Aceasta este aplicația Windows numită UniPyRange a cărei ultimă versiune poate fi descărcată ca UniPyRangeSuite.py. Poate fi rulat online în furnizorul de găzduire gratuit OnWorks pentru stații de lucru.
Descărcați și rulați online această aplicație numită UniPyRange cu OnWorks gratuit.
Urmați aceste instrucțiuni pentru a rula această aplicație:
- 1. Ați descărcat această aplicație pe computer.
- 2. Introduceți în managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator pe care îl doriți.
- 3. Încărcați această aplicație într-un astfel de manager de fișiere.
- 4. Porniți orice emulator online OS OnWorks de pe acest site, dar mai bun emulator online Windows.
- 5. Din sistemul de operare Windows OnWorks pe care tocmai l-ați pornit, accesați managerul nostru de fișiere https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX cu numele de utilizator dorit.
- 6. Descărcați aplicația și instalați-o.
- 7. Descărcați Wine din depozitele de software ale distribuțiilor Linux. Odată instalat, puteți apoi să faceți dublu clic pe aplicație pentru a le rula cu Wine. De asemenea, puteți încerca PlayOnLinux, o interfață elegantă peste Wine, care vă va ajuta să instalați programe și jocuri populare Windows.
Wine este o modalitate de a rula software-ul Windows pe Linux, dar fără a fi necesar Windows. Wine este un strat de compatibilitate Windows open-source care poate rula programe Windows direct pe orice desktop Linux. În esență, Wine încearcă să reimplementeze suficient Windows de la zero, astfel încât să poată rula toate acele aplicații Windows fără a avea nevoie efectiv de Windows.
SCREENSHOTS
Ad
UniPyRange
DESCRIERE
Script python foarte simplu, care vă scutește de durerile de a număra aminoacizii/bazele ADN în fișierele fasta din baza de date Uniprot și NCBI RefSeq (1, 2).
Să presupunem că doriți secvența de aminoacizi din intervalul 128-387 de la o proteină de 1000 de aminoacizi - acest script vă va ajuta să evitați greșelile de numărare, arătându-vă doar secvența specificată în aminoacizi și codând perechile de baze ADN (ideal pentru proiectarea primerului de amplificare). ) a unui ID Uniprot specificat.
- Necesită BioPython (3) și Pachetul Bioservices (4)
(1)
Consorțiul UniProt
UniProt: un hub pentru informații despre proteine
Acizi nucleici Res. 43: D204-D212 (2015).
(2)
RefSeq: o actualizare privind secvențele de referință de mamifere. Acizi nucleici Res. 2014 ian 1;42(1):D756-63.
(3)
Cock PJ și colab. Bioinformatică (2009)
(4)
Cokelaer și colab., Bioinformatică (2013)
Limbaj de programare
Piton
Categorii
Aceasta este o aplicație care poate fi preluată și de la https://sourceforge.net/projects/unipyrange/. A fost găzduit în OnWorks pentru a fi rulat online într-un mod cât mai ușor de pe unul dintre sistemele noastre operative gratuite.
