Это команда idconvert, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
idconvert - Преобразование форматов файлов идентификации масс-спектрометрии.
СИНТАКСИС
idconvert [параметры] [маски файлов]
ОПИСАНИЕ
Эта страница руководства кратко документирует idconvert программное обеспечение, поставляемое в libpwiz-инструменты
упаковка. Эта программа позволяет преобразовывать данные масс-спектрометрической идентификации белков.
файлы из одного формата в другой.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
-v | --подробный
Отображение подробной информации о ходе обработки.
-ф | --filelist имя файла
Использует содержимое имя файла в котором перечислены имена файлов.
-о | --outdir директория
Установите выходной каталог ('-' для stdout) на директория. По умолчанию вывод
каталог - '.' (то есть текущий рабочий каталог).
-с | --config имя файла
Установите файл конфигурации на имя файла.
-е | --ext Ext
Установите расширение выходных файлов на Ext. Может быть mzid, pepXML или txt.
--mzIdentML
Написать мзидентмл формат (по умолчанию).
--pepXML Запись pepXML формат.
--text Записать иерархически текст формат.
ПРИМЕРЫ
Преобразовать sequest.pepXML в sequest.mzid
idconvert sequest.pepXML
Преобразование mascot.mzid в mascot.pepXML
idconvert талисман. мзид --pepXML
Используйте файл конфигурации
idconvert xtandem.pep.xml -c config.txt
ВЕРНУТЬ VALUE
Количество неудачных файлов.
Используйте idconvert онлайн с помощью сервисов onworks.net
