Это команда bp_seqretp, которую можно запустить в провайдере бесплатного хостинга OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
bp_seqret - реализация в BioPERL выборки последовательности из локальной базы данных (например, EMBOSS seqret)
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
bp_seqret [-f / - формат вывода] [-o / - out / - файл вывода] [-d / - db dbname]
[-i / - id / -s / - seqname seqname1]
Пример использования:
bp_seqret -f fasta -db db.fa -i seq1 -i seq2> output.fas
bp_seqret db.fa: seq1 output.fas
bp_seqret db.fa: seq1 -o output.fas
bp_seqret -db db.fa -o output.fas seq1 seq2 seq3
bp_seqret -db db.fa seq1 seq2 seq3 output.fas
bp_seqret -db db.fa seq1 seq2 seq3 -> output.fas
Ожидается, что БД будет файлом последовательности в формате Fasta с несколькими последовательностями.
Формат вывода по умолчанию - Fasta.
Если имя файла вывода не указано, вывод записывается в STDOUT. Предоставление '-' в качестве
Выходное имя файла выполнит то же самое.
Используйте bp_seqretp в Интернете с помощью сервисов onworks.net
