Это команда LAdump, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
LAdump — отображать локальные выравнивания daligner в простом формате.
СИНТАКСИС
LAdump [-cdt] [-o] src1: db | плотина [ src2: db | плотина ] выровнять: лас [ читает: ФАЙЛ | читает: диапазон ...]
ОПИСАНИЕ
Подобно Лос-Анджелесшоу(1) LAdump позволяет отображать локальные выравнивания (LA) подмножества
сваи в файле .las и выберите, какую информацию о них показывать. Разница в том,
что информация записывается в очень простом формате ASCII с 1 кодом, что упрощает
для одного, чтобы прочитать и проанализировать информацию для дальнейшего использования. Для каждого LA пара чтений
выводится в строку. -c просит дополнительно вывести координаты ЛА
сегменты будут выведены. -d опция требует, чтобы количество различий в LA было
выход, и -t запрашивает вывод информации о точке трассировки. Окончательно, -o Запросы
выводиться будут только те LA, которые полностью перекрываются.
Формат очень простой. Каждая запрошенная часть информации находится в строке.
первый символ каждой строки — это символ «1-кода», который сообщает вам, какую информацию следует
ожидайте на линии. Остальная часть строки содержит информацию о том, где находится каждый элемент.
разделены одним пробелом. Линия точки трассировки показывает номер точки трассировки.
интервалов в LA, и сразу за ним следует столько же строк, содержащих пару
целые числа, задающие количество различий и b-смещение в каждой последующей точке трассировки
интервал.
P #a #b - (#a,#b) между ними есть ЛА
C #ab #ae #bb #be — [#ab,#ae] совпадает с [#bb,#be]
D# - в ЛА есть # отличия
T #n — имеется #n интервалов точек трассировки для LA.
(#d #y )^#n - имеется разница #d, выравнивающая #y bp B с
следующий интервал фиксированного размера A
+X# — Общая сумма X (X = P или T)
%X# — Максимальное количество X в любой куче (X = P или T)
@T# - Максимальное количество точек трассировки в любой трассировке
Строки с 1-кодом, начинающиеся с +, % или @, всегда являются первыми строками вывода. Они
предоставить информацию о размере того, что содержится в выводе. В частности, '+ X#' дает
общее количество LA (X=P) или общее количество интервалов точек трассировки (X=T) в
файл . '% X #' дает максимальное количество LA (X=P) или максимальное количество точек трассировки.
интервалы (X=T) в заданном накапливаться (коллекция LA с одинаковым значением a-read (применяется только
to sorted Наконец, @ T # дает максимальное количество интервалов точек трассировки в любой трассе внутри
файл.
Используйте LAdump онлайн с помощью сервисов onworks.net.
