Aceasta este aplicația Windows numită Gen3D a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca gen3d.cpp. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită Gen3D cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți orice emulator online OS OnWorks de pe acest site, dar mai bun emulator online Windows.
- 5. Din sistemul de operare Windows OnWorks pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația și instalați-o.
- 7. Descărcați Wine din depozitele de software ale distribuțiilor Linux. Odată instalat, puteți apoi să faceți dublu clic pe aplicație pentru a le rula cu Wine. De asemenea, puteți încerca PlayOnLinux, o interfață elegantă peste Wine, care vă va ajuta să instalați programe și jocuri populare Windows.
Wine este o modalitate de a rula software-ul Windows pe Linux, dar fără a fi necesar Windows. Wine este un strat de compatibilitate Windows open-source care poate rula programe Windows direct pe orice desktop Linux. În esență, Wine încearcă să reimplementeze suficient Windows de la zero, astfel încât să poată rula toate acele aplicații Windows fără a avea nevoie efectiv de Windows.
SCREENSHOTS
Ad
Gen3D
DESCRIERE
Gen3D este o aplicație concepută pentru a determina modele tridimensionale de genom și cromozomi. Utilizează datele de contact cromozomiale pentru a construi conformații tridimensionale. Această metodă poate genera modele cromozomiale tridimensionale satisfăcând o mare parte a contactelor cromozomiale.
Software-ul este dezvoltat în Laboratorul de Bioinformatică, Mining de Date și Învățare Mașină al Prof. Jianlin Cheng din Departamentul de Informatică de la Universitatea din Missouri - Columbia, SUA. Proiectul este susținut de Fundația Națională de Știință (grant nr. DBI1149224).
Dacă utilizați Gen3D în cercetarea dvs., vă rugăm să citați:
Nowotny, Jackson, Sharif Ahmed, Lingfei Xu, Oluwatosin Oluwadare, Hannah Chen, Noelan Hensley, Tuan Trieu, Renzhi Cao și Jianlin Cheng. „Reconstituirea iterativă a modelelor tridimensionale ale cromozomilor umani din datele de contact cromozomiale”. BMC bioinformatica 16, nr. 1 (2015): 338.
DESCRIERE
- Utilizați datele de contact cromozomiale obținute prin tehnica Hi-C
- Construiți genom structural 3D și modele cromozomiale din datele de contact cromozomiale
- Inițializați coordonatele folosind abordarea probabilistică
- Metodă nouă pentru a reprezenta contactele satisfăcute în matricea hărții termice
- Scheme de notare pentru a descoperi contacte pe distanță lungă și scurtă
- În comparație cu alte metode existente și, de asemenea, validată cu caracteristicile genomului
Public
Știință/Cercetare, Inginerie
Limbaj de programare
C ++
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/gen3d/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.