wb_command - Онлайн в облаке

ПРОГРАММА:

ИМЯ

wb_command - программа командной строки для выполнения множества алгоритмических задач с использованием
объем, поверхность и данные в координатах серого

СИНТАКСИС

ОПИСАНИЕ

-добавить в спецификационный файл ДОБАВИТЬ ФАЙЛ В ФАЙЛ СПЕЦИФИКАЦИИ

wb_command -добавить в спецификационный файл

- файл спецификации, который нужно добавить в - структура
файл данных - путь к файлу

Результирующий файл спецификации перезаписывает существующий файл спецификации.
Если спецификация

файл не существует, он создается с метаданными по умолчанию.
Структура

аргумент должен быть одним из следующих:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT МОЗЖОЧЕК ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT КОРА
DIENCEPHALO_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALO_VENTRAL_RIGHT ГИППОКАМПУС_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-бэкэнд-средняя-плотная-рентабельность КОМАНДА НАЗАД CONNECTOME DB ДЛЯ СРЕДНЕЙ ПЛОТНОЙ Рентабельности инвестиций CIFTI

wb_command -бэкэнд-средняя-плотная-рентабельность

- разделенный запятыми список индексов cifti для усреднения - файл
записать среднюю строку в

Эта команда, вероятно, не та, которую вы ищете, попробуйте
-сифти-средний-плотный-рой. Список файлов cifti требуется для усреднения от
стандартный ввод, и записывает свой вывод в виде 32-битного целого числа с прямым порядком байтов и размером строки
за которой следует строка в виде 32-битных чисел с плавающей запятой.

-бэкэнд-среднее-рентабельность-корреляция КОМАНДА ОБРАТНОЙ ПЕРЕДАЧИ БД CONNECTOME ДЛЯ СРЕДНЕЙ Рентабельности инвестиций CIFTI
КОРРЕЛЯЦИЯ

wb_command -бэкэнд-среднее-рентабельность-корреляция

- разделенный запятыми список индексов cifti для усреднения, а затем

соотносить

- файл для записи средней строки

Эта команда, вероятно, не та, которую вы ищете, попробуйте
-cifti-средняя-рои-корреляция. Список файлов cifti требуется для усреднения от
стандартный ввод, и записывает свой вывод в виде 32-битного целого числа с прямым порядком байтов и размером строки
за которой следует строка в виде 32-битных чисел с плавающей запятой.

-граница-экспорт-таблица цветов ЗАПИСАТЬ ИМЕНА И ЦВЕТА ГРАНИЦ КАК ТЕКСТ

wb_command -граница-экспорт-таблица цветов

- входной файл границы - output - выходной текстовый файл

[-class-colors] - использовать цвета классов вместо цветов имени

Принимает имена и цвета каждой границы и записывает их в том же формате, что и
-метрическая метка-импорт надеется. По умолчанию границы окрашены по имени границы,
указывать -класс-цвета вместо этого раскрасить их по классам. Ключевые значения начинаются с 1
и следуйте порядку границ в файле.

-border-file-export-to-caret5 ЭКСПОРТ ГРАНИЧНОГО ФАЙЛА В ФОРМАТ ФАЙЛА CARET5

wb_command -border-file-export-to-caret5

- файл границы рабочего места - префикс имени
вывод caret5

border / borderproj / bordercolor файлы

[-surface] - repeatable - указать входную поверхность

- напильник для снятия проекции границ

Файл границы Workbench может содержать границы для нескольких структур и границ.
которые являются как прогнозируемыми, так и непроектированными. Он также содержит таблицу цветов для
границы.

Caret5 имеет файлы границ (непроецированные) и граничные проекции (проецируемые). В
Кроме того, каждый файл границы или проекции границы Caret5 обычно содержит данные для
единая структура. Caret5 также использует файл цвета границы, который связывает цвета
с названиями границ.

Эта команда попытается вывести файлы границы и проекции границы Caret5.
Каждый выходной файл границы / проекции границы будет содержать данные для одной структуры, поэтому
может быть создано много файлов. Название структуры входит в название
каждый созданный файл границы или проекции границы.

Эта команда также создаст один файл цвета границы Caret5.

Указание поверхностей в качестве входных параметров необязательно, но рекомендуется. Поверхности
может потребоваться для создания как проецируемых, так и / или непроектированных координат границ.
Если не удается создать границу вывода или проекцию границы из-за
отсутствует поверхность с подходящей структурой, отобразится сообщение об ошибке и
некоторые выходные файлы не будут созданы.

При записи новых файлов эта команда перезапишет файл с тем же именем.

-граница-слияние ОБЪЕДИНИТЬ ГРАНИЧНЫЕ ФАЙЛЫ В НОВЫЙ ФАЙЛ

wb_command -граница-слияние

- output - выходной файл границы

[-border] - repeatable - указать входной файл границы

- файл границы для использования границ из

[-select] - repeatable - выбрать единственную границу для использования

- номер границы или имя

[-up-to] - использовать исчерпывающий диапазон границ

- номер или название последнего столбца, который нужно включить

[-reverse] - использовать диапазон в обратном порядке

Берет один или несколько файлов границы и создает новый файл границы из границ в
их.

Пример: wb_command -граница-слияние Out.border -border первая.граница -Выбрать 1 -border
вторая. граница

В этом примере будет первая граница из first.border, за которой следуют все границы.
from second.border, и записать их на out.border.

-граница-ресемпл ПЕРЕЗАГРУЗИТЬ ФАЙЛ ГРАНИЦЫ НА ДРУГУЮ СЕТЬ

wb_command -граница-ресемпл

- файл границы для ресамплинга - поверхность сферы с
сетка, которая является метрикой

в настоящее время на

- поверхность сферы, которая совпадает с

и имеет желаемую выходную сетку

- output - выходной файл границы

Повторная выборка файла границы с учетом двух сферических поверхностей, которые находятся в регистре. Только
границы, которые имеют ту же структуру, что и current-сфера, будут пересчитаны.

-граница-к-руа ПОЛУЧАЙТЕ МЕТРИЧЕСКУЮ РОЗУ ОТ ГРАНИЦ

wb_command -граница-к-руа

- поверхность, на которой нарисованы границы - файл границы
- output - выходной файл метрики

[-border] - создать ROI только для одной границы

- название границы

[-inverse] - использовать инверсное выделение (за пределами границы)

По умолчанию рисует области интереса внутри всех границ в файле границ как отдельная метрика.
колонны.

-граница к вершинам НАРИСОВАТЬ ГРАНИЦЫ КАК ВЕРТИКАЦИИ В МЕТРИЧЕСКОМ ФАЙЛЕ

wb_command -граница к вершинам

- поверхность, на которой нарисованы границы - файл границы
- output - выходной файл метрики

[-border] - создать ROI только для одной границы

- название границы

Выводит метрику с единицами на вершинах, следующих за границей, и нулями в других местах. К
по умолчанию для каждой границы создается отдельный столбец метрики.

-cifti-all-label-to-rois ПОЛУЧАЙТЕ РОЗУ ОТ ВСЕХ ЭТИКЕТОВ НА КАРТЕ ЭТИКЕТОВ CIFTI

wb_command -cifti-all-label-to-rois

- входной файл метки cifti - номер или название карты меток
использовать - output - выходной файл cifti

Выходной файл cifti имеет столбец для каждой метки в указанной входной карте, другие
чем ??? метка, каждая из которых содержит ROI всех координат мозга, которые
установить на соответствующую метку.

-cifti-средний СРЕДНИЕ ФАЙЛЫ CIFTI

wb_command -cifti-средний

- output - выходной файл cifti

[-exclude-outliers] - исключить выбросы по стандартному отклонению каждого

элемент в файлах - количество стандартных отклонений ниже среднего
в

включают

- количество стандартных отклонений выше среднего до

включают

[-cifti] - repeatable - указать входной файл

- входной файл cifti

[-weight] - указать вес для этого файла

- вес для использования

Усредняет файлы cifti вместе.
Файлы без -вес указаны даны

вес 1.
If -exclude-выбросы указывается, в каждом элементе

данные по всем файлам взяты как набор, его невзвешенное среднее и эталонный образец
отклонение, а значения за пределами указанного числа стандартных отклонений
исключаются из (потенциально взвешенного) среднего по этому элементу.

-сифти-средний-плотный-рой СРЕДНИЕ РЯДЫ CIFTI ПО ПРЕДМЕТАМ ПО ROI

wb_command -сифти-средний-плотный-рой

- output - выходной файл cifti dscalar

[-cifti-roi] - файл cifti, содержащий комбинированные веса

- файл roi cifti

[-in-memory] - кешировать ROI в памяти, чтобы она не перечитывалась для

каждый вход cifti

[-left-roi] - веса для левого полушария

- левая рентабельность инвестиций в виде файла метрики

[-right-roi] - веса для правого полушария

- правильная рентабельность инвестиций в метрический файл

[-cerebellum-roi] - веса для измерения поверхности мозжечка

- roi мозжечка как метрический файл

[-vol-roi] - веса вокселей для использования

- файл тома roi

[-left-area-surf] - указать левую поверхность для коррекции площади вершины

- напильник левой поверхности

[-right-area-surf] - указать правую поверхность для коррекции площади вершины

- файл правой поверхности

[-cerebellum-area-surf] - указать поверхность мозжечка для области вершины

исправление - файл поверхности мозжечка

[-cifti] - repeatable - указать входной файл cifti

- файл cifti для усреднения по

Усредняет строки для каждой карты ROI по всем файлам.
Карты ROI

рассматриваются как весовые функции, включая отрицательные значения.
При покупке недвижимости

эффективность, убедитесь, что все, что не предназначено для использования, равно нулю в
Карта ROI. Если -cifti-рои указано, -лефт-рой, -право-рои, -мозжечок-рои и
-вол-рой не указывается. Если указано несколько файлов ROI, отличных от cifti,
в них должно быть одинаковое количество столбцов.

-cifti-средняя-рои-корреляция СРАВНИТЕЛЬНАЯ СРЕДНЯЯ ROI ПО ВСЕМ РЯДАМ, ЗАТЕМ СРЕДНЯЯ ПО ВСЕМ
ПРЕДМЕТЫ

wb_command -cifti-средняя-рои-корреляция

- output - выходной файл cifti

[-cifti-roi] - файл cifti, содержащий комбинированные веса

- файл roi cifti

[-in-memory] - кешировать ROI в памяти, чтобы она не перечитывалась для

каждый вход cifti

[-left-roi] - веса для левого полушария

- левая рентабельность инвестиций в виде файла метрики

[-right-roi] - веса для правого полушария

- правильная рентабельность инвестиций в метрический файл

[-cerebellum-roi] - веса для измерения поверхности мозжечка

- roi мозжечка как метрический файл

[-vol-roi] - веса вокселей для использования

- файл тома roi

[-left-area-surf] - указать левую поверхность для коррекции площади вершины

- напильник левой поверхности

[-right-area-surf] - указать правую поверхность для коррекции площади вершины

- файл правой поверхности

[-cerebellum-area-surf] - указать поверхность мозжечка для области вершины

исправление - файл поверхности мозжечка

[-cifti] - repeatable - указать входной файл cifti

- файл cifti для усреднения по

Усредняет строки для каждой карты ROI (ов), принимает корреляцию каждого среднего ROI
к остальным строкам в том же файле, затем усредняет результаты по всем
файлы. Области интереса всегда рассматриваются как весовые функции, включая отрицательные значения.
Для эффективности убедитесь, что все, что не предназначено для использования, имеет нулевое значение.
карту ROI. Если -cifti-рои указано, -лефт-рой, -право-рои, -мозжечок-рои,
и -вол-рой не указывается. Если указано несколько файлов ROI, отличных от cifti,
в них должно быть одинаковое количество столбцов.

-cifti-изменить временной шаг ИЗМЕНИТЬ ВРЕМЯ ФАЙЛА CIFTI

wb_command -cifti-изменить временной шаг

- файл cifti для изменения

[-row-timestep] - установить временной шаг по строкам

- секунд на временной шаг

[-column-timestep] - установить временной шаг по столбцам

- секунд на временной шаг

Предупреждает, если указанное измерение не является точками времени, в противном случае изменяет временной шаг,
и, наконец, записывает результат в то же имя файла, если какие-либо размеры были изменены.
ПРИМЕЧАНИЕ: вы, вероятно, захотите -строка-временной шаг, так как это соответствует .dtseries.nii
Технические характеристики. Другой вариант доступен только для полноты картины.

-cifti-конвертировать ВЫГРУЗИТЬ МАТРИЦУ CIFTI В ДРУГИЕ ФОРМАТЫ

wb_command -cifti-конвертировать

[-to-gifti-ext] - преобразовать во внешний бинарный формат GIFTI

- входной файл cifti - output - выходной файл gifti

[-from-gifti-ext] - преобразовать GIFTI, созданный с помощью этой команды, обратно в

CIFTI - входной файл gifti - output - вывод cifti
файл

[-reset-timepoints] - сбросить сопоставление строк с точками времени,

взяв длину из файла gifti - желаемое время между кадрами
- желаемое временное смещение исходного кадра

[-unit] - использовать другую единицу, кроме времени

- идентификатор объекта (по умолчанию SECOND)

[-reset-scalars] - сбросить отображение по строкам в скаляры, принимая длину

из файла gifti

[-replace-binary] - заменить данные двоичным файлом

- двоичный файл, содержащий данные замены

[-flip-endian] - поменять байтами двоичный файл

[-transpose] - транспонировать бинарный файл

[-to-nifti] - преобразовать в NIFTI1

- входной файл cifti - output - выходной файл nifti

[-from-nifti] - преобразовать файл NIFTI (1 или 2), созданный с помощью этой команды, обратно

в CIFTI - входной файл nifti - файл cifti с
размер (а) и отображение (а)

что следует использовать

- output - выходной файл cifti

[-reset-timepoints] - сбросить сопоставление строк с точками времени,

взяв длину из файла nifti - желаемое время между кадрами
- желаемое временное смещение исходного кадра

[-unit] - использовать другую единицу, кроме времени

- идентификатор объекта (по умолчанию SECOND)

[-reset-scalars] - сбросить отображение по строкам в скаляры, принимая длину

из файла nifti

[-to-text] - преобразовать в простой текстовый файл

- входной файл cifti - output - выходной текстовый файл

[-col-delim] - выбрать строку для размещения между элементами в строке

- строка для использования (по умолчанию - символ табуляции)

[-from-text] - преобразовать из простого текста в cifti

- входной текстовый файл - файл cifti с
измерение (а) и отображение (а)

что следует использовать

- output - выходной файл cifti

[-col-delim] - указать строку, которая находится между элементами в строке

- строка для использования (по умолчанию любой пробел)

[-reset-timepoints] - сбросить сопоставление строк с точками времени,

взяв длину из текстового файла - желаемое время между кадрами
- желаемое временное смещение исходного кадра

[-unit] - использовать другую единицу, кроме времени

- идентификатор объекта (по умолчанию SECOND)

[-reset-scalars] - сбросить отображение по строкам в скаляры, принимая длину

из текстового файла

Эта команда используется для преобразования полной матрицы CIFTI в / из форматов, которые могут быть
используется программами, которые не понимают CIFTI. Если вы хотите написать существующий
Файл CIFTI с другой версией CIFTI, см. -файл-конвертировать, А его
-cifti-версия-конвертировать вариант. Если вы хотите, чтобы часть файла CIFTI была метрикой,
этикетка или файл тома, см. -cifti-отдельный. Если вы хотите создать файл CIFTI
из файлов метрики и / или объема, см. -cifti-создать-* команды. Вы должны
укажите ровно один из -to-gifti-ext, -from-gifti-ext, -то-нифти, -от-нифти,
-печатать или -из-текста, -транспонировать вариант -from-gifti-ext необходимо, если
двоичный файл для замены находится в порядке следования столбцов. В -единица измерения варианты принимают эти
ценности:

РАДИАН ВТОРОЙ ГЕРЦОМЕТРА

-cifti-преобразовать-в-скаляр ИЗМЕНИТЬ РАЗМЕР CIFTI НА ИМЕНОВАННЫХ СКАЛЯРНЫХ КАРТАХ

wb_command -cifti-преобразовать-в-скаляр

- входной файл cifti - какое отображение изменить на скалярные карты,
СТРОКА или КОЛОННА - output - выходной файл cifti

[-name-file] - указать названия для карт

- текстовый файл, содержащий названия карт, по одному в каждой строке

Создает новый файл cifti с теми же данными, что и входные, но с одним из
размеры, содержащие строки, идентифицирующие каждую карту. Указание ROW будет
преобразовать файл dtseries в файл dscalar.

-cifti-копирование-отображение ЗАМЕНИТЬ КАРТУ НА ФАЙЛЕ CIFTI

wb_command -cifti-копирование-отображение

- файл cifti для использования данных из - в каком направлении
на заменить отображение - файл cifti, содержащий
желаемое отображение - какое направление на использовать
отображение

от

- output - выходной файл cifti

должен иметь такую ​​же длину в направлении замены, что и
имеет направление вдоль шаблона. Каждый аргумент направления должен быть
либо СТРОКА, либо КОЛОННА.

