Aceasta este aplicația Linux numită CAMPARI, care rulează în Linux online, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca campari_v3_09052017.zip. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită CAMPARI pentru a rula în Linux online cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
CAMPARI să ruleze online în Linux
Ad
DESCRIERE
Suntem mândri să introducem versiunea 3 a CAMPARI. Acesta este un pas important față de versiunea 2, în primul rând datorită suportului complet OpenMP (paralelismul firelor de executie) și datorită îmbunătățirilor semnificative atât în ceea ce privește gradul de utilizare, cât și performanța. De asemenea, am adăugat din nou o serie de algoritmi noi din literatura recentă și, desigur, CAMPARI continuă să susțină paradigma câmpului de forță ABSINTH și modelul de solvație implicită.CAMPARI este un pachet comun pentru efectuarea și analizarea simulărilor moleculare, în special a polimerilor cu relevanță biologică. Se concentrează pe o disponibilitate largă de algoritmi pentru eșantionarea (avansată) și este capabil să combine Monte Carlo și eșantionarea dinamică moleculară într-un mod perfect. CAMPARI oferă utilizatorului un nivel foarte ridicat de control asupra tuturor caracteristicilor implementate. Pentru mai multe informații și caracteristici, vă rugăm să consultați pagina de start a proiectului la http://campari.sourceforge.net. Versiunea 2 nu mai este menținută activ, dar versiunea finală continuă să fie disponibilă.
Categorii
- Eșantionare combinată MC și MD, MD în spațiu cartezian sau torsiune / rigid-corp
- Paralelizarea eficientă OpenMP a tuturor rutinelor de bază energie/forță
- Analiză sau execuție din mers ca instrument de analiză a traiectoriei (și în paralel)
- Multe rutine de analiză încorporate (DSSP, hărți de contact, funcții de corelare a perechilor etc.)
- Suport pentru mai multe grupări structurale și algoritmi aferenti, împreună cu analizele modelului de stare Markov
- Complet documentat (html) și, în plus, livrat cu 13 tutoriale
- Nivel foarte ridicat de control (de exemplu, constrângeri holonomice personalizate în MD)
- Suport larg pentru tehnicile de simulare multi-replica în paralel, cum ar fi schimbul de replici în execuția paralelă hibridă MPI/OpenMP
- Facilitate de analiză de sine stătătoare pentru facilitățile de clustering/model de stat Markov
Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Consolă/Terminal
Limbaj de programare
Fortran
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/campari/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
