Это команда bp_chaos_plotp, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
bp_chaos_plot - график хаоса из последовательностей ДНК и РНК
СИНТАКСИС
bp_chaos_plot.pl -i / - input = INPUTFILE -f / - format = SEQFORMAT
-o / - output = OUTPUTFILE -g / - graphics = ГРАФИЧЕСКИЙ ФОРМАТ
-w / - ширина = ШИРИНА -h / - высота = ВЫСОТА
ОПИСАНИЕ
Этот скрипт генерирует файлы изображений с использованием библиотеки изображений GD для визуализации нуклеотидов.
последовательности с использованием хаотического сюжета.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
В настоящее время допустимыми графическими форматами являются gd, gd2, png, wbmp, jpeg и gif.
Размер файла изображения по умолчанию - 600x400.
Ввод последовательности может быть предоставлен любым из трех методов:
безымянный аргумент
bp_chaos_plot имя файла
именованный аргумент
bp_chaos_plot -i имя файла
стандартный ввод
bp_chaos_plot <имя файла
СВЯЗЬ
Рассылка Списки
Отзывы пользователей - неотъемлемая часть развития этого и других модулей Bioperl. послать
Ваши комментарии и предложения желательно направлять в список рассылки Bioperl. Ваше участие
очень ценится.
[электронная почта защищена] - Обсуждение
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - О списках рассылки
Reporting ошибки
Сообщайте об ошибках в систему отслеживания ошибок Bioperl, чтобы мы могли отслеживать ошибки и их
разрешающая способность. Отчеты об ошибках можно отправлять через Интернет:
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
АВТОР - Джейсон Стаджич
Эл. адрес [электронная почта защищена]
ИСТОРИЯ
Этот код основан на коде EMBOSS C для chaos.c Иэна Лонгдена. Включены
документация из кода EMBOSS:
Хаос порождает хаос сюжета. Исходное приложение является частью генома ACEDB
пакет базы данных, написанный ** Ричардом Дурбином (MRC LMB, Великобритания) [электронная почта защищена]качества
Жан Тьерри-Миег (CRBM du CNRS, Франция) [электронная почта защищена]
Используйте bp_chaos_plotp в Интернете с помощью сервисов onworks.net
