АнглийскийФранцузскийНемецкийИтальянскийПортугальскийРусскийИспанский

Значок OnWorks

masai_mapper - Онлайн в облаке

Запустите masai_mapper в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks через Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS

Это команда masai_mapper, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.

ПРОГРАММА:

ИМЯ


masai_mapper - картограф масаи

СИНТАКСИС

masai_mapper [ОПЦИИ]

ОПИСАНИЕ

Масаи - это быстрый и точный картограф, основанный на приблизительных семенах и множественных
возврат.

Видеть http://www.seqan.de/projects/masai чтобы получить больше информации.

(c) Авторские права 2011-2012 Энрико Сирагуса.

-h, --Помогите

Отображает это справочное сообщение.

--версия

Отображение информации о версии

Параметры отображения:

-mm, - режим отображения STR

Выберите режим отображения. Один из всех, все самое лучшее и все самое лучшее. По умолчанию: любое лучшее.

-мб, - картографический блок NUM

Максимальное количество одновременных отображений чтения. В диапазоне [10000..inf]. Дефолт:
2147483647

-e, - ошибки NUM

Максимальное количество ошибок за одно чтение. В диапазоне [0..32]. По умолчанию: 5.

-сл, - длина семян NUM

Минимальная длина семян. В диапазоне [10..100]. По умолчанию: 33.

-ng, - без пробелов

Не выравнивайте показания по пробелам.

Параметры индекса генома:

-x, --показатель STR

Выберите тип индекса генома. Один из esa, sa, qgram и fm. По умолчанию: sa.

-Xp, --index-префикс STR

Укажите имя префикса индекса генома. По умолчанию: использовать префикс имени файла генома.

Параметры вывода:

-o, --выходной файл ФАЙЛОВ

Укажите выходной файл. По умолчанию: использовать префикс имени файла для чтения. Допустимые типы файлов
являются: raw и sam.

-нк, - без сигары

Не выводить строку CIGAR. Это влияет только на вывод SAM.

Параметры отладки:

-nv, --no-проверить

Не проверяйте попадание семян.

, --без свалки

Не сваливайте результаты.

-нм, --не-кратный

Отключить множественный возврат с возвратом.

Версия

версия masai_mapper: 0.7.1 [14053] Последнее обновление 2013-05-16

Используйте masai_mapper онлайн с помощью сервисов onworks.net


Ad


Ad

Новейшие онлайн-программы для Linux и Windows