Это команда fdk, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
fdk - реконструкция конического луча по проекциям с использованием алгоритма FDK
Термин FDK относится к авторам Фельдкампу, Дэвису и Крессу, написавшим основополагающую статью.
«Практический алгоритм конического луча» в 1984 году. Их статья описывает фильтрованную обратную проекцию.
алгоритм реконструкции геометрии конической балки. Программа fdk в Plastimatch является
внедрение алгоритма FDK.
ФДК ИСПОЛЬЗОВАНИЕ
Программа fdk принимает в качестве входных данных каталог 2D-проекционных изображений и генерирует один
3D-объем на выходе.
Использование командной строки:
Использование: fdk [параметры]
Опции:
-A hardware Либо "cpu", либо "cuda" (по умолчанию = cpu)
-a "num ((num) num)" Использовать этот диапазон изображений
-r "r1 r2 r3" Установить выходное разрешение (в вокселях)
-f filter Либо "none", либо "ramp" (по умолчанию = ramp)
-s scale Масштабировать интенсивность выходного файла
-z "s1 s2 s3" Физический размер реконструкции (в мм)
-I indir Входной каталог
-O outfile Выходной файл
Использование программы fdk лучше всего понять, следуя инструкциям вместе с руководствами:
fdk_tutorial_i и fdk_tutorial_ii.
ВХОД FILES
Поддерживаются три разных формата входных файлов. Эти:
· Файлы изображений формата Pfm с файлами geomtry txt
· Файлы изображений в формате Raw с файлами geomtry txt
· Файлы Varian hnd
Файлы pfm и raw похожи в том, что они хранят изображение как массив из 4-х байтов.
с обратным порядком байтов с обратным порядком байтов. Единственная разница в том, что файл pfm имеет заголовок, в котором хранятся
размер изображения, а необработанный файл - нет.
Каждый файл pfm или необработанного изображения должен иметь файл геометрии в том же каталоге с .txt.
расширение. Например, если вы хотите использовать image_0000.pfm в реконструкции, вы должны
предоставьте еще один файл image_0000.txt, который содержит геометрию. Краткое описание
формат файла геометрии приведен в proj_mat_file_format.
Последовательность файлов должна храниться с шаблоном:
XXXXYYYY.ZZZ
где XXXX - префикс, YYYY - число, а .ZZZ - расширение известного типа.
(либо .hnd, .pfm, либо .raw).
Например, для pfm-файлов хорошей компоновкой каталогов может быть следующее:
Файлы / image_00.pfm
Файлы / image_00.txt
Файлы / image_01.pfm
Файлы / image_01.txt
и т.д...
Файлы Varian hnd должны храниться в исходном формате. Например:
Файлы / ProjectionInfo.xml
Файлы / Scan0 / Proj_0000.hnd
Файлы / Scan0 / Proj_0001.hnd
и т.д...
Для восстановления из формата Varian hnd не требуются файлы геометрического формата txt.
ОБРАЗ ГЕОМЕТРИЯ
По умолчанию, когда вы генерируете DRR, изображение ориентируется так, как если бы виртуальный источник рентгеновского излучения
были фотоаппаратом. Это означает, что для правой боковой пленки столбцы изображения идут от
inf до sup, а строки идут от муравья к сообщению. Система Varian OBI создает файлы HND,
которые по-разному ориентированы. Для правой боковой пленки столбцы изображений HND идут
от муравья к сообщению, а строки идут от sup к inf. Показана иллюстрация этой идеи.
на рисунке ниже.
[изображение] Геометрия файлов Varian HND.UNINDENT
Используйте fdk онлайн с помощью сервисов onworks.net
