Это команда right_abundances, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
right_abundances - запустить шаг коррекции сходства обилия генома
СИНТАКСИС
right_abundances ИМЕНА
ОПИСАНИЕ
Выполните шаг коррекции подобия.
Примечание: хотя можно запускать картографы чтения вручную или создавать подобие
матрицу вручную, мы настоятельно рекомендуем использовать предоставленные скрипты Python 'run_mappers.py'
и create_similarity_matrix.py.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ
ИМЕНА: Имя файла имен; файл имен в виде простого текста должен содержать по одному имени на каждый
линия. Имя используется как идентификатор во всем алгоритме.
-h, --Помогите
показать это справочное сообщение и выйти
-m СМАТ, - матрица подобия=SMAT
Путь к файлу матрицы сходства. Матрица подобия должна быть создана с такими же
NAMES файл. [по умолчанию: ./similarity_matrix.npy]
-s СЭМ, --самфайлы=SAM
Шаблон, указывающий на файлы SAM, созданные картографом. Заполнитель для имени
это «% s». [по умолчанию: ./SAM/%s.sam]
-b БОТИНОК, --bootstrap-образцы=BOAT
Установите количество образцов начальной загрузки. Используйте 1 для отключения начальной загрузки [по умолчанию: 100]
-o ВНЕ, --выход=ВНЕ
Файл вывода в виде простого текста, содержащий результаты. [по умолчанию: ./results.txt]
Использовать corre_abundances онлайн с помощью сервисов onworks.net
