Это команда nipy_tsdiffana, которую можно запустить в провайдере бесплатного хостинга OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
nipy_tsdiffana - Анализировать, строить метрики разницы временных рядов
ОПИСАНИЕ
использование: nipy_tsdiffana [-h] [--out-file OUT_FILE] [--write-results]
[--out-path OUT_PATH]
[--out-fname-label OUT_FNAME_LABEL] [--time-axis TIME_AXIS] [--slice-axis
SLICE_AXIS] имя файла
Анализировать, строить метрики разницы временных рядов
позиционный аргументы:
имя файла
Имя файла 4D изображения
необязательный аргументы:
-h, --Помогите
показать это справочное сообщение и выйти
--out-файл ВЫХОД_ФАЙЛ
графический файл для записи вместо того, чтобы оставлять изображение на экране
--write-результаты
если указано, записать диагностические изображения и переменные анализа, построить график в OUT_PATH.
Взаимно несовместимо с OUT_FILE
--out-path OUT_PATH
путь для выходных файлов изображений (по умолчанию из FILENAME path
--out-fname-метка OUT_FNAME_LABEL
средняя часть имен файлов выходного изображения / графика
- ось времени TIME_AXIS
Ось изображения для времени
--slice-ось SLICE_AXIS
Ось изображения для среза
nipy_tsdiffana запускает алгоритм разности временных рядов по объему четырехмерного изображения, часто и
Объем FMRI.
Работает в одном из трех режимов:
* интерактивный: график разницы временных рядов появляется на экране. Это
режим по умолчанию
* неинтерактивный, только график: записать график разницы временных рядов в график
файл. Используйте "--out-file =" "возможность активировать этот режим
* неинтерактивный, запись сюжета, изображений и переменных: запись сюжета в файл и
также записывать сгенерированные диагностические изображения и переменные в файлы. Использовать
Флаг «--write-results» для активации этой опции. Сгенерированные имена файлов взяты из
результаты параметров "--out-path" и "--out-fname-label" (см. справку).
Возможность записи результатов, сгенерированные файлы -------------------------------------
При проведении анализа временных точек мы будем определять объем разницы между каждым разом.
точка и следующая временная точка в серии. Если у нас есть T объемов, то будет
(Т-1) разностные объемы. Назовем вектор разностных объемов DV и первого
разность объемов DV [0]. Итак, DV [0] получается в результате вычитания второго объема в 4D
входное изображение из первого тома входного 4-мерного изображения. Поэлементные квадраты значений
из DV [0] это * DV2 [0] *.
Будут созданы следующие изображения. является расширением входного имени файла (например,
'.nii'):
* "dv2_max_ ": Объем трехмерного изображения, где каждый фрагмент S является фрагментом из
весь DV2 [0] (срез S) через DV2 [T-1] (срез S), который имеет максимальное суммированное
квадраты значений. Этот том дает представление о наихудших (наибольшая разница) срезах.
по всему временному ряду.
* "dv2_mean_ ": среднее значение всех объемов DV2 DV2 [0] .. DV [T-1]
по объему (времени).
Более высокие значения вокселов в этом объеме означают
разница между временными точками в этом вокселе была большой.
Мы также записываем средний сигнал в каждый момент времени и среднеквадратичную разницу между
каждый отрезок времени как переменные в файле 'npz' с именем "tsdiff_ .npz"
Имена файлов для выходов имеют форму /
куда путь, указанный --out-path вариант или путь входа
имя файла; - один из стандартных префиксов, приведенных выше, задается следующим образом:
--out-метка, или по имени файла входного изображения (с удаленными путем и расширением), и
'.png' для графики или расширение имени входного файла для тома
изображений. Например, указание только имени входного файла `` / some / path / fname.img`` будет
сгенерировать имена файлов в форме `` /some/path/tsdiff_fname.png,
/ некоторый / путь / dv2_max_fname.img '' и т. д.
Используйте nipy_tsdiffana онлайн с помощью сервисов onworks.net
