Aceasta este aplicația Linux numită DACO-algorithm a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca JDACO_1.03.zip. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită DACO-algorithm cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
DACO-algoritm
DESCRIERE
Expresia genelor eucariote este controlată prin circuite logice moleculare care combină semnale de reglare a multor factori diferiți. Complexarea factorilor de transcripție și a altor proteine de reglare este un mecanism predominant și foarte conservat de integrare a semnalului în căile de reglare critice și permite deducerea genelor controlate, precum și a mecanismului de reglare exercitat.
Am dezvoltat DACO (domain-aware cohesiveness optimization), un algoritm nou care combină rețelele de interacțiune proteină-proteină și rețelele de interacțiune domeniu-domeniu cu coeziunea metrică de calitate cluster. Metrica este maximizată local la nivelul holistic al interacțiunilor proteinelor, în timp ce constrângerile sofisticate de conectivitate la nivel de domeniu sunt utilizate pentru a explica natura exclusivă și, prin urmare, inerent combinatorie a interacțiunilor din cadrul unor astfel de ansambluri.
Publicația originală poate fi găsită pe http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/30/17/i415 .
Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Consolă/Terminal
Limbaj de programare
Python, Java
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/dacoalgorithm/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.