-cifti-корреляция ПОЛУЧИТЬ КОРРЕЛЯЦИЮ СТРОК В CIFTI-ФАЙЛЕ

wb_command -cifti-корреляция

- входной файл cifti - output - выходной файл cifti

[-roi-override] - выполнить корреляцию от подмножества строк ко всем строкам

[-left-roi] - использовать roi для левого полушария

- левая рентабельность инвестиций в виде файла метрики

[-right-roi] - использовать ROI для правого полушария

- правильная рентабельность инвестиций в метрический файл

[-cerebellum-roi] - использовать roi для мозжечка

- roi мозжечка как метрический файл

[-vol-roi] - использовать рентабельность инвестиций для увеличения объема

- объемный файл roi

[-cifti-roi] - использовать файл cifti для комбинированного rois

- файл cifti roi

[-weights] - указать веса столбцов

- текстовый файл, содержащий по одному весу на столбец

[-fisher-z] - применить малое z-преобразование Фишера (например, artanh) к корреляции.

[-no-demean] - вместо корреляции сделать точечное произведение строк, затем

нормализовать по диагонали

[-covariance] - вычислить ковариацию вместо корреляции

[-mem-limit] - ограничить использование памяти

- лимит памяти в гигабайтах

Для каждой строки (или каждой строки внутри ROI, если -roi-переопределить указано), коррелировать
ко всем остальным строкам. В -cifti-рои подопция к -roi-переопределить не может быть указано
с любой другой подопцией - * - roi, но вы можете указать и другую подопцию - * - roi
одновременно.

При использовании -рыбак-z вариант, вывод НЕ является Z-оценкой, это artanh (r), чтобы
проделайте дальнейшие вычисления на этом выходе, рассмотрите возможность использования -cifti-математика.

Ограничение использования памяти заставит его вычислять вывод по частям, и если
размер входного файла превышает 70% от лимита памяти, он также будет прочитан
входной файл, поскольку требуются строки, что приводит к нескольким проходам через вход
файл (один раз на кусок). Ограничение памяти не обязательно должно быть целым числом, вы также можете
укажите 0 для вычисления одной выходной строки за раз (это может быть очень медленным).

-cifti-корреляция-градиент СООТВЕТСТВУЙТЕ СИФТИ-РЯДЫ И ПРИНИМАЙТЕ ГРАДИЕНТ

wb_command -cifti-корреляция-градиент

- вход cifti - output - вывод cifti

[-left-surface] - указать левую поверхность для использования

- напильник левой поверхности

[-left-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо вычислений

их с левой поверхности - исправленные вершинные площади, как метрика

[-right-surface] - указать правильную поверхность для использования

- файл правой поверхности

[-right-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо вычислений

их с правильной поверхности - исправленные вершинные площади, как метрика

[-cerebellum-surface] - укажите поверхность мозжечка для использования

- файл поверхности мозжечка

[-cerebellum-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо

вычисляя их с поверхности мозжечка - исправленная вершина
площади, как метрика

[-surface-presmooth] - сгладить поверхность перед вычислением

градиент - сигма для сглаживания гауссовой поверхности

ядро, в мм

[-volume-presmooth] - сгладить объем перед вычислением градиента

- сигма для ядра сглаживания гауссова объема,

в мм

[-undo-fisher-z] - применить обратное преобразование малого z Фишера к

вход

[-fisher-z] - применить преобразование малого z Фишера к корреляциям.

перед тем, как взять градиент

[-surface-exclude] - исключить вершины возле каждой исходной вершины из

вычисление - геодезическое расстояние от исходной вершины для исключения

зона, в мм

[-volume-exclude] - исключить воксели возле каждого исходного вокселя из расчета

- расстояние от семенного вокселя для зоны отчуждения, мм

[-covariance] - вычислить ковариацию вместо корреляции

[-mem-limit] - ограничить использование памяти

- лимит памяти в гигабайтах

Для каждой структуры вычислите корреляцию строк в структуре и возьмите
градиенты результирующих строк, затем усредните их. Ограничение памяти не требуется
чтобы быть целым числом, вы также можете указать 0, чтобы использовать как можно меньше памяти (это
может быть очень медленным).

-cifti-create-плотный-из-шаблона СОЗДАЙТЕ CIFTI С СООТВЕТСТВУЮЩЕЙ ПЛОТНОЙ КАРТОЙ

wb_command -cifti-create-плотный-из-шаблона

- файл для соответствия мозговым координатам - вывод -
выходной файл cifti

[-series] - создать файл dtseries вместо dscalar

- приращение между точками серии - начальное значение серии

[-unit] - выбрать единицу для серии (по умолчанию SECOND)

- идентификатор объекта

[-volume-all] - указать файл входного тома для всех данных вокселей

- файл входного тома

[-from-cropped] - ввод обрезается до размера данных вокселя.

в файле шаблона

[-cifti] - repeatable - использовать входные данные из файла cifti

- cifti файл, содержащий входные данные

[-metric] - repeatable - использовать входные данные из файла метрики

- в какую структуру поместить файл метрики - Вход
метрический файл

[-label] - repeatable - использовать входные данные из файлов меток поверхностей

- в какую структуру поместить файл метки - метка входа
файл

[-volume] - repeatable - использовать файл тома для одного тома

данные структуры - в какую структуру поместить файл тома
- файл входного тома

[-from-cropped] - ввод обрезается до размера тома

Структура

Эта команда поможет вам создать новый файл dscalar, dtseries или dlabel cifti, который
соответствует пространству мозга, используемому в другом файле cifti. Файл шаблона должен
иметь желаемое пространство координат мозга в отображении вдоль направления столбца (для
dtseries, dscalar, dlabel и симметричный dconn это всегда так). Все ввод
Файлы cifti должны иметь сопоставление моделей мозга по столбцу и использовать тот же объем
пространство и / или вершины поверхности считаются шаблоном для структур, которые они содержат.
Если какие-либо входные файлы содержат данные меток, то входные файлы с данными, не являющимися метками, не
разрешено, и -серии вариант не может быть использован.

Любая структура, не охваченная входом, заполняется нулями или немаркированной
.

В аргумент -метрический, -этикетка or -VOLUME должен быть одним из
следующие:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT МОЗЖОЧЕК ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT КОРА
DIENCEPHALO_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALO_VENTRAL_RIGHT ГИППОКАМПУС_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

Аргумент в пользу -единица измерения должно быть одним из следующих:

РАДИАН ВТОРОЙ ГЕРЦОМЕТРА

-cifti-create-плотный-скаляр СОЗДАТЬ СКАЛЯРНЫЙ ФАЙЛ CIFTI DENSE

wb_command -cifti-create-плотный-скаляр

- output - выходной файл cifti

[-volume] - составляющая объема

- файл тома, содержащий все данные вокселей для всего тома

структур

- файл тома этикеток, содержащий метки для cifti

структур

[-left-metric] - метрика для левой поверхности

- файл метрики

[-roi-left] - корень вершин для использования с левой поверхности

- ROI в виде файла метрики

[-right-metric] - метрика для левой поверхности

- файл метрики

[-roi-right] - корень вершин для использования с правой поверхности

- ROI в виде файла метрики

[-cerebellum-metric] - метрика мозжечка

- файл метрики

[-roi-cerebellum] - диапазон вершин для использования с правой поверхности

- ROI в виде файла метрики

Все входные файлы должны иметь одинаковое количество столбцов / вложенных томов.
Только приблизительно

указанные компоненты будут в выводе cifti.
Названия карт будут

взято из одного из входных файлов.
По крайней мере, один компонент должен быть

указано.
Том этикеток должен иметь некоторые из названий этикеток из

в этом списке все остальные названия ярлыков будут проигнорированы:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT МОЗЖОЧЕК ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT КОРА
DIENCEPHALO_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALO_VENTRAL_RIGHT ГИППОКАМПУС_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-create-density-timeseries СОЗДАЙТЕ CIFTI DENSE TIMESERIES

wb_command -cifti-create-density-timeseries

- output - выходной файл cifti

[-volume] - составляющая объема

- файл тома, содержащий все данные вокселей для всего тома

структур

- файл тома этикеток, содержащий метки для cifti

структур

[-left-metric] - метрика для левой поверхности

- файл метрики

[-roi-left] - корень вершин для использования с левой поверхности

- ROI в виде файла метрики

[-right-metric] - метрика для левой поверхности

- файл метрики

[-roi-right] - корень вершин для использования с правой поверхности

- ROI в виде файла метрики

[-cerebellum-metric] - метрика мозжечка

- файл метрики

[-roi-cerebellum] - диапазон вершин для использования с правой поверхности

- ROI в виде файла метрики

[-timestep] - установить временной шаг

- временной шаг в секундах (по умолчанию 1.0)

[-timestart] - установить время начала

- время первого кадра в секундах (по умолчанию 0.0)

[-unit] - использовать другую единицу, кроме времени

- идентификатор объекта (по умолчанию SECOND)

Все входные файлы должны иметь одинаковое количество столбцов / вложенных томов.
Только приблизительно

указанные компоненты будут в выводе cifti.
Хотя бы один

компонент должен быть указан.
На этикетке тома должны быть

имена меток из этого списка, все остальные имена меток будут проигнорированы:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT МОЗЖОЧЕК ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT КОРА
DIENCEPHALO_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALO_VENTRAL_RIGHT ГИППОКАМПУС_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

The -единица измерения option принимает эти значения:

РАДИАН ВТОРОЙ ГЕРЦОМЕТРА

-cifti-создать-метку СОЗДАТЬ ФАЙЛ CIFTI LABEL

wb_command -cifti-создать-метку

- output - выходной файл cifti

[-volume] - составляющая объема

- файл тома, содержащий данные этикетки - метка
файл тома с именами структур cifti для

определить объем посылки

[-left-label] - файл метки для левой поверхности

- файл с этикеткой

[-roi-left] - корень вершин для использования с левой поверхности

- ROI в виде файла метрики

[-right-label] - метка для левой поверхности

- файл с этикеткой

[-roi-right] - корень вершин для использования с правой поверхности

- ROI в виде файла метрики

[-cerebellum-label] - метка мозжечка

- файл с этикеткой

[-roi-cerebellum] - диапазон вершин для использования с правой поверхности

- ROI в виде файла метрики

Все входные файлы должны иметь одинаковое количество столбцов / вложенных томов.
Только приблизительно

указанные компоненты будут в выводе cifti.
Хотя бы один

компонент должен быть указан.

The -VOLUME возможность -cifti-создать-метку требует двух аргументов объема,
аргумент label-volume содержит все метки, которые вы хотите отобразить (например, ядра
таламус), тогда как аргумент объема посылки включает все структуры CIFTI, которые вы
хотите включить данные (например, THALAMUS_LEFT, THALAMUS_RIGHT). Если ты просто хочешь
метки в вокселях должны быть именами структур, вы можете использовать один и тот же файл для обоих
аргументы. Объем посылки должен использовать некоторые названия этикеток из этого списка, все
другие названия этикеток в объеме посылки будут проигнорированы:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT МОЗЖОЧЕК ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT КОРА
DIENCEPHALO_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALO_VENTRAL_RIGHT ГИППОКАМПУС_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-создать-скалярный ряд ИМПОРТ ДАННЫХ СЕРИИ В CIFTI

wb_command -cifti-создать-скалярный ряд

- входной файл - output - выходной файл cifti

[-transpose] - использовать, если строки текстового файла расположены вдоль скаляра

измерение

[-name-file] - использовать текстовый файл для задания имен в скалярном измерении

- текстовый файл, содержащий имена, по одному в строке

[-series] - установить единицы и значения серии

- единица для использования - значение в точке первой серии - в
интервал между точками серии

Преобразуйте текстовый файл, содержащий серии одинаковой длины, в файл cifti. Текст
в файле должны быть строки, состоящие из чисел, разделенных пробелами, без дополнительных
новые строки между строками.

В аргумент должен быть одним из следующих:

РАДИАН ВТОРОЙ ГЕРЦОМЕТРА

-cifti-взаимная корреляция СВЯЗЬ CIFTI-ФАЙЛ С ДРУГИМ CIFTI-ФАЙЛОМ

wb_command -cifti-взаимная корреляция

- первый входной файл cifti - второй входной файл cifti
- output - выходной файл cifti

[-weights] - указать веса столбцов

- текстовый файл, содержащий по одному весу на столбец

[-fisher-z] - применить малое z-преобразование Фишера (например, artanh) к корреляции.

[-mem-limit] - ограничить использование памяти

- лимит памяти в гигабайтах

Соотносит каждую рану в с каждой строкой в .
The

отображение вдоль столбцов в становится сопоставлением строк в выходных данных.

При использовании -рыбак-z вариант, вывод НЕ является Z-оценкой, это artanh (r), чтобы
проделайте дальнейшие вычисления на этом выходе, рассмотрите возможность использования -cifti-математика.

Ограничение использования памяти заставит его вычислять вывод по частям,
читая многократно.

-цифти-расширять РАСШИРЯТЬ ФАЙЛ CIFTI

wb_command -цифти-расширять

- входной файл cifti - по какому измерению расширяться,
СТРОКА или КОЛОННА - расстояние расширения на поверхностях, в мм
- расстояние до расширения в объеме, мм -
output - выходной файл cifti

[-left-surface] - указать левую поверхность для использования

- напильник левой поверхности

[-left-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо вычислений

их с левой поверхности - исправленные вершинные площади, как метрика

[-right-surface] - указать правильную поверхность для использования

- файл правой поверхности

[-right-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо вычислений

их с правильной поверхности - исправленные вершинные площади, как метрика

[-cerebellum-surface] - укажите поверхность мозжечка для использования

- файл поверхности мозжечка

[-cerebellum-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо

вычисляя их с поверхности мозжечка - исправленная вершина
площади, как метрика

[-bad-brainordinate-roi] - укажите время действия мозговых координат для перезаписи,

а не нули - файл cifti dscalar или dtseries, положительные значения
обозначать

мозговые координаты, чтобы их ценности были заменены

[-nearest] - использовать ближайшее значение при расширении немаркированных данных

[-merged-volume] - обрабатывать компоненты тома, как если бы они были единым целым

компонент

Для всех значений данных, обозначенных как плохие, если они соседствуют с хорошим значением или находятся в пределах
указанное расстояние хорошего значения в той же модели, замените значение
со средневзвешенным значением расстояния ближайших хороших ценностей, в противном случае установите значение на
нуль. Если -ближайший указан, он будет использовать значение из ближайшего хорошего значения
в пределах диапазона вместо средневзвешенного.

. Параметры - * - исправленных областей предназначены для расширения в среднем по группе.
поверхности, но это лишь приблизительная поправка на уменьшение структуры
в группе средняя поверхность.

If -плохой-мозговой-рои указано, все значения, в том числе со значением
ноль, являются хорошими, за исключением местоположений с положительным значением в ROI. Если это
не указано, только значения, равные нулю, являются плохими.

-cifti-оценка-fwhm ОЦЕНИТЬ ГЛАДКОСТЬ ФАЙЛА CIFTI FWHM

wb_command -cifti-оценка-fwhm

- входной файл cifti

[-merged-volume] - обрабатывать компоненты тома, как если бы они были единым целым

компонент

[-column] - выводить оценки только для одного столбца

- номер столбца

[-surface] - repeatable - указать входную поверхность

- для какой структуры использовать эту поверхность - поверхностный файл

Оцените плавность компонентов файла cifti, распечатав оценки
на стандартный вывод. Если -компонентный том используется, все воксели используются как единый
компонент, а не разделенный структурой.

должно быть одним из следующих:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT МОЗЖОЧЕК ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT КОРА
DIENCEPHALO_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALO_VENTRAL_RIGHT ГИППОКАМПУС_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-экспорт-плотное отображение ЗАПИСАТЬ ИНДЕКС В НАСТРОЙКУ ЭЛЕМЕНТОВ КАК ТЕКСТ

wb_command -cifti-экспорт-плотное отображение

- файл cifti - в каком направлении экспортировать отображение,
СТРОКА или КОЛОННА

[-volume-all] - экспортировать отображение всех вокселей

- output - выходной текстовый файл

[-no-cifti-index] - не записывать индекс cifti в выходной файл

[-structure] - записать структуру, которой принадлежит каждый воксель в выводе

файл

[-surface] - repeatable - экспортировать отображение одной поверхностной структуры

- структура для вывода - output - выходной текстовый файл

[-no-cifti-index] - не записывать индекс cifti в выходной файл

[-volume] - repeatable - экспортировать отображение структуры одного тома

- структура для вывода - output - выходной текстовый файл

[-no-cifti-index] - не записывать индекс cifti в выходной файл

Эта команда создает текстовые файлы, описывающие отображение индексов cifti в
вершины поверхности или воксели. Все индексы отсчитываются от нуля. Формат по умолчанию для
-поверхностью это строки вида:



Формат по умолчанию для -VOLUME и -объем-все это строки вида:



-cifti-экстремумы НАЙДИТЕ ЭКСТРЕМАЛЬНЫЙ ФАЙЛ В CIFTI-ФАЙЛЕ

wb_command -cifti-экстремумы

- вход cifti - минимальное расстояние между экстремумами
того же самого

тип, для поверхностных компонентов

- минимальное расстояние между экстремумами одного и того же

тип, для объемных компонентов

- по какому измерению искать экстремумы, СТРОКА или КОЛОННА -
output - вывод cifti

[-left-surface] - указать левую поверхность для использования

- напильник левой поверхности

[-right-surface] - указать правильную поверхность для использования

- файл правой поверхности

[-cerebellum-surface] - укажите поверхность мозжечка для использования

- файл поверхности мозжечка

[-surface-presmooth] - сгладить по поверхности до нахождения экстремумов

- сигма для сглаживания гауссовой поверхности

ядро, в мм

[-volume-presmooth] - сглаживание компонентов объема до нахождения экстремумов

- сигма для ядра сглаживания гауссова объема,

в мм

[-threshold] - игнорировать мелкие экстремумы

- наибольшее значение, которое следует рассматривать как минимум - самый маленький
значение, которое следует учитывать как максимальное

[-merged-volume] - обрабатывать компоненты тома, как если бы они были единым целым

компонент

[-sum-maps] - выводить сумму карт экстремумов вместо каждой карты

отдельно

[-consolidate-mode] - использовать консолидацию локальных минимумов вместо

большой район

[-only-maxima] - найти только максимумы

[-only-minima] - найти только минимумы

Находит пространственные местоположения в файле cifti, которые имеют более экстремальные значения, чем все
близлежащие места в одном и том же компоненте (поверхностная или объемная структура). Вход
Файл cifti должен иметь отображение моделей мозга в указанном направлении. СТОЛБЕЦ
это направление, которое работает на dtseries и dscalar. Для dconn, если он симметричный
используйте COLUMN, иначе используйте ROW.

