Это команда bowtie2-inspect-s, которую можно запустить в провайдере бесплатного хостинга OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
bowtie2-inspect-s - извлекает информацию из индекса bowtie2
СИНТАКСИС
Bowtie2-осмотреть [кредита]*
ОПИСАНИЕ
Bowtie 2, версия 2.2.6, автор Ben Langmead ([электронная почта защищена], www.cs.jhu.edu/~langmea)
bt2 имя файла минус конечный .1.bt2 / .2.bt2
По умолчанию распечатывает FASTA-записи проиндексированных нуклеотидных последовательностей в стандартном формате.
из. С участием -n, просто печатает имена. С участием -s, просто печатает сводку индекса
параметры и последовательности. С участием -e, сохраняет цвета, если применимо.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
-a/--через
Количество символов в выводе FASTA (по умолчанию: 60)
-n/ - имена
Печатать только имена эталонных последовательностей
-s/--резюме
Распечатать сводку, вкл. ссылочные имена, длины, свойства индекса
-e/ - bt2-ref
Восстановить ссылку из .bt2 (медленно, сохраняет цвета)
-v/--подробный
Подробный вывод (для отладки)
-h/--помощь
распечатать подробное описание инструмента и его опций
--Помогите распечатать это сообщение об использовании
Используйте bowtie2-inspect-s онлайн с помощью сервисов onworks.net
