Это блудная команда, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
prodigal - программа поиска микробных (бактериальных и архейных) генов
СИНТАКСИС
расточительный [-a транс_файл] [-c] [-d nuc_file] [-f тип_вывода] [-g tr_таблица] [-h] [-i
входной_файл] [-m] [-n] [-o выходной_файл] [-p режим] [-q] [-s начальный_файл] [-t тренировочный_файл]
[-в]
ОПИСАНИЕ
Prodigal (Алгоритм поиска генов прокариотического динамического программирования) - это микробный (бактериальный
и архей) программа поиска генов, разработанная в Окриджской национальной лаборатории и
Университет Теннесси.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ
-a: Записать переводы белков в выбранный файл.
-c: Закрытые концы. Не позволяйте генам сбегать с краев.
-d: Записать нуклеотидные последовательности генов в выбранный файл.
-f: Выбор формата вывода (gbk, gff или sco). По умолчанию gbk.
-g: Укажите таблицу перевода для использования (по умолчанию 11).
-h: Распечатать меню справки и выйти.
-i: Укажите входной файл (по умолчанию читается из стандартного ввода).
-m: Считайте серии n замаскированной последовательностью и не создавайте гены на их основе.
-n: Обойти трейнер Shine-Dalgarno и заставить программу сканировать мотивы.
-o: Укажите выходной файл (по умолчанию записывает в стандартный вывод).
-p: Выберите процедуру (одиночную или мета). По умолчанию - single.
-q: Работать тихо (подавить нормальный вывод stderr).
-s: Записать все потенциальные гены (с оценками) в выбранный файл.
-t: Написать обучающий файл (если его нет); в противном случае прочтите и используйте указанный
обучающий файл.
-v: Распечатать номер версии и выйти.
Используйте блудный сын онлайн с помощью сервисов onworks.net