-cifti-ложная корреляция СРАВНИТЕ КОРРЕЛЯЦИЮ ЛОКАЛЬНО И ПОСРЕДСТВОМ / ЧЕРЕЗ SULCI / GYRI

wb_command -cifti-ложная корреляция

- файл cifti для корреляции <3D-dist> - максимальное расстояние в 3D
чтобы проверить каждую вершину - максимальное геодезическое расстояние для использования
близлежащий

корреляция

- минимальное геодезическое расстояние для соседних

корреляция

- output - выходной файл cifti dscalar

[-left-surface] - указать левую поверхность для использования

- напильник левой поверхности

[-dump-text] - выгрузить необработанные измерения, используемые в текстовый файл

- выходной текстовый файл

[-right-surface] - указать правильную поверхность для использования

- файл правой поверхности

[-dump-text] - выгрузить необработанные измерения, используемые в текстовый файл

- выходной текстовый файл

[-cerebellum-surface] - укажите поверхность мозжечка для использования

- файл поверхности мозжечка

[-dump-text] - выгрузить необработанные измерения, используемые в текстовый файл

- выходной текстовый файл

Для каждой вершины вычислите среднюю корреляцию в диапазоне геодезических
расстояния, которые не пересекают борозду / извилину, и корреляция с ближайшим
вершина пересекает борозду / извилину. Считается, что вершина пересекает борозду / извилину, если
3D-расстояние составляет менее трети геодезического расстояния. Выходной файл
содержит соотношение между этими корреляциями и некоторые дополнительные карты, чтобы помочь
объясните соотношение.

-cifti-find-кластеры КЛАСТЕРЫ ФИЛЬТРОВ ПО ПЛОЩАДИ / ОБЪЕМУ

wb_command -cifti-find-кластеры

- вход cifti - порог для данных о поверхности
ценности - порог площади кластера поверхности, мм ^ 2
- порог для значений объемных данных -
порог размера кластера объема, мм ^ 3 - какой размер использовать для
пространственная информация, ROW или

КОЛОНКА

- output - вывод cifti

[-less-than] - найти значения меньше чем , скорее, чем

большой

[-left-surface] - указать левую поверхность для использования

- напильник левой поверхности

[-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо их вычисления

с поверхности - исправленные вершинные площади, как метрика

[-right-surface] - указать правильную поверхность для использования

- файл правой поверхности

[-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо их вычисления

с поверхности - исправленные вершинные площади, как метрика

[-cerebellum-surface] - укажите поверхность мозжечка для использования

- файл поверхности мозжечка

[-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо их вычисления

с поверхности - исправленные вершинные площади, как метрика

[-cifti-roi] - искать только в интересующих регионах

- регионы для поиска в виде файла cifti

[-merged-volume] - обрабатывать компоненты тома, как если бы они были единым целым

компонент

[-size-ratio] - игнорировать кластеры меньше заданной доли

самый большой кластер в структуре - доля конструкции
самая большая площадь кластера - доля самого большого кластера структуры
объем

[-distance] - игнорировать кластеры дальше заданного расстояния от объекта

самый большой кластер в структуре - насколько далеко от самого большого
кластер кластер может

be, от края до края, в мм

- насколько далеко от самого большого кластера может быть кластер,

от края до края, в мм

[-start] - начать размечать кластеры со значения, отличного от 1

- значение для первого найденного кластера

Выводит файл cifti с ненулевыми целыми числами для всех координат мозга в большом
достаточно кластера, а нули в другом месте. Целые числа обозначают членство в кластере (по
по умолчанию первый найденный кластер будет использовать значение 1, второй кластер 2 и т. д.). Вход
Файл cifti должен иметь отображение моделей мозга по выбранному измерению, столбцы для
.dtseries, либо для .dconn. В рентабельности инвестиций должны отображаться модели мозга.
столбцы, точно соответствующие отображению выбранного направления во входном файле.
Данные вне области интереса игнорируются.

-cifti-градиент ПРИНИМАЙТЕ ГРАДИЕНТ CIFTI-ФАЙЛА

wb_command -cifti-градиент

- вход cifti - какой размер взять градиент,
СТРОКА или КОЛОННА - output - вывод cifti

[-left-surface] - указать левую поверхность для использования

- напильник левой поверхности

[-left-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо вычислений

их с левой поверхности - исправленные вершинные площади, как метрика

[-right-surface] - указать правильную поверхность для использования

- файл правой поверхности

[-right-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо вычислений

их с правильной поверхности - исправленные вершинные площади, как метрика

[-cerebellum-surface] - укажите поверхность мозжечка для использования

- файл поверхности мозжечка

[-cerebellum-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо

вычисляя их с поверхности мозжечка - исправленная вершина
площади, как метрика

[-surface-presmooth] - сгладить поверхность перед вычислением

градиент - сигма для сглаживания гауссовой поверхности

ядро, в мм

[-volume-presmooth] - сгладить поверхность перед вычислением градиента

- сигма для ядра сглаживания гауссова объема,

в мм

[-average-output] - вывести среднее значение карты величины градиента

вместо каждой карты градиента отдельно

[-vectors] - выходные векторы градиента

- вывод - векторы, как файл dscalar

Выполняет расчет градиента для каждого компонента файла cifti и, при необходимости,
усредняет полученные градиенты. В -векторах и -средний выход варианты не могут
использоваться вместе. Вы должны указать поверхность для каждой структуры поверхности в
cifti файл. Направление COLUMN должно быть быстрее, и это направление, которое работает
на дцериес. Для dconn вам, вероятно, понадобится ROW, если вы не используете
-средний выход.

-cifti-label-смежность СОЗДАТЬ МАТРИЦУ СООТВЕТСТВИЯ ФАЙЛА С ЭТИКЕТКОЙ CIFTI

wb_command -cifti-label-смежность

- входной файл метки cifti - output - вывод cifti
матрица смежности pconn

[-left-surface] - указать левую поверхность для использования

- напильник левой поверхности

[-right-surface] - указать правильную поверхность для использования

- файл правой поверхности

[-cerebellum-surface] - укажите поверхность мозжечка для использования

- файл поверхности мозжечка

Найдите смежные с гранью воксели и связанные вершины с разными значениями меток,
и посчитайте их для каждой пары. Поместите полученные подсчеты в разбитый на части
файл подключения с нулевой диагональю. Это дает приблизительную оценку
насколько длинна или широка граница между двумя ярлыками.

-cifti-label-export-таблица ЭКСПОРТ ТАБЛИЦЫ ИЗ CIFTI КАК ТЕКСТ

wb_command -cifti-label-export-таблица

- входной файл метки cifti - номер или название карты меток
использовать - output - выходной текстовый файл

Берет таблицу меток из карты меток cifti и записывает ее в текстовый формат
соответствие тому, что ожидается -cifti-метка-импорт.

-cifti-метка-импорт СОЗДАТЬ ФАЙЛ CIFTI LABEL ИЗ ФАЙЛА CIFTI

wb_command -cifti-метка-импорт

- входной файл cifti - текстовый файл, содержащий значения
и названия для этикеток - output - выходной файл метки cifti

[-discard-others] - установить любые значения, не упомянутые в списке меток, в

??? метка

[-unlabeled-value] - установить значение, которое будет интерпретироваться как немаркированное

- числовое значение для немаркированного (по умолчанию 0)

[-drop-unused-labels] - удалить все неиспользуемые значения метки из метки.

(см. таблицу ниже)

Создает файл метки cifti из файла cifti со значениями, подобными метке.


может указать пустую строку ('' будет работать на linux / mac) для ,
который будет рассматриваться как пустой файл. Файл со списком этикеток должен иметь
строки следующего формата:



Не указывайте в файле "немаркированный" ключ, предполагается, что 0 означает не
помечены, если -непомеченное-значение указан. Имена ярлыков должны быть на отдельном
строка, но может содержать пробелы или другие необычные символы (но не новую строку).
Пробелы удаляются с обоих концов имени метки, но сохраняются, если они находятся в
середина этикетки. Значения красного, зеленого, синего и альфа должны быть целыми числами от
От 0 до 255, и будет указывать цвет, которым будет нарисована метка (альфа 255 означает
непрозрачный, что, вероятно, вам и нужно). По умолчанию он устанавливает новые имена меток.
с именами LABEL_ # для любых встреченных значений, не упомянутых в списке
файл, укажите -discard-другие вместо этого установить для них «немаркированный» ключ.

-cifti-label-to-roi СДЕЛАЙТЕ ЭТИКЕТКУ CIFTI В Рентабельность инвестиций

wb_command -cifti-label-to-roi

- входной файл метки cifti - output - вывод cifti
скалярный файл

[-name] - выбрать ярлык по названию

- название лейбла, рентабельность которого вы хотите получить

[-key] - выбрать ярлык по клавише

- ключ ярлыка, рентабельность которого вы хотите получить

[-map] - выбрать одну карту меток для использования

- номер карты или название

Для каждой карты в , карта создается в где все локации
с надписью или с ключом дается значение 1, а
всем остальным локациям присваивается 0. Ровно одно из -имя и -ключ необходимо указать.
Указывать -map использовать только одну карту из .

-cifti-математика ОЦЕНИТЬ ВЫРАЖЕНИЕ В ФАЙЛАХ CIFTI

wb_command -cifti-математика

- выражение для оценки, в кавычках - вывод -
выходной файл cifti

[-fixnan] - заменить NaN результат на значение

- значение для замены NaN на

[-override-mapping-check] - не проверять сопоставления на совместимость,

только проверить длину

[-var] - repeatable - файл cifti для использования в качестве переменной

- имя переменной, используемое в выражении - сифти
файл для использования в качестве этой переменной

[-select] - repeatable - выбрать один индекс из измерения

- размер для выбора (на основе 1) - индекс для использования (на основе 1)

[-repeat] - повторять выбранные значения для каждого индекса вывода в

это измерение

Эта команда оценивает на каждом элементе матрицы независимо. Там
должен быть хотя бы один -вар вариант (чтобы получить макет вывода), даже если
указанное в нем не используется в .

Чтобы выбрать один столбец из 2D-файла (большинство файлов cifti 2D), используйте -Выбрать 1
, куда основан на 1. Чтобы выбрать одну строку из 2D-файла, используйте
-Выбрать 2 . Где -Выбрать не используется, файлы cifti должны иметь совместимые
сопоставления (например, сопоставления моделей мозга и участков должны точно совпадать, за исключением
названия посылок). Использовать -override-сопоставление-проверка чтобы пропустить эту проверку.

Имена файлов недействительны в используйте имя переменной и -вар вариант с
соответствие чтобы указать входной файл. Формат как есть
следующим образом:

Выражения состоят из констант, переменных, операторов, скобок и функций,
в инфиксной записи, например, ехр (-x + 3) * масштаб '. Переменные - это строки любого
длина, используя символы az, AZ, 0-9 и _, но не может принимать имя
именованная константа. В настоящее время существует только одна именованная константа, PI. Операторы
- это +, -, *, /, ^,>, <,> =, <=, ==,! =,!, &&, ||. Они ведут себя как в C, за исключением
что ^ - это возведение в степень, то есть pow (x, y), и имеет более высокий приоритет, чем другие
бинарные операторы (также '-3 ^ -4 ^ -5' означает '- (3 ^ (- (4 ^ -5)))'). Знаки <=,> =, == и! =
операторам предоставляется небольшое пространство для маневра, равное одной миллионной части
меньшее из абсолютных значений сравниваемых значений.

Операторы сравнения и логические операторы возвращают 0 или 1, вы можете выполнять маскировку с помощью выражений.
как 'x * (маска> 0)'. Для всех логических операторов вход считается истинным, если и только если
он больше 0. Выражение «0 <x <5» синтаксически не ошибочно, но
он НЕ будет делать то, что требуется, потому что он оценивается слева направо, т.е. '((0
x) <5) ', который всегда будет возвращать 1, поскольку оба возможных результата сравнения
меньше 5. При обнаружении выражения этого типа выдается предупреждение.
Используйте что-то вроде 'x> 0 && x <5', чтобы получить желаемое поведение.

Пробелы между элементами игнорируются, sin (2 * x) эквивалентно
'sin (2 * x)', но 's in (2 * x)' является ошибкой. Подразумеваемое умножение не допускается,
выражение «2x» будет проанализировано как переменная. Круглые скобки (), не использовать
[] или {}. Функции требуют скобок, выражение «sin x» является ошибкой.

Поддерживаются следующие функции:

sin: 1 аргумент, синус аргумента (единицы - радианы) cos: 1 аргумент,
косинус аргумента (единицы - радианы) tan: 1 аргумент, тангенс
аргумент (единицы - радианы) asin: 1 аргумент, обратный синусу аргумента,
в радианах acos: 1 аргумент, величина, обратная косинусу аргумента, в радианах
atan: 1 аргумент, величина, обратная тангенсу аргумента, в радианах atan2: 2
аргументов, atan2 (y, x) возвращает значение, обратное касательной к

(y / x) в радианах, определяя квадрант по знаку обоих аргументов

аргумент sinh: 1, гиперболический синус аргумента cosh: 1 аргумент,
гиперболический косинус аргумента tanh: 1 аргумент, гиперболический тангенс аргумента
аргумент asinh: 1 аргумент, обратный гиперболический синус аргумента acosh: 1
аргумент, обратный гиперболический косинус аргумента atanh: 1 аргумент,
обратный гиперболочный тангенс аргумента ln: 1 аргумент, натуральный логарифм
аргумент exp: 1 аргумент, константа e возведена в степень аргумента
log: 1 аргумент, десятичный логарифм аргумента sqrt: 10 аргумент, квадрат
корень аргумента abs: 1 аргумент, абсолютное значение аргумента floor: 1
аргумент, наибольшее целое число, не большее, чем аргумент round: 1 аргумент,
ближайшее целое число с округлением связей от

нуль

ceil: 1 аргумент, наименьшее целое число не меньше аргумента min: 2 аргумента,
min (x, y) возвращает y, если (x> y), x иначе max: 2 аргумента, max (x, y) возвращает y
if (x <y), x иначе mod: 2 аргумента, mod (x, y) = x - y * floor (x / y) или 0, если
y == 0 ограничение: 3 аргумента, ограничение (x, low, high) = min (max (x, low), high)

-cifti-слияние ОБЪЕДИНЕНИЕ ФАЙЛОВ CIFTI TIMESERIES, SCALAR ИЛИ ЯРЛЫКОВ

wb_command -cifti-слияние

- output - выходной файл cifti

[-cifti] - repeatable - указать входной файл cifti

- файл cifti для использования столбцов из

[-column] - repeatable - выберите один столбец для использования

- индекс столбца (начиная с 1)

[-up-to] - использовать полный диапазон столбцов

- индекс последнего столбца, который нужно включить

[-reverse] - использовать диапазон в обратном порядке

Для заданных входных файлов CIFTI, которые имеют совпадающие сопоставления по столбцам и для которых
сопоставления по строкам имеют один и тот же тип, все серии, скаляры или метки, это
команда объединяет указанные столбцы по горизонтали (строки становятся длиннее).

Пример: wb_command -cifti-слияние out.dtseries.nii -чифти первый.dtseries.nii -колонка
1 -чифти второй.dtseries.nii

В этом примере будет использоваться первый столбец из first.dtseries.nii, за которым следуют все
столбцы из second.dtseries.nii и запишите эти столбцы в out.dtseries.nii.

