Aceasta este aplicația Linux numită MANTI.pl / muda.pl a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca muda.pl-v3.2.zip. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită MANTI.pl / muda.pl cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
MANTI.pl / muda.pl
DESCRIERE
-------- ATENȚIE START: REDENUMIRE
muda.pl a fost redenumit MANTI.pl cu v3.7, dezvoltarea proiectului poate fi urmărită pe pagina proiectului MANTI pe sourceforge.net. Versiunile vechi rămân aici în scopuri de arhivă.
-------- ATENȚIE sfârșitul
muda.pl este un script de evaluare (scris în Perl) fără dependențe mari.
Acesta reunește informații din 4 fișiere diferite de ieșire MaxQuant într-un fișier principal adecvat explicit pentru analizele de proteine neo-terminale. Ancora centrală pentru congregația de date este fișierul modificationSpecificPeptides.txt - date suplimentare sunt deduse din diferite alte fișiere sursă din folderul MaxQuant txt, dar punctul de pornire pentru asamblarea datelor este doar fișierul modificationSpecificPeptides.txt. Poate util și în scopuri proteomice normale, dar acest script este puternic optimizat pentru identificarea și validarea proteinelor neo-terminale.
Pentru o explicație mai detaliată a parametrilor scriptului și a strategiei de evaluare, vă rugăm să consultați manualul extensiv PDF.
DESCRIERE
- Evaluarea datelor MaxQuant
- Identificarea și validarea Protein-Termini
- Adnotare și asamblare a datelor UniProt
- Re-cartografierea Termini-urilor identificate la izoforme
- Integrare Limma, LOCALIZER și TopFINDer
- Bine documentat
Public
Știință/Cercetare
Interfața cu utilizatorul
Linie de comanda
Limbaj de programare
Perl
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/muda/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
