Aceasta este aplicația Linux numită CUSHAW3: Accurate Short-read Alignment, care rulează în Linux online, a cărei cea mai recentă versiune poate fi descărcată ca cushaw3-v3.0.3.tar.bz2. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită CUSHAW3: Accurate Short-read Alignment pentru a rula în Linux online cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
CUSHAW3: Aliniere precisă cu citire scurtă pentru a rula online în Linux
Ad
DESCRIERE
CUSHAW3 este un dispozitiv de aliniere cu citire scurtă, paralelizat, sensibil și precis. Acest dispozitiv de aliniere propune o abordare generală pentru alinierea corectă atât a citirilor ușoare, cât și a celor dificile la genomi mari, cum ar fi genomul uman. Efectuați o evaluare a calității reale a alinierii care CUSHAW3 depășește în mod constant CUSHAW2, BWA-MEM, Bowtie2 și GEM în ceea ce privește alinierea cu un singur capăt și cu un capăt pereche. În plus, alignerul nostru a demonstrat o performanță mai bună de aliniere la capătul pereche decât Novalign3 pentru citiri scurte cu rate de eroare ridicate.Interfața cu utilizatorul
Consolă/Terminal
Limbaj de programare
C ++
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/cushaw3/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
