Это команда fastaq-to_fasta, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
fastaq_to_fasta - конвертирует различные входные форматы в хорошо отформатированный формат FASTA
ОПИСАНИЕ
использование: fastaq_to_fasta [параметры]
Преобразует различные входные форматы в красиво отформатированный формат FASTA
позиционный аргументы:
infile Имя входного файла. Может быть любым из FASTA, FASTQ, GFF3, EMBL, GBK, Phylip.
Outfile
Имя выходного файла
необязательный аргументы:
-h, --Помогите
показать это справочное сообщение и выйти
-l LINE_LENGTH, --line_length LINE_LENGTH
Количество баз в каждой строке последовательности выходного файла. Установить на ноль на нет
разрывы строк в последовательностях [60]
-s, --strip_after_whitespace
Удалите все после первого пробела в каждом имени последовательности
-u, --check_unique
Умрите, если какое-либо из имен выходной последовательности не уникально
Используйте fastaq-to_fasta онлайн с помощью сервисов onworks.net