АнглийскийФранцузскийИспанский

Ad


Значок OnWorks

mauveToXMFA - Интернет в облаке

Запустите mauveToXMFA в провайдере бесплатного хостинга OnWorks через Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS

Это команда mauveToXMFA, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.

ПРОГРАММА:

ИМЯ


addUnalignedIntervals - часть пакета mauveAligner
alignmentProjector - часть пакета mauveAligner
backbone_global_to_local - часть пакета mauveAligner
bbAnalyze - часть пакета mauveAligner
createBackboneMFA - часть пакета mauveAligner
getAlignmentWindows - часть пакета mauveAligner
getOrthologList - часть пакета mauveAligner
makeBadgerMatrix - часть пакета mauveAligner
mauveToXMFA - часть пакета mauveAligner
mfa2xmfa - часть пакета mauveAligner
projectAndStrip - часть пакета mauveAligner
randomGeneSample - часть пакета mauveAligner
scoreAlignment - часть пакета mauveAligner
stripGapColumns - часть пакета mauveAligner
stripSubsetLCBs - часть пакета mauveAligner
toGrimmFormat - часть пакета mauveAligner
toMultiFastA - часть пакета mauveAligner
toRawSequence - часть пакета mauveAligner
uniqueMerCount - часть пакета mauveAligner
uniquifyTrees - часть пакета mauveAligner
xmfa2maf - часть пакета mauveAligner

ОПИСАНИЕ


Эти инструменты принадлежат пакету mauveAligner. Они явно не задокументированы, но
печатают синопсис, который здесь повторяется.

addUnalignedInterval интервал файл> <выход интервал файл>

выравниваниеПроектор xmfa> <выход xmfa> <мфа далее ввод> <мфа далее вывод> <список of
последовательности в включают, начиная at 0>

backbone_global_to_local <xmfa файл> <магистраль файл> <выход файл>

bbAnalyze <xmfa файл> <руководство дерево> <магистраль последовательности файл> <магистраль кол файл> <аннотировано
далее индекс> <выход файл>

аннотированный индекс seq начинается с 0.

создатьBackboneMFA интервал файл> <выход МИД имя>

getAlignmentWindows <XMFA выравнивание> <окно длина> <окно сдвиг сумма> <база выходной
имя файла>

getOrthologList getOrthologList xmfa> <магистраль далее файл> <ссылка геном> <CDS
ортолог имя файла> <CDS выравнивание Использование темпера с изогнутым основанием имя>

сделатьBadgerMatrix сделатьBadgerMatrix xmfa> <выход барсук файл> <LCB координировать файл>

сиреневый сиреневый <Лиловый центровка ввод> <XMFA вывод>

mfa2xmfa <МИД выравнивание ввод> <XMFA выравнивание вывод> [Невыровненный ФастА выход]

проектAndStrip xmfa> <выход xmfa> ...

Идентификаторы числовой последовательности начинаются с 0.

случайныйГенОбразец xmfa> <магистраль далее файл> <образец геном> <число of гены>
<выход Использование темпера с изогнутым основанием имя> [случайный семя]

оценка <правильно выравнивание> <рассчитано выравнивание> [развитый последовательность файл] [слаган]

полосаGapколонны XMFA> <выход XMFA>

полосаПодмножествоLCB xmfa> bbcols> <выход xmfa> [мин LCB размер] [мин геномы]
[случайно подвыборка в X кб]

toGrimmFormat <Лиловый Выравнивание> <геном 1 CHR длина> ... N CHR длина>

toMultiFastA интервал файл> <выход Использование темпера с изогнутым основанием имя>

toRawSequence последовательность> <выход файл>

уникальныйMerCount <Отсортировано море Список>

uniquifyДеревья <связь вход файл> <связь выходной файл>

Все деревья во входном файле должны иметь одинаковое количество таксонов и один и тот же таксон.
этикетки

xmfa2maf <xmfa ввод> <маф вывод>

Используйте mauveToXMFA в Интернете с помощью сервисов onworks.net


Бесплатные серверы и рабочие станции

Скачать приложения для Windows и Linux

  • 1
    DivFix ++
    DivFix ++
    DivFix++ - ваш ремонт видео AVI и
    программное обеспечение для предварительного просмотра. Он предназначен для ремонта
    и файлы предварительного просмотра, которые доступны для скачивания
    от ed2k(emule), торрент, gnutella, ftp...
    Скачать ДивФикс++
  • 2
    Сообщество JBoss
    Сообщество JBoss
    Общественные проекты с участием
    последние инновации для передовых технологий
    Программы. Наш флагманский проект JBoss AS
    ведущий Open Source,
    соответствует стандартам...
    Скачать сообщество JBoss
  • 3
    Джанго Филер
    Джанго Филер
    django Filer — это система управления файлами.
    приложение для django, которое делает
    обработка файлов и изображений на одном дыхании.
    django-filer — это файловый менеджер.
    приложение для джанг...
    Скачать Джанго Филер
  • 4
    хCAT
    хCAT
    Инструментарий экстремального администрирования кластера.
    xCAT — это масштабируемое средство управления кластером.
    и инструмент обеспечения, который обеспечивает
    аппаратное управление, обнаружение и ОС
    дисковый/ди...
    Скачать xCAT
  • 5
    Фунтов на квадратный дюйм
    Фунтов на квадратный дюйм
    Psi — кроссплатформенный мощный XMPP
    клиент, предназначенный для опытных пользователей.
    Есть сборки для MS
    Windows, GNU/Linux и macOS. Аудитория:
    Конечные пользователи...
    Скачать Пси
  • 6
    Блобби залп 2
    Блобби залп 2
    Официальное продолжение знаменитого
    Аркадная игра Blobby Volley 1.x..
    Аудитория: конечные пользователи / рабочий стол. Пользователь
    интерфейс: OpenGL, SDL. Программирование
    Язык: С++, Луа. С...
    Скачать Blobby Volley 2
  • Больше »

Команды Linux

Ad