-cifti-merge-плотный ОБЪЕДИНЕНИЕ ФАЙЛОВ CIFTI ПО ПЛОТНОМУ РАЗМЕРУ

wb_command -cifti-merge-плотный

- по какому измерению объединить, СТРОКА или КОЛОННА - выход -
выходной файл cifti

[-cifti] - repeatable - указать входной файл cifti

- файл cifti для слияния

Входные файлы cifti должны иметь соответствующие сопоставления в направлении, а не
указано, и отображение в указанном направлении должно быть моделями мозга.

-cifti-парная-корреляция СООТВЕТСТВУЙТЕ ПАРНЫМ РЯДАМ ДВУХ ФАЙЛОВ CIFTI

wb_command -cifti-парная-корреляция

- первый входной файл cifti - второй входной файл cifti
- output - выходной файл cifti

[-fisher-z] - применить малое z-преобразование Фишера (например, artanh) к корреляции.

Для каждой строки в , сопоставьте его с той же строкой в , и поставьте
результат в той же строке , в котором есть только один столбец.

-cifti-палитра НАСТРОИТЬ ПАЛИТРУ НА ФАЙЛ CIFTI

wb_command -cifti-палитра

- вход cifti - режим отображения - вывод -
выходной файл cifti

[-column] - выбрать один столбец для скалярных карт.

- номер или название столбца

[-pos-percent] - мин / макс процент для положительной раскраски данных

- процентиль для наименее положительных данных - в
процентиль для наиболее положительных данных

[-neg-percent] - мин / макс процент для раскраски негативных данных

- процентиль для наименее отрицательных данных - в
процентиль для наиболее отрицательных данных

[-pos-user] - пользовательские минимальные / максимальные значения для положительной раскраски данных

- значение наименее положительных данных - Значение
за самые положительные данные

[-neg-user] - пользовательские минимальные / максимальные значения для раскраски отрицательных данных

- значение для наименее отрицательных данных - Значение
для самых негативных данных

[-interpolate] - интерполировать цвета

- логическое значение, следует ли интерполировать

[-disp-pos] - отображать положительные данные

- логическое значение, отображать ли

[-disp-neg] - отображать положительные данные

- логическое значение, отображать ли

[-disp-zero] - отображать данные ближе к нулю, чем минимальная отсечка

- логическое значение, отображать ли

[-palette-name] - установить используемую палитру

- название палитры

[-thresholding] - установить порог

- установка порога - показывать значения внутри или вне пороговых значений
- нижний порог - верхний порог

ПРИМЕЧАНИЕ. Выходной файл должен отличаться от входного файла.

Для скалярных карт по умолчанию палитра меняется для каждой карты, укажите -колонка
изменить только одну карту. Не указанные настройки палитры будут взяты из
первый столбец для скалярных карт и из существующей файловой палитры для других карт
типы. В аргумент должен быть одним из следующих:

MODE_AUTO_SCALE MODE_AUTO_SCALE_ABSOLUTE_PERCENTAGE MODE_AUTO_SCALE_PERCENTAGE
MODE_USER_SCALE

В аргумент -имя-палитры должно быть одним из следующих:

PSYCH PSYCH-NO-NONE ROY-BIG ROY-BIG-BL Оранжевый-желтый Gray_Interp_Positive
Gray_Interp clear_brain videen_style фидл raich4_clrmid raich6_clrmid HSB8_clrmid
RBGYR20 RBGYR20P POS_NEG красно-желтый сине-голубой FSL power_surf fsl_red fsl_green
fsl_blue fsl_yellow JET256

В аргумент -пороговая обработка должно быть одним из следующих:

THRESHOLD_TYPE_OFF THRESHOLD_TYPE_NORMAL

В аргумент -пороговая обработка должно быть одним из следующих:

THRESHOLD_TEST_SHOW_OUTSIDE THRESHOLD_TEST_SHOW_INSIDE

-cifti-отображение-участка-на-метку СОЗДАТЬ DLABEL ИЗ РАЗДЕЛЕННОГО ФАЙЛА

wb_command -cifti-отображение-участка-на-метку

- входной парцеллированный файл - какое измерение взять
карта участков из, СТРОКА или КОЛОНКА - cifti файл с желаемым
плотное отображение вдоль

обзор

- output - выходной файл плотной этикетки

Эта команда выведет файл dlabel, полезный для того же разбора на
еще один плотный файл.

Для ptseries, pscalar, plabel, pconn и pdconn использование ROW для буду
Работа.

-cifti-посылка ПАРСЕЛЛИРУЙТЕ CIFTI-ФАЙЛ

wb_command -cifti-посылка

- файл cifti для парцелляции - файл этикеток cifti для использования
для посылки - какое отображение на parcellate, ROW или COLUMN
- output - выходной файл cifti

Каждая этикетка в файле этикеток cifti будет рассматриваться как посылка, а все строки или
столбцы в пределах участка усредняются вместе для формирования выходной строки или столбца.
Если указан ROW, то входное сопоставление по строкам должно быть мозговыми координатами, и
выходное сопоставление по строкам будет участками, то есть столбцы будут усреднены
вместе. Для dtseries или dscalar используйте COLUMN.

-cifti-уменьшить ВЫПОЛНЯЙТЕ ОПЕРАЦИЮ РЕДУКЦИИ ПО РЯДКАМ CIFTI

wb_command -cifti-уменьшить

- файл cifti для уменьшения - оператор сокращения для использования
- output - выходной файл cifti

[-exclude-outliers] - исключать выбросы из каждой строки по стандарту

отклонение - количество стандартных отклонений ниже среднего до

включают

- количество стандартных отклонений выше среднего до

включают

Для каждой строки cifti принимает данные вдоль строки как вектор и выполняет
указанное сокращение на нем, поместив результат в единственный выходной столбец в этом
ряд. Операторы редукции следующие:

MAX: максимальное значение MIN: минимальное значение INDEXMAX: отсчитываемый от 1 индекс
максимальное значение INDEXMIN: отсчитываемый от 1 индекс минимального значения SUM: сложить все значения
ПРОДУКТ: умножить все значения MEAN: среднее значение данных STDEV: стандарт
отклонение (знаменатель N) SAMPSTDEV: стандартное отклонение выборки (N-1
знаменатель) РАЗБИРАТЕЛЬНОСТЬ: дисперсия данных. МЕДИАНА: медиана данных.
MODE: режим данных COUNT_NONZERO: количество ненулевых элементов в
данным

-cifti-переупорядочить ПЕРЕЗАКАЗАТЬ ОТПРАВКИ ИЛИ СКАЛЯРНЫЕ КАРТЫ / ЭТИКЕТКИ В ФАЙЛЕ CIFTI

wb_command -cifti-переупорядочить

- входной парцеллированный файл cifti - какой размер изменить
вдоль, СТРОКА или КОЛОННА - текстовый файл, содержащий желаемый порядок
трансформация - output - переупорядоченный файл cifti

Отображение в указанном направлении должно быть участками, скалярами или метками. Для
pscalar или ptseries, используйте COLUMN для изменения порядка посылок. Для dlabel используйте ROW. В
файл должен содержать индексы с отсчетом от 1, разделенные пробелами (пробелы,
новые строки, вкладки и т. д.), с таким количеством индексов, как имеет в указанном
измерение. Эти индексы указывают, какой текущий индекс должен оказаться в этом
позиции, например, если текущий заказ - 'ABC D', а желаемый порядок -
«DAB C», текстовый файл должен содержать «4 1 2 3».

-cifti-replace-структура ЗАМЕНА ДАННЫХ В СТРУКТУРЕ В ФАЙЛЕ CIFTI

wb_command -cifti-replace-структура

- cifti для модификации - какое измерение интерпретировать как
одиночная карта, СТРОКА или КОЛОНКА

[-volume-all] - заменить данные во всех компонентах тома

- входной объем

[-from-cropped] - ввод обрезается до размера данных

[-discard-unused-labels] - при работе с файлом dlabel отбрасывать любые

неиспользуемые ключи меток из таблицы меток

[-label] - repeatable - заменить данные в компоненте метки поверхности

- структура для замены данных - входной файл метки

[-metric] - repeatable - заменить данные в поверхностном компоненте

- структура для замены данных - входная метрика

[-volume] - repeatable - заменить данные в компоненте тома

- структура для замены данных - входной объем

[-from-cropped] - ввод обрезается до размера компонента

Вы должны указать хотя бы один из -метрический, -этикетка, -VOLUME или -объем-все для этого
команда делать что угодно. Входные объемы должны совпадать с выходными
-cifti-отдельный. Для dtseries / dscalar используйте COLUMN, и если ваша матрица будет
полностью симметричный, COLUMN более эффективен. Аргумент структуры должен быть одним из
следующие:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT МОЗЖОЧЕК ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT КОРА
DIENCEPHALO_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALO_VENTRAL_RIGHT ГИППОКАМПУС_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-cifti-ресемпл ПЕРЕЗАГРУЗИТЕ ФАЙЛ CIFTI В НОВОМ ПРОСТРАНСТВЕ CIFTI

wb_command -cifti-ресемпл

- файл cifti для повторной выборки - направление входа
это должно быть пересчитано - файл cifti, содержащий пробел cifti
передискретизировать в - направление шаблона для использования в качестве

пространство передискретизации

- указать метод повторной выборки поверхности - указать
метод объемной интерполяции - output - выходной файл cifti

[-surface-large] - использовать наибольший вес вместо средневзвешенного, когда

делать повторную выборку поверхности

[-volume-predilate] - расширить компоненты объема перед повторной выборкой

- расстояние в мм до расширения

[-surface-postdilate] - расширять компоненты поверхности после ресэмплинга

- расстояние в мм до расширения

[-affine] - использовать аффинное преобразование для компонентов объема

- аффинный файл для использования

[-flirt] - ДОЛЖЕН использоваться, если affine является аффинным flirt.

- исходный объем, используемый при генерации аффинного
- целевой объем, используемый при генерации аффинного

[-warpfield] - использовать поле искривления на компонентах тома

- используемое варп-поле

[-fnirt] - ДОЛЖЕН использоваться при использовании fnirt warpfield

- объем источника, используемый при генерации

варпфилд

[-left-spheres] - указать сферы для передискретизации левой поверхности

- сфера с той же сеткой, что и текущая левая

поверхность

- сфера с новой левой сеткой, которая находится в регистре

с текущей сферой

[-left-area-surfs] - указать левые поверхности для создания области вершин

исправление на основе - соответствующая левая анатомическая поверхность с
текущий

сетке

- соответствующая левая анатомическая поверхность с новой сеткой

[-left-area-metrics] - указать метрики области левой вершины для выполнения области

исправление на основе - файл метрики с площадями вершин для
текущий

сетке

- файл метрики с площадями вершин для нового меша

[-right-spheres] - указать сферы для передискретизации правой поверхности

- сфера с той же сеткой, что и текущая правая

поверхность

- сфера с новой правой сеткой, которая находится в регистре

с текущей сферой

[-right-area-surfs] - указать правильные поверхности для создания вершинной области

исправление на основе - соответствующая правая анатомическая поверхность с
текущий

сетке

- актуальная правая анатомическая поверхность с новой сеткой

[-right-area-metrics] - указать метрики правой области вершины, чтобы сделать область

исправление на основе - файл метрики с площадями вершин для
текущий

сетке

- файл метрики с площадями вершин для нового меша

[-cerebellum-spheres] - указать сферы для повторной выборки поверхности мозжечка.

- сфера с той же сеткой, что и текущая

поверхность мозжечка

- сфера с новой сеткой мозжечка, которая находится в

зарегистрироваться в текущей сфере

[-cerebellum-area-surfs] - указать поверхности мозжечка для создания вершины

коррекция площади на основе - соответствующая анатомическая поверхность мозжечка


текущая сетка

- соответствующая анатомическая поверхность мозжечка с новой сеткой

[-cerebellum-area-metrics] - указать метрики площади вершины мозжечка для

сделать коррекцию площади на основе - файл метрики с площадями вершин для
текущий

сетке

- файл метрики с площадями вершин для нового меша

Выполните повторную выборку данных cifti в другое пространство, координируемое мозгом.
Используйте COLUMN для

направление пересэмплирования dscalar, dlabel или dtseries.
Передискретизация обоих

размеры dconn требуют запуска этой команды дважды, один раз с COLUMN и
один раз с ROW. Если вы передискретизируете dconn и на вашем компьютере много
памяти, вы можете подумать об использовании -cifti-resample-dconn-памяти чтобы не писать
и перечитываем промежуточный файл. Если для поверхности не указаны сферы
структура, которая существует в файлах cifti, ее данные копируются без повторной выборки или
расширение. Дилатация выполняется «ближайшим» методом и проводится на
для данных о поверхности. Компоненты объема перед расширением прокладываются так, чтобы расширение
не заходит за край ограничительной рамки компонента.

Рекомендуемые методы передискретизации: ADAP_BARY_AREA и CUBIC (кубический сплайн),
за исключением данных метки, которые должны использовать ADAP_BARY_AREA и ENCLOSING_VOXEL.

В аргумент должен быть одним из следующих:

КУБИЧЕСКАЯ ОКРУЖАЮЩАЯ_ВОКСЕЛЬНАЯ ТРИЛИНЕЙНАЯ

В аргумент должен быть одним из следующих:

ADAP_BARY_AREA БАРИЦЕНТРИЧЕСКИЙ

-cifti-resample-dconn-памяти ИСПОЛЬЗУЙТЕ МНОГО ПАМЯТИ, ЧТОБЫ ПОВТОРИТЬ DCONN

wb_command -cifti-resample-dconn-памяти

- файл cifti для повторной выборки - файл cifti, содержащий
пространство cifti для передискретизации - направление шаблона
использовать как

пространство передискретизации

- указать метод повторной выборки поверхности - указать
метод объемной интерполяции - output - выходной файл cifti

[-surface-large] - использовать наибольший вес вместо средневзвешенного, когда

делать повторную выборку поверхности

[-volume-predilate] - расширить компоненты объема перед повторной выборкой

- расстояние в мм до расширения

[-surface-postdilate] - расширять компоненты поверхности после ресэмплинга

- расстояние в мм до расширения

[-affine] - использовать аффинное преобразование для компонентов объема

- аффинный файл для использования

[-flirt] - ДОЛЖЕН использоваться, если affine является аффинным flirt.

- исходный объем, используемый при генерации аффинного
- целевой объем, используемый при генерации аффинного

[-warpfield] - использовать поле искривления на компонентах тома

- используемое варп-поле

[-fnirt] - ДОЛЖЕН использоваться при использовании fnirt warpfield

- объем источника, используемый при генерации

варпфилд

[-left-spheres] - указать сферы для передискретизации левой поверхности

- сфера с той же сеткой, что и текущая левая

поверхность

- сфера с новой левой сеткой, которая находится в регистре

с текущей сферой

[-left-area-surfs] - указать левые поверхности для создания области вершин

исправление на основе - соответствующая левая анатомическая поверхность с
текущий

сетке

- соответствующая левая анатомическая поверхность с новой сеткой

[-left-area-metrics] - указать метрики области левой вершины для выполнения области

исправление на основе - файл метрики с площадями вершин для
текущий

сетке

- файл метрики с площадями вершин для нового меша

[-right-spheres] - указать сферы для передискретизации правой поверхности

- сфера с той же сеткой, что и текущая правая

поверхность

- сфера с новой правой сеткой, которая находится в регистре

с текущей сферой

[-right-area-surfs] - указать правильные поверхности для создания вершинной области

исправление на основе - соответствующая правая анатомическая поверхность с
текущий

сетке

- актуальная правая анатомическая поверхность с новой сеткой

[-right-area-metrics] - указать метрики правой области вершины, чтобы сделать область

исправление на основе - файл метрики с площадями вершин для
текущий

сетке

- файл метрики с площадями вершин для нового меша

[-cerebellum-spheres] - указать сферы для повторной выборки поверхности мозжечка.

- сфера с той же сеткой, что и текущая

поверхность мозжечка

- сфера с новой сеткой мозжечка, которая находится в

зарегистрироваться в текущей сфере

[-cerebellum-area-surfs] - указать поверхности мозжечка для создания вершины

коррекция площади на основе - соответствующая анатомическая поверхность мозжечка


текущая сетка

- соответствующая анатомическая поверхность мозжечка с новой сеткой

[-cerebellum-area-metrics] - указать метрики площади вершины мозжечка для

сделать коррекцию площади на основе - файл метрики с площадями вершин для
текущий

сетке

- файл метрики с площадями вершин для нового меша

Эта команда выполняет то же самое, что и запуск -cifti-ресемпл дважды, но использует память
примерно в 2 раза больше размера промежуточного файла. Это
потому что промежуточный dconn хранится в памяти, а не записывается на диск, и
компоненты до и после передискретизации / расширения должны быть в памяти на
в то же время во время соответствующих вычислений. Если сферы не указаны для
структура поверхности, которая существует в файлах cifti, ее данные копируются без
повторная выборка или дилатация. Дилатация выполняется «ближайшим» методом и проводится на
для данных о поверхности. Компоненты объема заполняются перед расширением, поэтому
это расширение не доходит до края ограничительной рамки компонента.

