Это команда cm_to_wigeon, которую можно запустить в провайдере бесплатного хостинга OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
cm_to_wigeon - помощник для wigeon (обнаружение аномалии ДНК Pintail 16S)
ОПИСАНИЕ
К сожалению этой инструменты который выходит in связи свиязь(1) is не документированный но it
С уважением домен кредита внизу. If являетесь знают better в отношении его цель пожалуйста падение us a в своих размышлениях
через сообщить об ошибке on надежная Debian системы.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
Требования:
--query_NAST
файл multi-fasta, содержащий запрашиваемые последовательности в формате выравнивания
--db_NAST
db в формате NAST
--db_FASTA
db в формате fasta (в формате мегабласта)
Общий кредита
-n количество наиболее подходящих последовательностей базы данных для сравнения (по умолчанию 15)
-R минимальный коэффициент дивергенции по умолчанию: 1.007
-P минимальный процент идентичности среди совпадающих последовательностей (по умолчанию 90)
параметры в мелодия ХимераМалигнер:
Параметры подсчета очков:
-M счет матча (по умолчанию: +5)
-N штраф за несоответствие (по умолчанию: -4)
-Q минимальное покрытие запроса путем сопоставления последовательности базы данных (по умолчанию: 70)
-T максимальное количество ходов многократного выравнивания (по умолчанию: 1)
Флаги:
--printAlignments
(по умолчанию выключено)
-v подробный
--exec_dir
cd здесь перед запуском
Используйте cm_to_wigeon онлайн с помощью сервисов onworks.net
