Aceasta este aplicația Linux numită SOAPdenovo2 a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca SOAPdenovo2-src-r240.tgz. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită SOAPdenovo2 cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SOAPdenovo2
Ad
DESCRIERE
Ce urmează cu SOAPdenovo2:
MEGAHIT este succesorul formal al SOAPdenovo2
MEGAHIT: O soluție ultra-rapidă cu un singur nod pentru asamblarea metagenomică mare și complexă prin graficul de Bruijn succint
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25609793
https://github.com/voutcn/megahit
Cel mai recent cod pe GitHub:
https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2
SOAPdenovo este o nouă metodă de asamblare cu citire scurtă care poate construi un ansamblu schiță de novo pentru genomi de dimensiune umană. Programul este special conceput pentru a asambla citirile scurte Illumina. Acesta creează noi oportunități pentru construirea de secvențe de referință și efectuarea de analize precise ale genomilor neexplorați într-un mod rentabil. SOAPdenovo2 este succesorul SOAPdenovo. Citați lucrarea publicată în GigaScience (vezi site-ul mai jos) dacă doriți să citați SOAPdenovo2.
Public
Știință/Cercetare, Dezvoltatori
Interfața cu utilizatorul
Linie de comanda
Limbaj de programare
C++, C
Mediul bazei de date
Fișier plat
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.