В аргумент должен быть одним из следующих:

КУБИЧЕСКАЯ ОКРУЖАЮЩАЯ_ВОКСЕЛЬНАЯ ТРИЛИНЕЙНАЯ

В аргумент должен быть одним из следующих:

ADAP_BARY_AREA БАРИЦЕНТРИЧЕСКИЙ

-cifti-restrict-плотная карта ИСКЛЮЧИТЬ МОЗГИ ИЗ ФАЙЛА CIFTI

wb_command -cifti-restrict-плотная карта

- вход cifti - какой размер изменить отображение
on, ROW или COLUMN - output - вывод cifti

[-cifti-roi] - cifti-файл, содержащий объединенные rois

- rois как файл cifti

[-left-roi] - вершины для использования из левого полушария

- левая рентабельность инвестиций в виде файла метрики

[-right-roi] - использовать вершины из правого полушария

- правильная рентабельность инвестиций в метрический файл

[-cerebellum-roi] - используемые вершины мозжечка

- roi мозжечка как метрический файл

[-vol-roi] - воксели для использования

- файл тома roi

Пишет модифицированную версию , где все мозговые координаты вне
указанные roi удаляются из файла. Если -cifti-рои указано, никакое другое
- * - может быть указана опция рентабельности инвестиций. Если не использовать -cifti-рои, любые - * - параметры рентабельности нет
Present отбрасывает соответствующую структуру, если она присутствует во входном файле.

-cifti-roi-средний СРЕДНИЕ СТРОКИ В ОДНОМ ФАЙЛЕ CIFTI

wb_command -cifti-roi-средний

- файл cifti для усреднения строк из - выходной текстовый файл
средние значения

[-cifti-roi] - cifti-файл, содержащий объединенные rois

- rois как файл cifti

[-left-roi] - вершины для использования из левого полушария

- левая рентабельность инвестиций в виде файла метрики

[-right-roi] - использовать вершины из правого полушария

- правильная рентабельность инвестиций в метрический файл

[-cerebellum-roi] - используемые вершины мозжечка

- roi мозжечка как метрический файл

[-vol-roi] - воксели для использования

- файл тома roi

Усредните строки, которые находятся в указанных областях интереса, и запишите полученный результат
средняя строка в текстовый файл, разделенная символами новой строки. Если -cifti-рои указано,
-лефт-рой, -право-рои, -мозжечок-рои и -вол-рой не указывается.

-cifti-rois-из-экстрема СОЗДАВАЙТЕ КАРТЫ CIFTI ROI ИЗ ЭКСТРЕМАЛЬНЫХ КАРТ

wb_command -cifti-rois-из-экстрема

- вход cifti - предел геодезического расстояния от вершины, мм
- евклидово расстояние от центра вокселя, мм - который
измерение, вдоль которого находится карта экстремумов, СТРОКА или КОЛОННА - вывод - вывод
сифти

[-left-surface] - указать левую поверхность для использования

- напильник левой поверхности

[-right-surface] - указать правильную поверхность для использования

- файл правой поверхности

[-cerebellum-surface] - укажите поверхность мозжечка для использования

- файл поверхности мозжечка

[-gaussian] - генерировать гауссовские ядра вместо плоских областей интереса

- сигма для поверхностного гауссова ядра, в мм - в
сигма для объемного гауссова ядра, в мм

[-overlap-logic] - как обрабатывать перекрывающиеся области интереса, по умолчанию РАЗРЕШИТЬ

- метод устранения перекрытий

[-merged-volume] - обрабатывать компоненты тома, как если бы они были единым целым

компонент

Для каждого ненулевого значения на каждой карте создайте карту с ROI вокруг этого местоположения.
Если же линия индикатора -гауссовский задана опция, то выводятся нормализованные гауссовские ядра
вместо ROI. В аргумент -забавка-логика должно быть одним из РАЗРЕШИТЬ,
БЛИЖАЙШИЙ или ИСКЛЮЧИТЬ. РАЗРЕШИТЬ - это значение по умолчанию, означающее, что РИ обрабатываются.
независимо и могут перекрываться. БЛИЖАЙШИЙ означает, что рентабельность инвестиций не может пересекаться, и что
ни одна область интереса не содержит вершин, которые находятся ближе к другой исходной вершине. ИСКЛЮЧИТЬ означает
что области интереса не могут перекрываться, и что любая вершина в пределах диапазона более чем одной области интереса
не принадлежит ни к какой рентабельности инвестиций.

-cifti-отдельный НАПИШИТЕ СТРУКТУРУ CIFTI КАК МЕТРИЧЕСКИЕ, ЭТИКЕТКИ ИЛИ ОБЪЕМ

wb_command -cifti-отдельный

- cifti для разделения компонентов - в каком направлении
разделить на компоненты, СТРОКА или КОЛОННА

[-volume-all] - разделить все структуры тома в файл тома

- output - объем вывода

[-roi] - также выводить рентабельность инвестиций вокселей, в которых есть данные

- output - объем вывода ROI

[-label] - вывести файл метки тома с указанием местоположения

структуры - output - объем вывода этикеток

[-crop] - обрезать объем до размера данных, а не использовать

исходный размер тома

[-label] - repeatable - разделить модель поверхности на метку поверхности.

файл - структура для вывода - output - метка вывода
файл

[-roi] - также вывести roi, вершины которых имеют данные

- output - метрика вывода рентабельности инвестиций

[-metric] - repeatable - разделить модель поверхности в файл метрики

- структура для вывода - output - метрика вывода

[-roi] - также вывести roi, вершины которых имеют данные

- output - метрика вывода рентабельности инвестиций

[-volume] - repeatable - разделить структуру тома в файл тома

- структура для вывода - output - объем вывода

[-roi] - также выводить рентабельность инвестиций вокселей, в которых есть данные

- output - объем вывода ROI

[-crop] - обрезать объем до размера компонента, а не использовать

исходный размер тома

Для dtseries, dscalar и dlabel используйте COLUMN для , и если у вас есть
симметричный dconn, COLUMN более эффективен.

Вы должны указать хотя бы один из -метрический, -объем-все, -VOLUME или -этикетка для этого
команда делать что угодно. Объемы вывода будут пространственно совпадать с исходными
позиции, независимо от того, обрезаны они или нет.

Для каждого аргумент, используйте одну из следующих строк:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT МОЗЖОЧЕК ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT КОРА
DIENCEPHALO_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALO_VENTRAL_RIGHT ГИППОКАМПУС_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-чифти-разглаживание РАЗГЛАЖДАЙТЕ CIFTI-ФАЙЛ

wb_command -чифти-разглаживание

- вход cifti - сигма для гауссовой поверхности
сглаживающее ядро,

в мм

- сигма для ядра сглаживания гауссова объема, в

mm

- какой размер сглаживать, СТРОКА или КОЛОННА - выход -
выход cifti

[-left-surface] - указать левую поверхность для использования

- напильник левой поверхности

[-left-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо вычислений

их с левой поверхности - исправленные вершинные площади, как метрика

[-right-surface] - указать правильную поверхность для использования

- файл правой поверхности

[-right-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо вычислений

их с правильной поверхности - исправленные вершинные площади, как метрика

[-cerebellum-surface] - укажите поверхность мозжечка для использования

- файл поверхности мозжечка

[-cerebellum-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо

вычисляя их с поверхности мозжечка - исправленная вершина
площади, как метрика

[-cifti-roi] - сглаживание только в интересующих регионах

- области для сглаживания в виде файла cifti

[-fix-zeros-volume] - обрабатывать нулевые значения в объеме как отсутствующие данные

[-fix-zeros-surface] - считать нулевые значения на поверхности пропущенными

данным

[-merged-volume] - гладкий по границам подкорковой структуры

Входной файл cifti должен иметь отображение моделей мозга по выбранному измерению,
столбцы для .dtseries или для .dconn. По умолчанию данные в разных
структуры сглаживаются независимо (т. е. сглаживание "ограниченное участком"), поэтому
соприкасающиеся объемные структуры не сглаживают эту границу. Указать
-компонентный том игнорировать эти границы. Сглаживание поверхности использует
GEO_GAUSS_AREA метод сглаживания.

Параметры - * - исправленных областей предназначены для случаев, когда сглаживание неизбежно.
группы средних поверхностей, это лишь приблизительная поправка на уменьшение
структура в группе средней поверхности. Данные лучше сгладить на
по возможности перед усреднением.

The -фиксировать-нули-* параметры будут рассматривать нулевые значения как отсутствие данных и не будут использовать
это значение при генерации сглаженных значений, но заполнит нули
экстраполированные значения. В ROI должны отображаться модели мозга по столбцам,
точно соответствует отображению выбранного направления во входном файле. Данные
вне области интереса игнорируется.

-cifti-статистика СТАТИСТИКА ПО КОЛОННАМ CIFTI

wb_command -cifti-статистика

- вход cifti

[-reduce] - использовать операцию сокращения

- операция редукции

[-percentile] - укажите значение в процентиле

- процентиль для поиска

[-column] - отображать вывод только для одного столбца

- индекс столбца (начиная с 1)

[-roi] - рассматривать только данные внутри roi

- рентабельность инвестиций в виде файла cifti

[-match-maps] - каждый столбец ввода использует соответствующий столбец

из файла roi

[-show-map-name] - выводить индекс и имя столбца перед каждым выводом

Для каждого столбца ввода печатается одно число, полученное в результате
указанное сокращение или процентильная операция. Использовать -колонка чтобы дать результат только для
один столбец. Использовать -рои рассматривать только данные в пределах региона. Ровно один из
-уменьшать or -процентиль необходимо указать.

Аргумент против -уменьшать вариант должен быть одним из следующих:

MAX: максимальное значение MIN: минимальное значение INDEXMAX: отсчитываемый от 1 индекс
максимальное значение INDEXMIN: отсчитываемый от 1 индекс минимального значения SUM: сложить все значения
ПРОДУКТ: умножить все значения MEAN: среднее значение данных STDEV: стандарт
отклонение (знаменатель N) SAMPSTDEV: стандартное отклонение выборки (N-1
знаменатель) РАЗБИРАТЕЛЬНОСТЬ: дисперсия данных. МЕДИАНА: медиана данных.
MODE: режим данных COUNT_NONZERO: количество ненулевых элементов в
данным

-cifti-транспонировать ТРАНСПОРТИРОВАТЬ ФАЙЛ CIFTI

wb_command -cifti-транспонировать

- входной файл cifti - output - выходной файл cifti

[-mem-limit] - ограничить использование памяти

- лимит памяти в гигабайтах

На входе должен быть двухмерный файл cifti.
На выходе получается файл cifti.

где каждая строка на входе - это столбец на выходе.

-cifti-векторная-операция ВЫПОЛНЯЙТЕ ВЕКТОРНЫЕ ОПЕРАЦИИ С ФАЙЛАМИ CIFTI

wb_command -cifti-векторная-операция

- первый векторный входной файл - второй векторный файл ввода
- какую векторную операцию делать - output - выходной файл

[-normalize-a] - нормализовать векторы первого ввода

[-normalize-b] - нормализовать векторы второго входа

[-normalize-output] - нормализовать выходные векторы (не действует для точки

продукт)

[-magnitude] - вывести величину результата (не действует для точки

продукт)

Выполняет векторную операцию над двумя файлами cifti (число которых должно быть кратно 3
столбцы). Любой из входов может иметь несколько векторов (более 3 столбцов),
но не оба (по крайней мере, в одном должно быть ровно 3 столбца). В -величина и
-нормализовать-выход параметры нельзя указывать вместе или с операцией, которая
возвращает скаляр (скалярный продукт). В параметр должен быть одним из
следующие:

ТОЧКА ПЕРЕКРЕСТНАЯ ДОБАВИТЬ ВЫЧЕТ

-cifti-взвешенная статистика Взвешенная статистика по столбцам CIFTI

wb_command -cifti-взвешенная статистика

- вход cifti

[-spatial-weights] - использовать площадь вершины и объем вокселя как веса

[-left-area-surf] - использовать поверхность для областей левых вершин

- левая поверхность для использования

[-right-area-surf] - использовать поверхность для правых вершинных областей

- правильная поверхность для использования

[-cerebellum-area-surf] - использовать поверхность для вершин мозжечка.

- поверхность мозжечка для использования

[-left-area-metric] - использовать файл метрики для областей левых вершин

- файл метрики, содержащий области левых вершин

[-right-area-metric] - использовать файл метрики для правых вершинных областей

- файл метрики, содержащий области правых вершин

[-cerebellum-area-metric] - использовать файл метрики для вершины мозжечка

области - метрический файл, содержащий вершину мозжечка

районах

[-cifti-weights] - использовать файл cifti, содержащий веса

- веса для использования в виде файла cifti

[-column] - отображать вывод только для одного столбца

- столбец, который нужно использовать (от 1)

[-roi] - рассматривать только данные внутри roi

- рентабельность инвестиций в виде файла cifti

[-match-maps] - каждый столбец ввода использует соответствующий столбец

из файла roi

[-mean] - вычислить средневзвешенное значение

[-stdev] - вычислить взвешенное стандартное отклонение

[-sample] - оценить стандартное отклонение совокупности по выборке

[-percentile] - вычислить взвешенный процентиль

- процентиль для поиска

[-sum] - вычислить взвешенную сумму

[-show-map-name] - печатать индекс и имя карты перед каждым выводом

Если отображение вдоль столбца - это модели мозга, для каждого столбца входных данных
указанная операция выполняется на каждой поверхности и во всех вокселях, а результаты
печатаются отдельно. Для других типов сопоставления операция выполняется на каждом
столбец, и печатается одно число на карту. Ровно один из -пространственные веса or
-cifti-веса необходимо указать. Использовать -колонка чтобы дать результат только для одного
столбец. Использовать -рои рассматривать только данные в пределах региона. Ровно один из -жадный,
-stdev, -процентиль or -сумма необходимо указать.

. -сумма -пространственные веса (или с -cifti-веса и cifti, содержащий
веса аналогичного значения) эквивалентно интегрированию по площади и
Объем.

-класс-добавить член

Добавьте элементы в файлы заголовка (.h) и реализации (.cxx) класса.

[-добавить-файлы] [-m ] ...

Если же линия индикатора -добавить к файлам не указан, код для заголовка и реализации
файлы распечатываются на терминал.

Если же линия индикатора -добавить к файлам указано, файлы классов должны находиться в
текущий каталог и назван .рука .cxx. Заголовочный файл
должен содержать этот текст в своем закрытом разделе:

// ADD_NEW_MEMBERS_HERE

Файл реализации должен содержать этот текст в своей общедоступной секции:

// ADD_NEW_METHODS_ЗДЕСЬ

Если какая-либо из этих текстовых строк отсутствует, код, который был бы добавлен в
файл (ы) распечатывается на терминал.

Для каждого члена должны быть предоставлены три текстовые строки, разделенные пробелом, и они
- это имя члена, его тип данных и описание члена. Если
описание содержит пробелы, описание должно быть заключено в двойные кавычки ("").

Если тип данных начинается с заглавной буквы, предполагается, что это имя
класс. В этом случае создаются как константные, так и неконстантные геттеры, но не сеттер.
создано. В противном случае ожидается, что тип данных будет примитивным типом и
геттер и сеттер созданы. Обратите внимание, что AString и QString рассматриваются как
примитивные типы.

-класс-создать

Создайте файлы заголовка класса (.h) и реализации (.cxx).

Использование:

[-copy] [-event-class ] [-event-listener] [-no-parent] [-parent
]

ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ

-копию

Добавляет конструктор копирования и оператор присваивания

-вент-класс

При создании подкласса событий использование этой опции автоматически устанавливает
родительский класс для Event и поместите указанное значение перечислимого типа события в
параметр для конструктора класса Event.

Для нет необходимости добавлять к нему "EventTypeEnum ::".

-событие-слушатель

Реализуйте EventListenerInterface, чтобы класс мог прослушивать события.

-нет родителя

Созданный класс не является производным от какого-либо другого класса. По умолчанию родительский класс
КаретОбъект.

-родитель

Укажите родительский (производный от) класс. По умолчанию родительский класс
КаретОбъект.

-сцена

Реализуйте SceneableInterface, чтобы можно было восстанавливать экземпляры класса.
из сцен и сохранены в них.

-сцен-подкласс

Добавляет методы, которые могут быть вызваны суперклассом, чтобы этот подкласс мог сохранить
и восстанавливать данные в сцены и из них.

Этот параметр следует использовать только при создании класса, суперкласс которого реализует
SceneableInterface

-класс-создать-алгоритм

Создайте файлы заголовка (.h) и реализации (.cxx) класса алгоритма.

Использование:



имя-класса-алгоритма

Обязательное имя класса алгоритма, который ДОЛЖЕН начинаться с «Алгоритм»

переключатель командной строки

Обязательный переключатель командной строки для алгоритма.

Краткое описание

Обязательное краткое описание в двойных кавычках.

-класс-создать-перечисление

Создайте файлы заголовков перечислимого типа (.h) и реализации (.cxx).

Использование:



перечисление-имя-класса

Имя перечисляемого типа.
Должен заканчиваться на "Enum"

количество значений

Количество значений в перечисляемом типе.

автоматический номер

Автоматически генерируемые целочисленные коды, соответствующие перечисленным значениям.
Значения этого параметра - «истина» и «ложь».

[enum-name-1] [enum-name-2] ... [enum-name-N]

Необязательные имена для перечисляемых значений.

