Это команда geneparse-mpi, которую можно запустить в провайдере бесплатного хостинга OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
geneparse - интерфейс загрузчика файлов последовательностей
SYNAPSE
geneparse [параметры ...] [ввод] [ввод2 ...] # читать ввод и записывать в стандартный вывод
ОПИСАНИЕ
Читает файл последовательности и записывает его куда-нибудь (по умолчанию в stdout).
Конкретный диапазон во входном файле может быть указан с помощью file [start, stop]. Площадь
скобки можно поменять местами для любого из {[()]}, (например, "genome.fa [3000,4000]" или
"genome.fa {3000 ~ 4000}"). Имейте в виду, что все это может быть проанализировано вашей оболочкой. Также
для разделения чисел можно использовать любой символ, не являющийся словом.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
--repeatmask | -r
используйте последовательности с мягким повторением (например, замените основание нижнего регистра на N).
--upper | --unmask | -U
прописные буквы всех оснований.
--length | -l
просто напечатайте длину и выйдите
--clean | -c
не добавляйте новую строку, когда закончите
--version | -V
печатает версию программы
--help | -h
печатает справочное сообщение
--output | -o
отправить вывод в файл (в противном случае используйте stdout). --output подразумевает --clean.
--quiet | -q
отключить все предупреждения
--verbose | -v
печатает много дополнительных деталей
Используйте geneparse-mpi в Интернете с помощью сервисов onworks.net
