Это команда barrnap, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
barrnap - быстрое предсказание рибосомальной РНК
СИНТАКСИС
barrnap [варианты]
ОПИСАНИЕ
Баррнап предсказывает расположение генов рибосомной РНК в геномах. Поддерживает бактерии
(5S, 23S, 16S), археи (5S, 5.8S, 23S, 16S), митохондрии (12S, 16S) и эукариоты
(5S, 5.8S, 28S, 18S).
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
--Помогите Эта помощь
--версия
Версия для печати и выход
- цитата
Печатная цитата для ссылки на barrnap
--Королевство [X]
Царство: mito bac arc euk (по умолчанию - bac)
--тихий
Нет вывода на экран (по умолчанию ВЫКЛ.)
--потоки [N]
Количество используемых потоков / ядер / процессоров (по умолчанию 8)
--lencutoff [nn] Порог пропорциональной длины для обозначения частичного (по умолчанию 0.8)
--отклонять [nn]
Порог пропорциональной длины для отклонения прогноза (по умолчанию 0.5)
--оценка [nn]
Отсечка е-значения подобия (по умолчанию '1e-09')
--incseq
Включить входные последовательности FASTA в выход GFF3 (по умолчанию ВЫКЛ)
Используйте barrnap онлайн с помощью сервисов onworks.net