Это команда fastaq-trim_contigs, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
fastaq_trim_contigs - Обрезает заданное количество баз в конце каждого контига
ОПИСАНИЕ
использование: fastaq_trim_contigs [параметры]
Обрезает заданное количество оснований на конце каждого контига, поэтому промежутки становятся больше и контиг
концы удалены. Базы заменены на Ns. Любая последовательность, которая заканчивается потерей всех N
позиционный аргументы:
infile Имя входного файла
Outfile
Имя выходного файла
необязательный аргументы:
-h, --Помогите
показать это справочное сообщение и выйти
--trim_number TRIM_NUMBER
Количество оснований, которые нужно обрезать вокруг каждого пробела и на концах каждой последовательности [100]
Используйте fastaq-trim_contigs онлайн с помощью сервисов onworks.net
