Это команда EDTSurf, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
EDTSurf - быстрое и точное построение макромолекулярных поверхностей
СИНТАКСИС
ЭДТСурф -i имя_файла_файла...
ОПИСАНИЕ
EDTSurf - это программа с открытым исходным кодом для построения триангулированных поверхностей макромолекул. Это
образует три основные макромолекулярные поверхности: поверхность Ван-дер-Ваальса, доступная для растворителей
Поверхность и молекулярная поверхность (поверхность без растворителя). EDTsurf также определяет полости
которые находятся внутри макромолекул.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
-o превзойти
-t 1-MC 2-VCMC
-s 1-VWS 2-SAS 3-MS 4-SES
-c 1-чистый 2-атомный 3-х цепной
-p радиус зонда [0,2.0]
-f масштабный коэффициент (0,20.0]
-h 1 вход и выход 2 выхода 3 входа
вывод1: outname.ply
вывод 2: outname.asa
вывод3: outname-cav.pdb
Используйте EDTSurf онлайн с помощью сервисов onworks.net