Если количество перечисленных имен больше, чем параметр «количество значений»,
«количество значений» станет количеством имен. Если количество имен равно
меньше, чем «количество значений», будут созданы пустые записи.

-класс-создание-операция

Создайте файлы заголовка (.h) и реализации (.cxx) класса операции.

Использование:

[-нет параметров]

имя-класса-операции

Обязательное имя класса операции, которое ДОЛЖНО начинаться с "Operation"

переключатель командной строки

Обязательный переключатель командной строки для работы.

Краткое описание

Обязательное краткое описание в двойных кавычках.

-нет параметров

Необязательный параметр, если операция не использует параметры.

-конвертировать-аффинно ПРЕОБРАЗОВАТЬ ФАЙЛ AFFINE МЕЖДУ КОНВЕНЦИЯМИ

wb_command -конвертировать-аффинно

[-from-world] - вход является аффинным NIFTI 'world'

- входной аффинный

[-from-flirt] - ввод - это матрица флирта

- входной аффинный - объем источника, используемый при генерации
вход

аффинное

- целевой объем, используемый при генерации ввода

аффинное

[-to-world] - записать вывод как аффинный NIFTI 'world'

- output - аффинный вывод

[-to-flirt] - repeatable - записать вывод как матрицу флирта

- output - аффинный вывод - объем, который вы хотите
применить преобразование к - целевое пространство, которое вы хотите преобразовать
объем до

совпадение

Матрицы мира NIFTI могут использоваться непосредственно в координатах мм через матрицу
умножение, используют систему координат NIFTI, то есть положительный X правильный,
положительный Y - передний, а положительный Z - верхний.

Вы должны указать ровно один -от вариант, но вы можете указать несколько -в
варианты и любые -в вариант, который принимает объемы, может указываться более одного раза.

-конвертировать ориентации волокон ПРЕОБРАЗОВАТЬ ОБЪЕМЫ ПАРАМЕТРОВ BINGHAM В ФАЙЛ ОРИЕНТАЦИИ ВОЛОКНА

wb_command -конвертировать ориентации волокон

- объем этикеток cifti structure - вывод - вывод
файл ориентации волокна

[-fiber] - repeatable - указать объемы параметра для волокна

- средняя прочность волокна - стандартное отклонение прочности волокна
- угол тета - угол фи - угол psi - ка бингхам
параметр - параметр kb bingham

Берет предварительно вычисленные параметры Bingham из файлов томов и преобразует их в
верстак формата использует для отображения. В аргумент должен быть ярлыком
том, где на этикетках используются следующие строки:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT МОЗЖОЧЕК ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT КОРА
DIENCEPHALO_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALO_VENTRAL_RIGHT ГИППОКАМПУС_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-преобразовать-матрицу4-в-матрицу2 ГЕНЕРИРУЕТ MATRIX2 CIFTI ИЗ MATRIX4 WBSPARSE

wb_command -преобразовать-матрицу4-в-матрицу2

- файл wbsparse matrix4 - выход - сумма
количество волокон, как файл cifti

[-distances] - вывести среднее расстояние по траектории

- вывод - расстояния, в виде файла cifti

Эта команда создает файл cifti из подсчетов волокон в файле matrix4 wbsparse,
и, возможно, второй файл cifti на расстоянии.

-convert-matrix4-to-workbench-sparse ПРЕОБРАЗОВАНИЕ 3-ФАЙЛОВОЙ МАТРИЦЫ4 В РАЗРЕШЕННЫЙ ФАЙЛ НА РАБОЧЕМ МЕСТЕ

wb_command -convert-matrix4-to-workbench-sparse

- первый файл matrix4 - второй файл matrix1
- третий файл matrix4 - файл .fiberTEMP.nii
этот файл траектории применяется

в

- список триплетов индексов вокселей белого вещества, используемых в

матрица траекторий

- output - выходной разреженный файл верстака

[-surface-seed] - указать пространство семян поверхности

- метрический файл roi всех узлов, используемых в начальном пространстве

[-volume-seed] - указать объем семенного пространства

- файл cifti для использования сопоставлений томов из -
измерение вдоль файла cifti, из которого будет выполняться сопоставление,

СТРОКА или КОЛОННА

Преобразует матрицу 4 вывода probtrackx в формат разреженного файла рабочей среды.
Именно один из -поверхность-семена и -volume-seed необходимо указать.

-конвертировать-варпполе ПРЕОБРАЗОВАТЬ ВАРПФИЛЬ МЕЖДУ КОНВЕНЦИЯМИ

wb_command -конвертировать-варпполе

[-from-world] - ввод - это варп-поле NIFTI 'world'

- входное поле искривления

[-from-fnirt] - ввод - это поле искривления fnirt

- входное поле искривления - объем источника, используемый при
создание ввода

варпфилд

[-to-world] - записать вывод как поле варп-поля NIFTI 'world'

- output - поле искривления вывода

[-to-fnirt] - repeatable - записать вывод как поле флирта.

- output - поле искривления вывода - объем, который вы хотите
применить поле искривления к

Поля искривления мира NIFTI могут использоваться непосредственно в миллиметровых координатах с помощью выборки из
три подобъема по координате и добавление выборочных значений к координате
вектор, они используют систему координат NIFTI, то есть X слева направо, Y -
кзади от переднего, а Z ниже верхнего.

ПРИМЕЧАНИЕ: эта команда не инвертирует поле деформации, и для деформации поверхности необходимо
используйте инверсию поля деформации, которая искажает соответствующий объем.

Вы должны указать ровно один -от вариант, но вы можете указать несколько -в
варианты и любые -в вариант, который принимает объемы, может указываться более одного раза.

-создать-подписанный-дистанционный-том СОЗДАВАЙТЕ ПОДПИСАННЫЙ ОБЪЕМ РАССТОЯНИЯ ОТ ПОВЕРХНОСТИ

wb_command -создать-подписанный-дистанционный-том

- входная поверхность - том в желаемом выходном пространстве
(размеры, интервал, начало координат) - output - объем вывода

[-roi-out] - вывести объем рентабельности, в котором на выходе вычисляется

ценность - output - объем вывода roi

[-fill-value] - укажите значение для всех вокселей, которые не получают

назначенное расстояние - значение для заполнения (по умолчанию 0)

[-exact-limit] - указать расстояние для точного вывода

- расстояние в мм (по умолчанию 5)

[-approx-limit] - указать расстояние для приблизительного вывода

- расстояние в мм (по умолчанию 20)

[-approx-neighbourhood] - окрестность вокселя для приблизительного расчета

- размер соседнего куба, измеренный от центра до грани, в дюймах

воксели (по умолчанию 2 = 5x5x5)

[-winding] - метод намотки для проверки точечной внутренней поверхности

- название метода (по умолчанию EVEN_ODD)

Вычисляет функцию расстояния со знаком для поверхности.
Точное расстояние

вычисляется путем нахождения ближайшей точки на любом треугольнике поверхности к центру
воксель. Приблизительное расстояние рассчитывается исходя из этих расстояний с использованием
метод Дейкстры с окрестностью вокселей. Указание слишком маленького или точного
расстояние может привести к неожиданным результатам. Допустимые спецификаторы для методов намотки:
следующим образом:

EVEN_ODD (по умолчанию) ОТРИЦАТЕЛЬНЫЙ НЕНУЛЕВОЙ НОРМАЛЬНЫЙ

В методе NORMALS используются нормали треугольников и ребер или ближайший треугольник.
попадание лучом из точки. Этот метод может быть немного быстрее, но только
надежен для закрытых поверхностей, которые не пересекаются сами собой. Все остальные
методы подсчитывают входное (положительное) и выходное (отрицательное) пересечение вертикального луча из
точка, затем считается внутренней, если сумма нечетная, отрицательная или отличная от нуля,
соответственно.

-оценить-волокно-Бингемса ОЦЕНКА РАСПРЕДЕЛЕНИЯ ОРИЕНТАЦИИ ВОЛОКНА ИЗ ОБРАЗЦОВ BEDPOSTX

wb_command -оценить-волокно-Бингемса

- пробы волокна 1 - волокно 1 тета
образцы - образцы волокна 1 фи - волокно 1
образцы прочности - образцы волокна 2 тета -
волокна 2 phi образцы - пробы волокна 3
- образцы волокна 3 тета - клетчатка 3 фи
образцы - объем этикеток cifti structure - вывод -
выходной файл распределителей волокна cifti

Эта команда выполняет оценку распределения Бингама для каждого волокна.
ориентация в каждом вокселе, который помечен структурным идентификатором. Эти маркировки
пришли из аргумент, метки которого должны соответствовать
следующие строки:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT МОЗЖОЧЕК ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT КОРА
DIENCEPHALO_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALO_VENTRAL_RIGHT ГИППОКАМПУС_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-волокно-точечные-продукты РАСЧЕТ ТОЧЕЧНЫХ ПРОДУКТОВ ВОЛОКОННЫХ ОРИЕНТАЦИЙ С НОРМАЛЬНЫМИ ПОВЕРХНОСТЬЮ

wb_command -волокно-точечные-продукты

- белая / серая граничная поверхность - ориентация волокна
файл - максимальное расстояние от любого узла поверхности волокна

Население может быть, в мм

- испытать на поверхности, должна ли совокупность волокон

использоваться

- output - метрика скалярных произведений - output - метрика
значений f распределений волокон

Для каждой вершины эта команда находит ближайшую совокупность волокон, удовлетворяющую критерию
test и вычисляет абсолютное значение скалярного произведения поверхности
нормальное и нормированное среднее направление каждого волокна. В тест должен
может быть одним из INSIDE, OUTSIDE или ANY, что заставляет команду использовать только оптоволокно.
популяции, которые находятся внутри поверхности, за ее пределами или не заботятся о том, какие
направление это от поверхности. Каждая совокупность волокон выводится в отдельном
метрический столбец.

-файл-конвертировать ИЗМЕНИТЬ ВЕРСИЮ ФОРМАТА ФАЙЛА

wb_command -файл-конвертировать

[-border-version-convert] - записать файл границы с другой версией

- входной файл границы - версия формата для записи,
1 или 3 (2 не

существовать)

- output - выходной файл границы

[-surface] - необходимо указать, если ввод - версия 1

- используйте этот файл поверхности для структуры и количества

вершины, игнорировать границы других структур

[-nifti-version-convert] - записать файл nifti с другой версией

- входной файл nifti - отличная версия для записи как -
output - выходной файл nifti

[-cifti-version-convert] - записать файл cifti с другой версией

- входной файл cifti - версия cifti писать как
- output - выходной файл cifti

Вы можете указать только одну опцию верхнего уровня.

-файл-информация СПИСОК ИНФОРМАЦИИ О СОДЕРЖАНИИ ФАЙЛА

wb_command -файл-информация

- файл данных

[-no-map-info] - не отображать информацию о карте для файлов, поддерживающих карты.

[-only-step-interval] - подавить нормальный вывод, распечатать интервал

между картами

[-only-number-of-maps] - подавить нормальный вывод, вывести количество карт

[-only-map-names] - запретить нормальный вывод, распечатать названия всех карт

Перечислить информацию о содержимом файла данных.
Только один -только вариант

может быть уточнено.
Информация указана, когда нет -только вариант присутствует

зависит от типа файла данных.

-foci-получить-проекция-вершина ПОЛУЧИТЕ ВЕРТЕКС ПРОЕКЦИИ ДЛЯ FOCI

wb_command -foci-получить-проекция-вершина

- файл фокусов - поверхность, относящаяся к файлу фокусов
- output - выходной файл метрики

[-name] - выбрать фокус по имени

- название фокуса

Для каждого фокуса создается столбец в , а вершина с наибольшим
влиянию на его проекцию присваивается значение 1 в этом столбце, со всеми остальными
вершин 0. Если -имя используется только один фокус.

-foci-list-координаты ВЫВОД КООРДИНАТОВ FOCI В ТЕКСТОВОЙ ФАЙЛ

wb_command -foci-list-координаты

- входной файл фокусов - output - координата вывода
текстовый файл

[-names-out] - вывести названия фокусов

- output - текстовый файл для ввода названий фокусов

Выведите координаты для каждого фокуса в файле фокусов и, возможно, фокуса.
имена во втором текстовом файле.

-фокусы-ресемпл ФОТОГРАФИИ ПРОЕКТА НА РАЗЛИЧНОЙ ПОВЕРХНОСТИ

wb_command -фокусы-ресемпл

- входной файл фокусов - output - выходной файл фокусов

[-left-sizes] - левые поверхности для ресемплинга

- поверхность, на которую в данный момент проецируются очаги - в
поверхность для проецирования фокусов на

[-right-sizes] - правильные поверхности для передискретизации

- поверхность, на которую в данный момент проецируются очаги - в
поверхность для проецирования фокусов на

[-cerebellum-sizes] - поверхности мозжечка для повторной выборки

- поверхность, на которую в данный момент проецируются очаги - в
поверхность для проецирования фокусов на

[-discard-distance-from-surface] - игнорировать расстояние до фокуса выше

или ниже текущей поверхности

[-restore-xyz] - поместить исходные координаты xyz в фокусы, скорее

чем координаты, полученные из непроекции

Убирает фокусы с для структуры, затем проецирует их на
. Если фокусы находятся на значительном расстоянии выше или ниже поверхности, используйте
анатомические поверхности. Если очаги должны быть на поверхности, используйте зарегистрированные сферы.
и варианты -отбросить-расстояние-от-поверхности и -восстановить-xyz.

-gifti-all-labels-to-rois ЗАРАБОТАЙТЕ ОТ ВСЕХ ЭТИКЕТОВ В КОЛОНКЕ ПОДАРКОВ

wb_command -gifti-all-labels-to-rois

- входной файл метки gifti - номер или название карты меток
использовать - output - выходной файл метрики

В выходном файле метрики есть столбец для каждой метки в указанной входной карте,
кроме ??? метка, каждая из которых содержит ROI всех вершин, которые
установить на соответствующую метку.

-gifti-конвертировать Преобразование файла GIFTI в другую кодировку

Использование:



gifti-кодирование

Обязательная кодировка GIFTI.

ввод-gifti-файл

Обязательный ввод имени файла GIFTI.

выходной-gifti-файл

Обязательное имя выходного файла GIFTI.

Действующие кодировки GIFTI:

ASCII BASE64_BINARY GZIP_BASE64_BINARY ВНЕШНИЙ_ФАЙЛ_BINARY

-gifti-метка-добавить-префикс ДОБАВИТЬ ПРЕФИКС ДЛЯ ВСЕХ НАЗВАНИЙ ЭТИКЕТКИ В ФАЙЛЕ ЭТИКЕТКИ GIFTI

wb_command -gifti-метка-добавить-префикс

- входной файл метки - строка префикса для добавления -
output - файл метки вывода

Для каждой метки, кроме "???", добавьте к названию ярлыка.

-gifti-label-to-roi СДЕЛАЙТЕ ЭТИКЕТКУ ПОДАРКОВ МЕТРИКУ Рентабельности инвестиций

wb_command -gifti-label-to-roi

- входной файл метки gifti - output - метрика вывода
файл

[-name] - выбрать ярлык по названию

- название лейбла, рентабельность которого вы хотите получить

[-key] - выбрать ярлык по клавише

- ключ ярлыка, рентабельность которого вы хотите получить

[-map] - выбрать одну карту меток для использования

- номер карты или название

Для каждой карты в , карта создается в где все локации
с надписью или с ключом дается значение 1, а
всем остальным локациям присваивается 0. Ровно одно из -имя и -ключ необходимо указать.
Указывать -map использовать только одну карту из .

-метка-расширить РАСШИРЯТЬ ФАЙЛ МАРКИРОВКИ

wb_command -метка-расширить

- метка ввода - поверхность для расширения -
расстояние в мм для расширения этикеток - output - файл метки вывода

[-bad-vertex-roi] - указать корневую область значений вершин для перезаписи, а не

вершины с непомеченным ключом - файл показателей, положительные значения обозначают
вершины иметь

их ценности заменили

[-column] - выберите один столбец для расширения

- номер или название столбца

[-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо их вычисления из

поверхность - исправленные вершинные площади, как метрика

Заполняет информацию меток для всех вершин, обозначенных как плохие, до указанного
расстояние от других этикеток. Если -бад-вершина-королева указано, все вершины,
в том числе с ключом без метки, хороши, за исключением вершин с
положительное значение в рентабельности инвестиций. Если он не указан, только вершины с
немаркированные ключи плохие.

-label-экспорт-таблица ЭКСПОРТ ТАБЛИЦЫ ИЗ ПОДАРКОВ В КАЧЕСТВЕ ТЕКСТА

wb_command -label-экспорт-таблица

- входной файл метки - output - выходной текстовый файл

Берет таблицу этикеток из файла этикеток gifti и записывает ее в текстовый формат
соответствие тому, что ожидается -метрическая метка-импорт.

-этикетка-маска МАСКА ФАЙЛА ЭТИКЕТКИ

wb_command -этикетка-маска

- файл метки, который нужно замаскировать - метрика маски - вывод -
выходной файл метки

[-column] - выбрать один столбец

- номер или название столбца

По умолчанию метка вывода является копией метки ввода, но с 'неиспользованным'
метка везде, где метрика маски не положительна. если -колонка указано,
output содержит только один столбец, замаскированную версию указанного входного столбца.

