Это команда cassiopee, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
cassiopee - страница справочника для Cassiopee версии 1.0
СИНТАКСИС
кассиопия [Options]
ОПИСАНИЕ
Применение:
-l: максимальная глубина индекса / максимальный размер рисунка
-u: сохранить индекс для дальнейшего использования
-s: последовательность для индексации
-p: шаблон для поиска
-f: файл, содержащий шаблон для поиска
-o: выходной файл
-r: применить сокращение дерева
-m: режим поиска: 0 = ДНК, 1 = РНК, 2 = белок
-a: разрешить поиск неоднозначности алфавита
-n: максимальное количество последовательных N разрешенных совпадений в поиске
-e: максимальное количество разрешенных подстановок совпадений в поиске
-i: максимальное количество разрешенных совпадений в поиске
-g: генерирует точечный файл графика
-d: максимальная глубина графика
-t: формат вывода: 0: tsv (по умолчанию), 1: json
-x: минимальная позиция в последовательности
-y: максимальная позиция в последовательности
-v: показать версию
-h: показать это сообщение
Используйте кассиопию онлайн с помощью сервисов onworks.net
