Aceasta este aplicația Linux numită Virmid, a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca Virmid-1.2.0.tar.gz. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită Virmid cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți emulatorul online OnWorks Linux sau Windows online sau emulatorul online MACOS de pe acest site web.
- 5. Din sistemul de operare OnWorks Linux pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația, instalați-o și rulați-o.
SCREENSHOTS
Ad
Virmid
DESCRIERE
NOUTATI:
11-07-2013 O nouă versiune Virmid 1.1.0 a fost încărcată.
08-29-2013 Lucrarea Virmid este acum publicată în Genome Biology.
Kim S și colab., „Virmid: accurate detection of somatic mutations with sample impurity inference”, Genome Biology 2013, 14:R90
http://genomebiology.com/2013/14/8/R90/abstract
Virmid (Virtual Microdissection for SNP calling) este o variantă de apelant bazată pe Java, concepută pentru probele potrivite pentru controlul bolii. Virmid este, de asemenea, specializat în identificarea potențialului în cadrul contaminării individuale în cazul în care proba de boală nu poate fi suficient purificată. În timp ce rata de apelare SNP este grav compromisă cu această eterogenitate, Virmid poate descoperi SNP-uri cu frecvență scăzută de alele, luând în considerare nivelul de contaminare (alfa). Caracteristicile importante ale Virmid sunt:
• Estimarea proporției exacte a probei de control într-o probă de boală (mixtă).
• SNP îmbunătățit și apelarea mutației somatice în ceea ce privește proporția estimată
DESCRIERE
- Descoperirea mutației somatice
- Inferență de impurități ale mostrei
Public
Știință/Cercetare
Limbaj de programare
Java
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/virmid/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
