Это команда cmtk-unwarp_image_phantom, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
unwarp_image_phantom - Создать преобразование для устранения искажения изображения на основе фантома
описание
СИНТАКСИС
unwarp_image_phantom InputPhantom InputImage OutputXform
ОПИСАНИЕ
Этот инструмент вычисляет либо полиномиальное преобразование, либо деформацию произвольной формы B-сплайном, чтобы
расшифровать изображение. Преобразование основано на ожидаемых и обнаруженных ориентирах в
изображение структурного фантома, полученное на том же сканере. Используйте "detect_adni_phantom"
инструмент для обнаружения ориентиров ADNI Phantom на изображении и создания фантома
файл описания, подходящий для использования с этим инструментом.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
Глобальный Инструментарий Опции (эти Он общие by Найти СМТК инструменты)
--Помогите
Записать список основных параметров командной строки в стандартный вывод.
--help-all
Записать полный список основных и расширенных параметров командной строки в стандартный вывод.
--вики
Записать список параметров командной строки в стандартный вывод в разметке MediaWiki.
--человек
Напишите исходный код страницы руководства в разметке nroff для стандартного вывода.
--версия
Напишите версию инструментария для стандартного вывода.
- эхо
Записать текущую командную строку в стандартный вывод.
--verbose-уровень
Установите уровень детализации.
--подробный, -v
Увеличить уровень детализации на 1 (не рекомендуется; поддерживается для обратной совместимости).
--потоки
Установите максимальное количество параллельных потоков (для потоков POSIX и OpenMP).
Фитинги Опции
- подгонка-инверсия
Подобрать обратное преобразование (сопоставление фактических местоположений с ожидаемыми ориентирами). Это
полезен для вычисления карты поправки якобиана объема (с использованием 'переформатировать') без
необходимо численно инвертировать подобранную трансформацию без деформации.
- вперёд
Подгонка прямого преобразования (ожидается отображение фактических местоположений ориентиров). Это
полезно для исправления изображения с помощью повторного нарезания (с помощью «форматирования»). [Эта is домен
дефолт]
трансформация Модели
--сплайн
Установите B-образный шлиц произвольной формы.
--поли
Полиномиальное преобразование Фитса. [Эта is домен дефолт]
многочлен Фитинги Опции (с --поли)
--степень
Степень подобранного полиномиального преобразования. [Дефолт: 4]
B-сплайн Фитинги Опции (с --сплайн)
--final-cp-спейсинг
Окончательный шаг сетки контрольных точек выходного преобразования B-сплайна. [Дефолт: 0]
--final-cp-димс
Окончательные размеры сетки контрольных точек (т. Е. Количество контрольных точек) выхода B-
преобразование сплайна. Предоставляется как dimX, dimY, dimZ. [Дефолт: НИКТО]
--уровни
Количество уровней в процедуре аппроксимации многоуровневым B-сплайном. [Дефолт: 1]
--итерации-на-уровень
Максимальное количество итераций обновления коэффициента сплайна на уровень в многоуровневом
Процедура аппроксимации B-сплайном. [Дефолт: 100]
- среднеквадратичный порог
Пороговое значение для относительного улучшения невязки подгонки RMS. Подгоночная итерация
завершается, если (rmsAfterUpdate-rmsBeforeUpdate) / rmsBeforeUpdate <пороговое значение.
[Дефолт: 0]
- не подходит-аффинно
Отключите подгонку аффинного преобразования для инициализации сплайна. Вместо этого установите шлиц
напрямую. Обычно это дает худшие результаты и не рекомендуется.
АВТОРЫ
Торстен Рольфинг, при участии Майкла П. Хасака, Грега Джеффериса, Кэлвина Р.
Маурер, Даниэль Б. Русаков и Ярослав Гальченко
Используйте cmtk-unwarp_image_phantom в Интернете с помощью сервисов onworks.net
