Aceasta este aplicația Linux numită HMCan a cărei cea mai recentă versiune poate fi descărcată ca HMCan.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul gratuit de găzduire OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită HMCan cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
HMCan
Ad
DESCRIERE
HMCan este un instrument bazat pe modelul Markov ascuns, care este dezvoltat pentru a detecta modificarea histonelor în datele ChIP-seq ale cancerului. Acesta aplică trei pași de corecție datelor: corecția numărului de copiere, corecția părtinirii GC și corecția nivelului de zgomot.
Pentru a rula HMCan, este nevoie de fișierul de aliniere țintă ChIP-seq și fișierul de aliniere de control. Sunt necesare, de asemenea, unele configurații, pentru mai multe informații vă rugăm să verificați fișierul README.
Autor: Haitham Ashoor
Contact: Institutul Valentina Boeva Curie
Universitatea de Știință și Tehnologie Haitham Ashoor King Abdullah.
Limbaj de programare
C ++
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/hmcan/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
