Aceasta este aplicația Windows numită TomoJ a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca TomoJ_Applications-2.8.1-jar-with-dependencies.jar. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită TomoJ cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți orice emulator online OS OnWorks de pe acest site, dar mai bun emulator online Windows.
- 5. Din sistemul de operare Windows OnWorks pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația și instalați-o.
- 7. Descărcați Wine din depozitele de software ale distribuțiilor Linux. Odată instalat, puteți apoi să faceți dublu clic pe aplicație pentru a le rula cu Wine. De asemenea, puteți încerca PlayOnLinux, o interfață elegantă peste Wine, care vă va ajuta să instalați programe și jocuri populare Windows.
Wine este o modalitate de a rula software-ul Windows pe Linux, dar fără a fi necesar Windows. Wine este un strat de compatibilitate Windows open-source care poate rula programe Windows direct pe orice desktop Linux. În esență, Wine încearcă să reimplementeze suficient Windows de la zero, astfel încât să poată rula toate acele aplicații Windows fără a avea nevoie efectiv de Windows.
TomoJ
Ad
DESCRIERE
TomoJ este un plugin ImageJ pentru reconstrucția tomografică.
A fost conceput pentru tomografia electronică, totuși orice achiziție cu fascicul paralel ar trebui să funcționeze.
TomoJ propune preprocesarea și înregistrarea seriei tilt înainte de reconstrucțiile 3D (WBP, ART, SIRT, OS-SART, comprimat sensing).
TomoJ este scris în Java, calculele sunt multithreaded și reconstrucția poate fi efectuată pe CPU sau GPU (OpenCL).
înregistrarea este descrisă în:
Journal of Structural Biology: X. 2020, Volumul 4. „Îmbunătățiri ale alinierii imaginilor fără markeri pentru tomografia electronică” COS Sorzano și colab. https://doi.org/10.1016/j.yjsbx.2020.100037.
BMC Bioinformatica. 2009 aprilie 27;10:124."Înregistrarea imaginii fără markeri a seriei de înclinare a tomografiei electronice." COS Sorzano et al.
Partea de reconstrucție a fost descrisă în:
BMC Bioinformatica. 2007 august 6;8:288. „TomoJ: software de tomografie pentru reconstrucția tridimensională în microscopia electronică cu transmisie.” Messaoudi C și colab.
DESCRIERE
- tomografia
- ImagineJ
- Aliniere în serie de înclinare
- Reconstrucție 3D
- WBP
- ART
- SIRT
- detectarea comprimată
Interfața cu utilizatorul
Java Swing
Limbaj de programare
Java, OpenCL
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/tomoj/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.