3d

sămânţă =(intrare, obligatoriu, șir)
imagine de intrare semințe care conține etichetele pentru regiunile inițiale.

reper Salvați imaginea de intrare într-un fișier și, de asemenea, treceți-o la următorul filtru,
parametrii acceptați sunt:

fişier =(ieșire, necesar, șir)
numele fișierului de ieșire pentru a salva și imaginea..

subțierea Subțierea morfologică 3D, bazată pe: Lee și Kashyap, „Building Skeleton Models”
prin intermediul algoritmilor de subțiere a suprafeței mediale/axelor 3-D, modele grafice și imagine
Prelucrarea, 56(6):462-478, 1994. Această implementare acceptă doar 26
Cartier.

(fara parametri)

transforma Transformați imaginea de intrare cu transformarea dată., parametrii acceptați
sunt:

fişier =(intrare, obligatoriu, șir)
Numele fișierului care conține transformarea..

imgboundary = ; şir
suprascrie condițiile de limită de interpolare a imaginii.

imgkernel = ; şir
suprascrie nucleul interpolatorului de imagini.

dezacord Filtrul de variație a imaginii 3D, parametrii acceptați sunt:

w = 1; int în [1, inf)
jumătate din lățimea filtrului.

ws Segmentarea de bază a capului de apă, parametrii acceptați sunt:

evalgrad = 0; bool
Setați la 1 dacă imaginea de intrare nu reprezintă o imagine normală cu gradient.

marca = 0; bool
Marcați bazinele hidrografice segmentate cu o valoare specială de scară de gri.

n = [sfera:r=1]; fabrică
Cartier pentru regiunea Watershead în creștere. Pentru pluginuri acceptate, consultați
PLUGINE: imagine/formă 3d

treieră = 0; plutește în [0, 1)
Pragul de normă de gradient relativ. Valoarea pragului valorii reale este
thresh * (max_grad - min_grad) + min_grad. Bazine separate prin gradienți
cu o normă inferioară se vor alătura.

PLUG-URI: 3dimage/io

analiza Analizați imaginea 7.5

Extensii de fișiere recunoscute: .HDR, .hdr

Tipuri de elemente acceptate:
8 biți nesemnat, 16 biți semnat, 32 de biți semnat, 32 de biți în virgulă mobilă,
virgulă mobilă 64 de biți

pool de date IO virtuală către și de la pool-ul de date intern

Extensii de fișiere recunoscute: .@

dicom Seria de imagini Dicom ca 3D

Extensii de fișiere recunoscute: .DCM, .dcm

Tipuri de elemente acceptate:
semnat pe 16 biți, nesemnat pe 16 biți

hdf5 HDF5 3D imagine IO

Extensii de fișiere recunoscute: .H5, .h5

Tipuri de elemente acceptate:
date binare, semnate pe 8 biți, nesemnate pe 8 biți, semnate pe 16 biți, nesemnate pe 16 biți,
semnat pe 32 de biți, nesemnat pe 32 de biți, semnat pe 64 de biți, nesemnat pe 64 de biți, flotant
punct 32 de biți, virgulă mobilă 64 de biți

inria Imaginea INRIA

Extensii de fișiere recunoscute: .INR, .inr

Tipuri de elemente acceptate:
semnat 8 biți, nesemnat 8 biți, semnat 16 biți, nesemnat 16 biți, semnat 32
bit, 32 de biți fără semn, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64 de biți

mhd MetaIO 3D imagine IO folosind implementarea VTK (experimental).

Extensii de fișiere recunoscute: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Tipuri de elemente acceptate:
semnat 8 biți, nesemnat 8 biți, semnat 16 biți, nesemnat 16 biți, semnat 32
bit, 32 de biți fără semn, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64 de biți

nifti Imagine 1D NIFTI-3 IO

Extensii de fișiere recunoscute: .NII, .nii

Tipuri de elemente acceptate:
semnat 8 biți, nesemnat 8 biți, semnat 16 biți, nesemnat 16 biți, semnat 32
bit, nesemnat pe 32 de biți, semnat pe 64 de biți, fără semn pe 64 de biți, virgulă mobilă 32
bit, virgulă mobilă 64 de biți

vff Format raster VFF Sun

Extensii de fișiere recunoscute: .VFF, .vff

Tipuri de elemente acceptate:
nesemnat pe 8 biți, semnat pe 16 biți

vista Vizualizare 3D

Extensii de fișiere recunoscute: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipuri de elemente acceptate:
date binare, semnate pe 8 biți, nesemnate pe 8 biți, semnate pe 16 biți, nesemnate pe 16 biți,
semnat pe 32 de biți, nesemnat pe 32 de biți, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64
pic

VTI Imagine 3D VTK-XML de intrare și de ieșire (experimental).

Extensii de fișiere recunoscute: .VTI, .vti

Tipuri de elemente acceptate:
semnat 8 biți, nesemnat 8 biți, semnat 16 biți, nesemnat 16 biți, semnat 32
bit, 32 de biți fără semn, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64 de biți

vtk Moștenire de intrare și de ieșire a imaginii 3D VTK (experimental).

Extensii de fișiere recunoscute: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Tipuri de elemente acceptate:
date binare, semnate pe 8 biți, nesemnate pe 8 biți, semnate pe 16 biți, nesemnate pe 16 biți,
semnat pe 32 de biți, nesemnat pe 32 de biți, virgulă mobilă 32 de biți, virgulă mobilă 64
pic

PLUG-URI: Imagine 3d/formă

18n Creator de forme 18D de cartier 3n

(fara parametri)

26n Creator de forme 26D de cartier 3n

(fara parametri)

6n Creator de forme 6D de cartier 3n

(fara parametri)

sferă Vecinătate de formă sferică închisă, inclusiv pixelii dintr-o rază dată
r., parametrii acceptați sunt:

r = 2; plutește în (0, inf)
raza sferei.

PLUG-URI: 3dtransform/io

bBS I/uri serializate binare (neportabile) ale transformărilor 3D

Extensii de fișiere recunoscute: .bbs

pool de date IO virtuală către și de la pool-ul de date intern

Extensii de fișiere recunoscute: .@

vista Stocarea Vista a transformărilor 3D

Extensii de fișiere recunoscute: .v, .v3dt

xml IO serializat XML a transformărilor 3D

Extensii de fișiere recunoscute: .x3dt

EXEMPLU

Rulați un filtru de variație medie pe input.v, apoi rulați o clasificare k-means cu 5 clase
și binarizați selectând clasa a 4-a.

mia-3dimagefilter -i image.v -o filtered.v mlv:w=2 kmeans:c=5 binarize:min=4,max=4

AUTOR(i)

Gert Wollny

DREPTURI DE AUTOR

Acest software este Copyright (c) 1999‐2015 Leipzig, Germania și Madrid, Spania. Este vorba
FĂRĂ ABSOLUT NU GARANȚIE și o puteți redistribui conform termenilor GNU
LICENȚĂ PUBLICĂ GENERALĂ Versiunea 3 (sau ulterioară). Pentru mai multe informații rulați programul cu
opțiunea „--copyright”.

Utilizați mia-3dimagefilter online folosind serviciile onworks.net