Это команда bp_seqcutp, которую можно запустить в провайдере бесплатного хостинга OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
bp_seqcut.pl
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
bp_seqcut.pl [параметры -h, -s, -e, -f, -w] ...
bp_seqcut.pl [параметры -h, -f, -w] se ...
-h это справочное сообщение
-s какие остатки начинать резать
-e на каких остатках закончить резку
-f формат файлов, по умолчанию FASTA, но вы можете указать все, что поддерживается SeqIO из BioPerl
-w ширина жесткого обтекания, это может не поддерживаться в зависимости от того, какой формат вы используете
Описание
Скрипт для вырезания последовательностей FASTA с заданным диапазоном `fastacut -s 1 -e 10 * .fasta` или
`fastacut 1-10 * .fasta`. Это просто удобная оболочка модуля Bio :: SeqIO.
Полезно, если вы хотите обрезать участок трассы, чтобы построить профиль определенного
область последовательности.
Используйте bp_seqcutp в Интернете с помощью сервисов onworks.net
