Aceasta este aplicația Linux numită dataMAPPs care rulează în Linux online, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca dataMAPPs_3.2.7.zip. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită dataMAPPs pentru a rula în Linux online cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
dataMAPP-urile să ruleze online în Linux
DESCRIERE
dataMAPPs permite procesarea de rutină și eficientă a datelor din studiile de imunogenitate, aplicând tehnologia peptidomică MAPPs pentru a detecta epitopii potențiali MHCI- sau MHC-II, așa cum sunt prezentați de celulele dendritice (DC).Dispune de controlul calității datelor brute, normalizarea între eșantion/donatori și vizualizarea rezultatelor într-un stil de hărți termice (heatMAPPs). Nucleul dataMAPPs este o bibliotecă R generică care poate fi adaptată la proiecte specifice prin intermediul scripturilor de control dedicate, care permit, de asemenea, recalcularea reproductibilă a rezultatelor.
Consultați fișierul README pentru instrucțiuni de instalare și utilizare. Documentația suplimentară este furnizată în format PDF.
dataMAPPs este publicat sub licență GPL de o echipă de oameni de știință care lucrează pentru Hoffmann-La Roche AG din Basel, Elveția. Software-ul este furnizat ca atare, pentru a beneficia, sperăm, alți cercetători.
Publicare în pregătire:
Steiner și colab., „Activarea Proteomicelor Peptidelor Asociate MHC-II de rutină (MAPPs) pentru evaluarea riscului imunogenității induse de medicamente”
Categorii
- import de date peptidomice (ieșire PEAKS, dar poate fi extins)
- QC a datelor extinse și excluderea eșantionului prin limite definibile de utilizator
- procedură de normalizare dedicată în 2 pași pentru datele MAPP
- cartografierea peptidelor la anticorpul/proteina țintă
- gruparea pozițiilor de cartografiere a peptidelor în regiunile epitopului hotspot
- vizualizarea rezultatelor cartografierii ca hărți termice
Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Consolă/Terminal
Limbaj de programare
S / R
Mediul bazei de date
Fișier plat
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/datamapps/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
