Aceasta este aplicația Linux numită BiomeNet, care rulează în Linux online, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca BiomeNet.zip. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită BiomeNet pentru a rula în Linux online cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
BiomeNet să ruleze online în Linux
Ad
DESCRIERE
Metagenomica produce un număr enorm de secvențe microbiene cărora li se poate atribui o funcție metabolică. Utilizarea unor astfel de date pentru a deduce divergența metabolică la nivel de comunitate este împiedicată de lipsa unui cadru statistic adecvat. Aici, descriem un nou model bayesian ierarhic, numit BiomeNet (inferența bayesiană a rețelelor metabolice), pentru a deduce prevalența diferențială a rețelelor metabolice între comunitățile microbiene. Pentru a deduce structura interacțiunilor metabolice la nivel de comunitate, BiomeNet aplică un cadru de modelare mixt de membri la informațiile despre abundența enzimelor. Ideea de bază este că componentele de amestec ale modelului (reacții metabolice, subrețele și rețele) sunt partajate în toate grupurile (probe de microbiom), dar proporțiile amestecului variază de la grup la grup. Prin acest cadru, modelul poate captura structuri imbricate în cadrul datelor. BiomeNet este unic în modelarea fiecărei probe de metagenom ca un amestec de sisteme metabolice complexe (metabosisteme).Public
Știință/Cercetare
Limbaj de programare
C++, S/R
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/biomenet/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
