Это команда trna2sap, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
trna2sap - конвертировать вывод tRNAscan-SE в объект ASN.1 Seq-annot
СИНТАКСИС
трна2сап [-] [-a] [-c ул] [-f ул] [-i имя файла] [-j] [-m ул] [-n ул] [-o имя файла]
[-p директория] [-r директория] [-s] [-t ул] [-u] [-x ул]
ОПИСАНИЕ
трна2сап читает текстовый файл, созданный tRNAscan-SE, и создает соответствующий ASN.1 Seq-
аннотацию в формате, понятном другим инструментам NCBI.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ
Сводка опций приведена ниже.
- Распечатать сообщение об использовании
-a Добавить ссылку на tRNAscan-SE
-c ул КОММЕНТАРИЙ
-f ул Фильтр подстроки
-i имя файла
Единый входной файл (стандартный ввод по умолчанию)
-j Просто создайте таблицу характеристик из пяти столбцов, а ля трна2тбл(1).
-m ул Ремарк
-n ул Название аннотации (обычно «тРНК»).
-o имя файла
Один файл вывода (стандартный вывод по умолчанию)
-p директория Путь к файлам
-r директория Путь к результатам
-s Игнорировать псевдо-тРНК
-t ул Название аннотации (обычно «tRNAscan-SE»).
-u Игнорировать неопределенные тРНК
-x ул Суффикс выбора файла с -p (.трна по умолчанию).
Используйте trna2sap онлайн с помощью сервисов onworks.net