-метка-слияние ОБЪЕДИНИТЬ ФАЙЛЫ ЯРЛЫКОВ В НОВЫЙ ФАЙЛ

wb_command -метка-слияние

- output - метка вывода

[-label] - repeatable - указать метку ввода

- файл метки для использования столбцов из

[-column] - repeatable - выберите один столбец для использования

- номер или название столбца

[-up-to] - использовать полный диапазон столбцов

- номер или название последнего столбца, который нужно включить

[-reverse] - использовать диапазон в обратном порядке

Берет один или несколько файлов этикеток и создает новый файл этикеток путем объединения
колонны из них. Входные файлы должны иметь одинаковое количество вершин и
та же структура

Пример: wb_command -метка-слияние out.label.gii -этикетка first.label.gii -колонка 1
-этикетка второй.label.gii

В этом примере будет использоваться первый столбец из first.label.gii и все подтомы.
из second.label.gii и напишите их на out.label.gii.

-label-modify-keys ИЗМЕНИТЬ КЛЮЧЕВЫЕ ЗНАЧЕНИЯ В ФАЙЛЕ ЭТИКЕТКИ

wb_command -label-modify-keys

- входной файл метки - текстовый файл со старым и новым ключом
ценности - output - выходной файл метки

[-column] - выберите один столбец для использования

- номер или название столбца

должны иметь строки вида 'oldkey newkey', например:

3 5 5 8 8 2

Это изменит текущую метку с ключом '3', чтобы вместо этого использовать ключ '5', 5
будет использовать 8, а 8 - 2. Любое противоречие в ключевых значениях приводит к метке
который не был указан в файле переназначения, переназначенный на неиспользуемый иначе
ключ. Переназначение более одного ключа на один и тот же новый ключ или одного и того же ключа на более чем
один новый ключ приводит к ошибке. Это не изменит внешний вид файла.
при отображении он одновременно изменит ключи в данных.

-label-resample ПЕРЕЗАГРУЗИТЬ ФАЙЛ С ЭТИКЕТКОЙ НА ДРУГУЮ СЕТЬ

wb_command -label-resample

- файл метки для повторной выборки - поверхность сферы с
сетка, которой является файл метки

в настоящее время на

- поверхность сферы, которая совпадает с

и имеет желаемую выходную сетку

- название метода - output - файл метки вывода

[-area-surfs] - указать поверхности для коррекции площади вершин на основе

- соответствующая анатомическая поверхность с

сетке

- соответствующая анатомическая поверхность с сетка

[-area-metrics] - указать метрики площади вершины для коррекции площади на основе

на - файл метрики с площадями вершин для

сетке

- файл метрики с площадями вершин для сетка

[-current-roi] - использовать входную рентабельность инвестиций в текущей сетке, чтобы исключить не-данные

вершины - рентабельность инвестиций в виде файла с показателями

[-valid-roi-out] - вывести ROI вершин, которые получили данные из валидных

исходные вершины - output - выходная рентабельность инвестиций в качестве метрики

[-largest] - использовать только метку вершины с наибольшим весом

Повторная выборка файла метки для двух сферических поверхностей, которые находятся в регистре. Если
метод корректирует площадь, точно один из -площадь-серфинг or -площадь-метрики должен быть
указано.

The -самый большой опция приводит к поведению ближайшей вершины при использовании с BARYCENTRIC,
он использует значение исходной вершины, имеющей наибольший вес. Когда -самый большой
не указано, веса вершин суммируются в зависимости от того, на какой метке они
соответствуют, и используется метка с наибольшей суммой.

В аргумент должен быть одним из следующих:

ADAP_BARY_AREA БАРИЦЕНТРИЧЕСКИЙ

Метод ADAP_BARY_AREA рекомендуется для данных меток, потому что он должен быть
лучше разрешать вершины, которые находятся рядом с несколькими метками, или в случае
даунсэмплинг.

-этикетка до границы НАРИСИТЕ ГРАНИЦЫ НА ЭТИКЕТКАХ

wb_command -этикетка до границы

- поверхность, используемая для информации о соседях - вход
файл с этикеткой - output - выходной файл границы

[-placement] - установить, как далеко отрисовываются точки границы края.

- дробь по ребру изнутри вершины (по умолчанию 0.33)

[-column] - выбрать один столбец

- номер или название столбца

Для каждой метки находит все ребра на сетке, которые пересекают границу метки,
и проводит через них границы. По умолчанию это делается для всех столбцов в
входной файл, используя имя карты в качестве имени класса для границы.

-metadata-remove-originance УДАЛИТЬ ИНФОРМАЦИЮ О ПРОФЕССИИ ИЗ ФАЙЛОВЫХ МЕТАДАННЫХ

wb_command -metadata-remove-originance

- файл, из которого нужно удалить информацию о происхождении -
output - имя для сохранения измененного файла как

Удаляет поля метаданных происхождения, добавленные рабочей средой во время обработки.

-метаданные-строка-заменить ЗАМЕНИТЬ СТРОКУ ВО ВСЕХ МЕТАДАННЫХ ФАЙЛА

wb_command -метаданные-строка-заменить

- файл для замены метаданных в - строка для поиска
- строка для замены с участием - вывод
- имя для сохранения измененного файла как

[-case-indensitive] - также совпадать с вариацией регистра

Заменяет все вхождения в метаданных и названиях карт
с участием .

-метрика-конвертировать ПРЕОБРАЗОВАТЬ МЕТРИЧЕСКИЙ ФАЙЛ В ПОДДЕЛКУ NIFTI

wb_command -метрика-конвертировать

[-to-nifti] - конвертировать метрику в nifti

- метрика, которую нужно преобразовать - output - выходной файл nifti

[-from-nifti] - преобразовать nifti в метрику

- файл nifti для конвертации - файл поверхности для использования количества
узлы и структура из - output - выходной файл метрики

Цель этой команды - преобразовать файлы метрик и nifti1, чтобы
Программы, не осведомленные о gifti, могут работать с данными. Вы должны указать ровно один из
варианты.

-метрический-расширять РАСШИРЯТЬ МЕТРИЧЕСКИЙ ФАЙЛ

wb_command -метрический-расширять

- метрика для расширения - поверхность для вычислений -
расстояние в мм для расширения - output - метрика вывода

[-bad-vertex-roi] - указать корневую область значений вершин для перезаписи, а не

вершины с нулевым значением - файл показателей, положительные значения обозначают
вершины иметь

их ценности заменили

[-data-roi] - укажите ROI, где находятся данные

- файл метрики, положительные значения обозначают вершины, которые имеют

данным

[-column] - выберите один столбец для расширения

- номер или название столбца

[-nearest] - использовать ближайшее хорошее значение вместо средневзвешенного

[-linear] - заполнить значения с линейной интерполяцией по самому сильному

градиент

[-exponent] - использовать другой показатель степени в весовой функции

- показатель степени 'n' для использования в (площадь / (расстояние ^ n)) в качестве

функция взвешивания (по умолчанию 2)

[-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо их вычисления из

поверхность - исправленные вершинные площади, как метрика

Для всех метрических вершин, обозначенных как плохие, если они соседствуют с неплохим
вершины с данными или находятся на указанном расстоянии от такой вершины, замените
значение со средневзвешенным расстоянием ближайших неплохих вершин, у которых есть данные,
в противном случае установите значение равным нулю. Неважно насколько маленький есть, расширение будет
всегда используйте по крайней мере ближайшие соседние вершины. Если -ближайший указано, это
вместо этого будет использовать значение из ближайшей неплохой вершины с данными в пределах диапазона
средневзвешенного значения.

If -бад-вершина-королева указано, только вершины с положительным значением в области интереса будут
плохой. Если он не указан, только вершины, у которых есть данные, с нулевым значением,
плохие. Если -данные-рои не указан, предполагается, что все вершины имеют данные.

Обратите внимание, что -исправленные-площади опция использует приблизительную поправку на изменение
в расстояниях по средней поверхности группы.

-метрическая оценка-fwhm ОЦЕНКА ГЛАДКОСТИ МЕТРИЧЕСКОГО ФАЙЛА ПО FWHM

wb_command -метрическая оценка-fwhm

- поверхность, используемая для информации о расстоянии и соседях -
входная метрика

[-roi] - использовать только данные в пределах ROI

- файл метрики для использования в качестве ROI

[-column] - выберите один столбец для оценки гладкости

- номер или название столбца

Оценивает гладкость столбцов метрики, распечатывая оценки в стандартном формате.
вывод. Эти оценки игнорируют изменение расстояния между вершинами.

-метрические экстремумы НАЙТИ ЭКСТРЕМАЛЬНЫЙ ФАЙЛ В МЕТРИЧЕСКОМ ФАЙЛЕ

wb_command -метрические экстремумы

- поверхность, используемая для информации о расстоянии - метрика к
найти экстремумы - минимальное расстояние между выявленными экстремумами
тоже самое

напишите

- output - метрика выходных экстремумов

[-presmooth] - сгладить метрику до нахождения экстремумов

- сигма для ядра сглаживания Гаусса, в мм

[-roi] - игнорировать значения за пределами выделенной области

- область для поиска экстремумов, как метрика

[-threshold] - игнорировать мелкие экстремумы

- наибольшее значение, которое следует рассматривать как минимум - самый маленький
значение, которое следует учитывать как максимальное

[-sum-columns] - выводить сумму столбцов экстремумов вместо каждого

столбец отдельно

[-consolidate-mode] - использовать консолидацию локальных минимумов вместо

большой район

[-only-maxima] - найти только максимумы

[-only-minima] - найти только минимумы

[-column] - выберите один столбец для поиска экстремумов

- номер или название столбца

Находит экстремумы в файле метрики, при которых не существует двух экстремумов одного типа.
в пределах друг друга. Экстремумы помечены как -1 для минимумов, 1 для
максимумы, 0 в противном случае. Если -только-максимум or -только-минимумы указано, тогда он будет
игнорировать экстремумы не указанного типа. Эти варианты исключают друг друга.

If -рои не используются не только данные за пределами roi, но и любая вершина на
край ROI никогда не будет считаться экстремумом, если ROI сокращается
через градиент, что в противном случае привело бы к возникновению экстремумов там, где должны быть
никто.

If -сумма-столбцы указано, эти столбцы экстремумов суммируются, и на выходе
один столбец с этим результатом.

По умолчанию точка данных является экстремальной, только если она более экстремальна, чем любая другая.
точка данных, которая находится внутри от него. Если -consolidate-режим используется, это
вместо этого начинается с поиска всех точек данных, которые являются более экстремальными, чем их непосредственные
соседей, то пока есть экстремумы внутри друг друга, возьмите
два ближайших друг к другу экстремума и объединить их в один средневзвешенным
на основе того, сколько исходных экстремумов было объединено в каждый из них.

По умолчанию все входные столбцы используются без сглаживания, используйте -колонка указать
один столбец для использования и -пресглаживание чтобы сгладить ввод, прежде чем найти
экстремумы.

-метрическая ложная корреляция СРАВНИТЕ КОРРЕЛЯЦИЮ ЛОКАЛЬНО И ПОСРЕДСТВОМ / ЧЕРЕЗ SULCI / GYRI

wb_command -метрическая ложная корреляция

- поверхность для вычисления геодезических и трехмерных расстояний с помощью - в
метрика для корреляции <3D-dist> - максимальное трехмерное расстояние для проверки вокруг каждой вершины
- максимальное геодезическое расстояние для соседних

корреляция

- минимальное геодезическое расстояние для соседних

корреляция

- output - метрика вывода

[-roi] - выбрать интересующий регион, в котором есть данные

- регион в виде файла метрики

[-dump-text] - выгрузить необработанные измерения, используемые в текстовый файл

- выходной текстовый файл

Для каждой вершины вычислите среднюю корреляцию в диапазоне геодезических
расстояния, которые не пересекают борозду / извилину, и корреляция с ближайшим
вершина пересекает борозду / извилину. Считается, что вершина пересекает борозду / извилину, если
3D-расстояние составляет менее трети геодезического расстояния. Выходной файл
содержит соотношение между этими корреляциями и некоторые дополнительные карты, чтобы помочь
объясните соотношение.

-метрические-заливные-отверстия ЗАПОЛНИТЕ ОТВЕРСТИЯ В МЕТРИКЕ ROI

wb_command -метрические-заливные-отверстия

- поверхность, используемая для информации о соседях - входная рентабельность инвестиций
метрика - output - показатель ROI выхода

[-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо их вычисления из

поверхность - исправленные вершинные площади, как метрика

Находит все связанные области, которые не включены в ROI, и записывает их в
все, кроме самого большого, по площади.

-метрические-найти-кластеры ФИЛЬТРУЮЩИЕ КЛАСТЕРЫ ПО ПОВЕРХНОСТИ

wb_command -метрические-найти-кластеры

- поверхность для вычислений - входная метрика
- порог значений данных - порог для
площадь скопления, мм ^ 2 - output - метрика вывода

[-less-than] - найти значения меньше чем , скорее, чем

большой

[-roi] - выбрать интересующий регион

- рентабельность инвестиций как показатель

[-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо их вычисления из

поверхность - исправленные вершинные площади, как метрика

[-column] - выбрать один столбец

- номер или название столбца

[-size-ratio] - игнорировать кластеры меньше заданной доли

самый большой кластер на карте - доля площади самого большого кластера

[-distance] - игнорировать кластеры дальше заданного расстояния от объекта

самый большой кластер - насколько далеко от самого большого кластера может быть кластер,
край

до кромки, в мм

[-start] - начать размечать кластеры со значения, отличного от 1

- значение для первого найденного кластера

Выводит метрику с ненулевыми целыми числами для всех вершин в пределах достаточно большого
кластер и нули в другом месте. Целые числа обозначают членство в кластере (по умолчанию
первый найденный кластер будет использовать значение 1, второй кластер 2 и т. д.). По умолчанию значения
лучше чем считаются находящимися в кластере, используйте -меньше, чем в
тест на значения меньше порогового. Чтобы применить это как маску к данным, или
чтобы сделать более сложную пороговую обработку, см. -метрическая математика.

-метрический градиент ГРАДИЕНТ ПОВЕРХНОСТИ МЕТРИЧЕСКОГО ФАЙЛА

wb_command -метрический градиент

- поверхность для вычисления градиента на - метрика к
вычислить градиент - output - величина градиента

[-presmooth] - сгладить метрику перед вычислением градиента.

- сигма для ядра сглаживания Гаусса, в мм

[-roi] - выбрать интересующую область для получения градиента

- область, в которой будет приниматься градиент, в качестве метрики

[-match-columns] - для каждого входного столбца использовать соответствующий столбец

из рентабельности

[-vectors] - выходные векторы градиента

- вывод - векторы в виде файла метрики

[-column] - выберите один столбец для вычисления градиента

- номер или название столбца

[-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо их вычисления из

поверхность - исправленные вершинные площади, как метрика

[-average-normals] - усреднить нормали каждой вершины с ее

соседи, прежде чем использовать их для вычисления градиента

В каждой вершине ближайшие соседи развернуты на плоскость, касательную к вершине.
поверхность в вершине (а именно перпендикулярно нормали). Градиент
вычисляется с использованием регрессии между развернутыми положениями вершин и
их ценности. Затем градиент задается наклонами регрессии, и
реконструирован как трехмерный вектор градиента. По умолчанию принимает градиент всех
колонны, без предварительного сглаживания, по всей поверхности, без усреднения
нормали поверхности среди соседей.

Когда используешь -исправленные-площади, обратите внимание, что это приблизительная поправка. Делает
сглаживание отдельных поверхностей перед усреднением / градиентом предпочтительнее, когда
возможно, чтобы использовать исходную структуру поверхности.

Указание области интереса ограничит градиент, чтобы использовать только данные из области интереса.
метрика положительна, и выводить нули везде, где показатель ROI не положительный.

По умолчанию первый столбец показателя рентабельности инвестиций используется для всех входных столбцов. Когда
-match-столбцы указывается в -рои вариант, метрики ввода и рентабельности инвестиций должны иметь
одинаковое количество столбцов, и для индекса каждого входного столбца один и тот же столбец
index используется в метрике рентабельности инвестиций. Если -match-столбцы вариант -рои используется
в то время как -колонка опция также используется, количество столбцов метрики рентабельности инвестиций должно
соответствует входной метрике, и он будет использовать столбец рентабельности инвестиций с индексом
выбранный входной столбец.

Метрика векторного вывода организована таким образом, что компоненты X, Y и Z из
один входной столбец - это последовательные столбцы.

-метрическая метка-импорт ИМПОРТ ФАЙЛА С ЭТИКЕТКОЙ ПОДАРКИ ИЗ МЕТРИЧЕСКОГО ФАЙЛА

wb_command -метрическая метка-импорт

- входной файл метрики - текстовый файл, содержащий значения
и названия для этикеток - output - выходной файл метки gifti

[-discard-others] - установить любые значения, не упомянутые в списке меток, в

??? метка

[-unlabeled-value] - установить значение, которое будет интерпретироваться как немаркированное

- числовое значение для немаркированного (по умолчанию 0)

[-column] - выберите один столбец для импорта

- номер или название столбца

[-drop-unused-labels] - удалить все неиспользуемые значения метки из метки.

