Это команда last-dotplot, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
last-dotplot - создание точечной диаграммы, также известной как Oxford Grid, выравниваний в LAST табличном формате
СИНТАКСИС
график последней точки --Помогите
график последней точки [кредита] выравнивание maf-or-tab точка.png
график последней точки [кредита] выравнивание maf-or-tab dotplot.gif
...
ОПИСАНИЕ
Нарисуйте точечную диаграмму попарного выравнивания последовательностей в MAF или табличном формате.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
-h, --Помогите
показать это справочное сообщение и выйти
-1 ШАБЛОН, --seq1=ШАБЛОН
какие последовательности показывать из 1-го генома
-2 ШАБЛОН, --seq2=ШАБЛОН
какие последовательности показать из 2-го генома
-x ШИРИНА, --ширина=ШИРИНА
максимальная ширина в пикселях (по умолчанию: 1000)
-y ВЫСОТА, --рост=ВЫСОТА
максимальная высота в пикселях (по умолчанию: 1000)
-f ФАЙЛ, --файл_шрифта=ФАЙЛОВ
Файл шрифта TrueType или OpenType
-s РАЗМЕР, --размер шрифта=РАЗМЕР
Размер шрифта TrueType или OpenType (по умолчанию: 11)
-c ЦВЕТ, --forwardcolor=COLOR
цвет для прямого выравнивания (по умолчанию: красный)
-r ЦВЕТ, --reversecolor=COLOR
цвет для обратного выравнивания (по умолчанию: синий)
Варианты неупорядоченных разрывов:
--gap1=ФАЙЛОВ
читать несеквенированные пробелы genome1 из файла agp или пробелов
--gap2=ФАЙЛОВ
читать несеквенированные пробелы genome2 из файла agp или пробелов
- мостиковый цвет=COLOR
цвет перекрытия зазоров (по умолчанию: желтый)
- без моста=COLOR
цвет для незамкнутых промежутков (по умолчанию: розовый)
Используйте last-dotplot онлайн с помощью сервисов onworks.net
