Aceasta este aplicația Linux numită misc genomics tools a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca misc_genomics_tools_v0.2.zip. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită diverse instrumente genomice cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
diverse instrumente genomice
DESCRIERE
Aceasta este o colecție de diverse programe dezvoltate în cursul unui proiect de genomică, care implică tulpina Pseudomonas NCIMB10586
Acestea includ
* identificarea și corectarea erorilor într-o (de exemplu) secvența genomului pacbio folosind citiri iluminate
* adnotare secvență procariotă/genom
* Analiza RNAseq - normalizarea și asamblarea mai multor probe ca grup
* Vizualizare RNAseq
Toate scripturile sunt furnizate pe baza „cele mai bune eforturi”, cu toate acestea, din cauza diferitelor modificări ale sistemului, nu garantez că toate fișierele sunt versiunea utilizată în analiză.
De asemenea, vă rugăm să rețineți că acestea au fost foarte dezvoltate având în vedere oportunitatea - adică procesul era de așteptat să fie efectuat în forma sa finală o singură dată; s-a acordat puțină atenție optimizării timpului de execuție sau înlănțuirii scripturilor și uneori resursele externe sunt accesate manual.
Categorii
- Corectarea erorii secvenței genomului
- Adnotarea secvenței procariote
- Normalizarea ARNseq a mai multor probe ca grup
- Seria de mostre RNAseq/vizualizarea cursului de timp
Public
Știință/Cercetare
Limbaj de programare
Perl
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/misc-genomics-tools/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