(см. таблицу ниже)

Создает новый файл меток gifti из файла показателей со значениями, подобными меткам. Ты можешь
укажите пустую строку ('' будет работать на linux / mac) для , который
будет рассматриваться как пустой файл. Файл списка этикеток должен содержать строки
следующий формат:



Не указывайте в файле "немаркированный" ключ, предполагается, что 0 означает не
помечены, если -непомеченное-значение указан. Имена ярлыков должны быть на отдельном
строка, но может содержать пробелы или другие необычные символы (но не новую строку).
Пробелы удаляются с обоих концов имени метки, но сохраняются, если они находятся в
середина этикетки. Значения красного, зеленого, синего и альфа должны быть целыми числами от
От 0 до 255, и будет указывать цвет, которым будет нарисована метка (альфа 255 означает
непрозрачный, что, вероятно, вам и нужно). По умолчанию он устанавливает новые имена меток.
с именами LABEL_ # для любых встреченных значений, не упомянутых в списке
файл, укажите -discard-другие вместо этого установить эти вокселы на «немаркированный» ключ.

-метрическая маска МАСКА МЕТРИЧЕСКОГО ФАЙЛА

wb_command -метрическая маска

- входная метрика - метрика маски - вывод -
выходная метрика

[-column] - выбрать один столбец

- номер или название столбца

По умолчанию выходная метрика является копией входной метрики, но с нулями.
везде, где метрика маски не положительна. если -колонка указан, вывод
содержит только один столбец, маскированную версию указанного входного столбца.

-метрическая математика ОЦЕНИТЬ ВЫРАЖЕНИЕ МЕТРИЧЕСКИХ ФАЙЛОВ

wb_command -метрическая математика

- выражение для оценки, в кавычках - вывод -
выходная метрика

[-fixnan] - заменить NaN результат на значение

- значение для замены NaN на

[-var] - repeatable - показатель для использования в качестве переменной

- имя переменной, используемое в выражении - метрика
файл для использования в качестве этой переменной

[-column] - выбрать один столбец

- номер или название столбца

[-repeat] - повторно использовать один столбец для каждого столбца расчета

Эта команда оценивает в каждой вершине поверхности независимо. Там
должен быть хотя бы один -вар вариант (чтобы получить структуру, количество вершин и
количество столбцов из), даже если указанное в нем не используется в
. Все метрики должны иметь одинаковое количество вершин. Имена файлов
недействителен в используйте имя переменной и -вар вариант с сопоставлением
чтобы указать входной файл. Если -колонка опция предоставляется любому -вар
вариант, из этого файла используется только один столбец. Если -повторить указан, файл
должен либо иметь только один столбец, либо иметь -колонка опция указана. Все файлы
которые не используют -повторить должно иметь такое же количество столбцов, которое требуется для использования.
Формат как следует:

Выражения состоят из констант, переменных, операторов, скобок и функций,
в инфиксной записи, например, ехр (-x + 3) * масштаб '. Переменные - это строки любого
длина, используя символы az, AZ, 0-9 и _, но не может принимать имя
именованная константа. В настоящее время существует только одна именованная константа, PI. Операторы
- это +, -, *, /, ^,>, <,> =, <=, ==,! =,!, &&, ||. Они ведут себя как в C, за исключением
что ^ - это возведение в степень, то есть pow (x, y), и имеет более высокий приоритет, чем другие
бинарные операторы (также '-3 ^ -4 ^ -5' означает '- (3 ^ (- (4 ^ -5)))'). Знаки <=,> =, == и! =
операторам предоставляется небольшое пространство для маневра, равное одной миллионной части
меньшее из абсолютных значений сравниваемых значений.

Операторы сравнения и логические операторы возвращают 0 или 1, вы можете выполнять маскировку с помощью выражений.
как 'x * (маска> 0)'. Для всех логических операторов вход считается истинным, если и только если
он больше 0. Выражение «0 <x <5» синтаксически не ошибочно, но
он НЕ будет делать то, что требуется, потому что он оценивается слева направо, т.е. '((0
x) <5) ', который всегда будет возвращать 1, поскольку оба возможных результата сравнения
меньше 5. При обнаружении выражения этого типа выдается предупреждение.
Используйте что-то вроде 'x> 0 && x <5', чтобы получить желаемое поведение.

Пробелы между элементами игнорируются, sin (2 * x) эквивалентно
'sin (2 * x)', но 's in (2 * x)' является ошибкой. Подразумеваемое умножение не допускается,
выражение «2x» будет проанализировано как переменная. Круглые скобки (), не использовать
[] или {}. Функции требуют скобок, выражение «sin x» является ошибкой.

Поддерживаются следующие функции:

sin: 1 аргумент, синус аргумента (единицы - радианы) cos: 1 аргумент,
косинус аргумента (единицы - радианы) tan: 1 аргумент, тангенс
аргумент (единицы - радианы) asin: 1 аргумент, обратный синусу аргумента,
в радианах acos: 1 аргумент, величина, обратная косинусу аргумента, в радианах
atan: 1 аргумент, величина, обратная тангенсу аргумента, в радианах atan2: 2
аргументов, atan2 (y, x) возвращает значение, обратное касательной к

(y / x) в радианах, определяя квадрант по знаку обоих аргументов

аргумент sinh: 1, гиперболический синус аргумента cosh: 1 аргумент,
гиперболический косинус аргумента tanh: 1 аргумент, гиперболический тангенс аргумента
аргумент asinh: 1 аргумент, обратный гиперболический синус аргумента acosh: 1
аргумент, обратный гиперболический косинус аргумента atanh: 1 аргумент,
обратный гиперболочный тангенс аргумента ln: 1 аргумент, натуральный логарифм
аргумент exp: 1 аргумент, константа e возведена в степень аргумента
log: 1 аргумент, десятичный логарифм аргумента sqrt: 10 аргумент, квадрат
корень аргумента abs: 1 аргумент, абсолютное значение аргумента floor: 1
аргумент, наибольшее целое число, не большее, чем аргумент round: 1 аргумент,
ближайшее целое число с округлением связей от

нуль

ceil: 1 аргумент, наименьшее целое число не меньше аргумента min: 2 аргумента,
min (x, y) возвращает y, если (x> y), x иначе max: 2 аргумента, max (x, y) возвращает y
if (x <y), x иначе mod: 2 аргумента, mod (x, y) = x - y * floor (x / y) или 0, если
y == 0 ограничение: 3 аргумента, ограничение (x, low, high) = min (max (x, low), high)

-metric-слияние ОБЪЕДИНЕНИЕ МЕТРИЧЕСКИХ ФАЙЛОВ В НОВЫЙ ФАЙЛ

wb_command -metric-слияние

- output - метрика вывода

[-metric] - повторяемый - укажите входную метрику

- файл метрики для использования столбцов из

[-column] - repeatable - выберите один столбец для использования

- номер или название столбца

[-up-to] - использовать полный диапазон столбцов

- номер или название последнего столбца, который нужно включить

[-reverse] - использовать диапазон в обратном порядке

Берет один или несколько файлов показателей и создает новый файл показателей путем объединения
колонны из них. Входные файлы метрик должны иметь одинаковое количество вершин.
и такая же структура.

Пример: wb_command -metric-слияние out.func.gii -метрический первый.func.gii -колонка 1
-метрический второй.func.gii

В этом примере будет использоваться первый столбец из first.func.gii, за которым следуют все
столбцы из second.func.gii и запишите эти столбцы в out.func.gii.

-метрическая-палитра УСТАНОВИТЕ ПАЛИТРУ МЕТРИЧЕСКОГО ФАЙЛА

wb_command -метрическая-палитра

- метрика, которую нужно изменить - режим отображения

[-column] - выбрать один столбец

- номер или название столбца

[-pos-percent] - мин / макс процент для положительной раскраски данных

- процентиль для наименее положительных данных - в
процентиль для наиболее положительных данных

[-neg-percent] - мин / макс процент для раскраски негативных данных

- процентиль для наименее отрицательных данных - в
процентиль для наиболее отрицательных данных

[-pos-user] - пользовательские минимальные / максимальные значения для положительной раскраски данных

- значение наименее положительных данных - Значение
за самые положительные данные

[-neg-user] - пользовательские минимальные / максимальные значения для раскраски отрицательных данных

- значение для наименее отрицательных данных - Значение
для самых негативных данных

[-interpolate] - интерполировать цвета

- логическое значение, следует ли интерполировать

[-disp-pos] - отображать положительные данные

- логическое значение, отображать ли

[-disp-neg] - отображать положительные данные

- логическое значение, отображать ли

[-disp-zero] - отображать данные ближе к нулю, чем минимальная отсечка

- логическое значение, отображать ли

[-palette-name] - установить используемую палитру

- название палитры

[-thresholding] - установить порог

- установка порога - показывать значения внутри или вне пороговых значений
- нижний порог - верхний порог

Исходный файл метрики перезаписывается измененной версией.
By

по умолчанию все столбцы файла метрики настроены на новые настройки, используйте
-колонка возможность изменить только один столбец. Параметры сопоставления не указаны в
варианты будут взяты из первого столбца. В аргумент должен быть одним из
следующие:

MODE_AUTO_SCALE MODE_AUTO_SCALE_ABSOLUTE_PERCENTAGE MODE_AUTO_SCALE_PERCENTAGE
MODE_USER_SCALE

В аргумент -имя-палитры должно быть одним из следующих:

PSYCH PSYCH-NO-NONE ROY-BIG ROY-BIG-BL Оранжевый-желтый Gray_Interp_Positive
Gray_Interp clear_brain videen_style фидл raich4_clrmid raich6_clrmid HSB8_clrmid
RBGYR20 RBGYR20P POS_NEG красно-желтый сине-голубой FSL power_surf fsl_red fsl_green
fsl_blue fsl_yellow JET256

В аргумент -пороговая обработка должно быть одним из следующих:

THRESHOLD_TYPE_OFF THRESHOLD_TYPE_NORMAL

В аргумент -пороговая обработка должно быть одним из следующих:

THRESHOLD_TEST_SHOW_OUTSIDE THRESHOLD_TEST_SHOW_INSIDE

-метрический-уменьшить ВЫПОЛНИТЕ ОПЕРАЦИЮ РЕДУКЦИИ ПО МЕТРИЧЕСКИМ СТОЛБНАМ

wb_command -метрический-уменьшить

- показатель, который нужно уменьшить - оператор сокращения для использования
- output - метрика вывода

[-exclude-outliers] - исключить выбросы из каждого вектора по стандарту

отклонение - количество стандартных отклонений ниже среднего до

включают

- количество стандартных отклонений выше среднего до

включают

Для каждой вершины поверхности принимает данные по столбцам как вектор и выполняет
указанное сокращение на нем, поместив результат в единственный выходной столбец в
эта вершина. Операторы редукции следующие:

MAX: максимальное значение MIN: минимальное значение INDEXMAX: отсчитываемый от 1 индекс
максимальное значение INDEXMIN: отсчитываемый от 1 индекс минимального значения SUM: сложить все значения
ПРОДУКТ: умножить все значения MEAN: среднее значение данных STDEV: стандарт
отклонение (знаменатель N) SAMPSTDEV: стандартное отклонение выборки (N-1
знаменатель) РАЗБИРАТЕЛЬНОСТЬ: дисперсия данных. МЕДИАНА: медиана данных.
MODE: режим данных COUNT_NONZERO: количество ненулевых элементов в
данным

-метрическая регрессия РЕГРЕСС-МЕТРИКИ ВНЕ МЕТРИЧЕСКОГО ФАЙЛА

wb_command -метрическая регрессия

- метрика, от которой нужно отступить - output - метрика вывода

[-roi] - только регресс внутри ROI

- область, которую нужно использовать для регрессии, как метрика

[-column] - выберите один столбец для регрессии

- номер или название столбца

[-remove] - повторяемый - укажите показатель для регрессии

- файл метрики для использования

[-remove-column] - выберите столбец для использования, а не все

- номер или название столбца

[-keep] - повторяемый - укажите показатель для включения в регрессию, но не

Удалить - файл метрики для использования

[-keep-column] - выберите столбец для использования, а не все

- номер или название столбца

Для каждого регрессора его среднее значение по поверхности вычитается из его данных. Каждый
входная карта затем сравнивается с ними и с постоянным членом. Результирующий
регрессивные наклоны всех регрессоров, указанных с помощью -Удалить умножаются на их
соответствующие карты регрессора, и они вычитаются из входной карты.

-metric-remove-острова УДАЛЕНИЕ ОСТРОВОВ ИЗ МЕТРИКИ ROI

wb_command -metric-remove-острова

- поверхность, используемая для информации о соседях - входная рентабельность инвестиций
метрика - output - показатель ROI выхода

[-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо их вычисления из

поверхность - исправленные вершинные площади, как метрика

Находит все связанные области в ROI и обнуляет все, кроме самой большой, в
с точки зрения площади поверхности.

-метрика-ресемпл ПРЕОБРАЗОВАНИЕ МЕТРИЧЕСКОГО ФАЙЛА НА ДРУГУЮ СЕТЬ

wb_command -метрика-ресемпл

- файл метрики для повторной выборки - поверхность сферы с
сетка, которая является метрикой

в настоящее время на

- поверхность сферы, которая совпадает с

и имеет желаемую выходную сетку

- название метода - output - метрика вывода

[-area-surfs] - указать поверхности для коррекции площади вершин на основе

- соответствующая анатомическая поверхность с

сетке

- соответствующая анатомическая поверхность с сетка

[-area-metrics] - указать метрики площади вершины для коррекции площади на основе

на - файл метрики с площадями вершин для

сетке

- файл метрики с площадями вершин для сетка

[-current-roi] - использовать входную рентабельность инвестиций в текущей сетке, чтобы исключить не-данные

вершины - рентабельность инвестиций в виде файла с показателями

[-valid-roi-out] - вывести ROI вершин, которые получили данные из валидных

исходные вершины - output - выходная рентабельность инвестиций в качестве метрики

[-largest] - использовать только значение вершины с наибольшим весом

Повторная выборка файла метрики для двух сферических поверхностей, которые находятся в регистре. Если
метод корректирует площадь, точно один из -площадь-серфинг or -площадь-метрики должен быть
указано.

The -ток-рои опция маскирует только вход, выход может быть немного расширен в
сравнение, рассмотрите возможность использования -метрическая маска на выходе при использовании -ток-рои.

The -самый большой опция приводит к поведению ближайшей вершины при использовании с BARYCENTRIC,
вместо средневзвешенного значения используется значение исходной вершины, которое
имеет наибольший вес для каждой целевой вершины. Это в основном предназначено для
повторная выборка показателей рентабельности инвестиций.

В аргумент должен быть одним из следующих:

ADAP_BARY_AREA БАРИЦЕНТРИЧЕСКИЙ

Метод ADAP_BARY_AREA рекомендуется для обычных метрических данных, поскольку он
должен использовать все данные во время понижающей дискретизации, в отличие от BARYCENTRIC.

-метрический-роис-из-экстремумов СОЗДАВАЙТЕ МЕТРИЧЕСКИЕ КАРТЫ ROI ИЗ ЭКСТРЕМАЛЬНЫХ КАРТ

wb_command -метрический-роис-из-экстремумов

- поверхность, используемая для геодезических расстояний - входная метрика
файл - предел геодезического расстояния от вершины, мм - вывод -
выходной файл метрики

[-gaussian] - генерировать гауссовское ядро ​​вместо плоского ROI

- сигма гауссова ядра в мм

[-roi] - выбрать интересующий регион для использования

- площадь для использования в качестве метрики

[-overlap-logic] - как обрабатывать перекрывающиеся области интереса, по умолчанию РАЗРЕШИТЬ

- метод устранения перекрытий

[-column] - выберите единственный входной столбец для использования

- номер или название столбца

Для каждого ненулевого значения на каждой карте создайте карту с ROI вокруг этого местоположения.
Если же линия индикатора -гауссовский задана опция, то выводятся нормализованные гауссовские ядра
вместо ROI. В аргумент -забавка-логика должно быть одним из РАЗРЕШИТЬ,
БЛИЖАЙШИЙ или ИСКЛЮЧИТЬ. РАЗРЕШИТЬ - это значение по умолчанию, означающее, что РИ обрабатываются.
независимо и могут перекрываться. БЛИЖАЙШИЙ означает, что рентабельность инвестиций не может пересекаться, и что
ни одна область интереса не содержит вершин, которые находятся ближе к другой исходной вершине. ИСКЛЮЧИТЬ означает
что области интереса не могут перекрываться, и что любая вершина в пределах диапазона более чем одной области интереса
не принадлежит ни к какой рентабельности инвестиций.

-метрический-роис-к-границе Нарисуйте границы вокруг метрической росы

wb_command -метрический-роис-к-границе

- поверхность, используемая для информации о соседях - входная метрика
содержащие ROI - имя, используемое для класса выходных границ
- output - выходной файл границы

[-placement] - установить, как далеко отрисовываются точки границы края.

- дробь по ребру изнутри вершины (по умолчанию 0.33)

[-column] - выбрать один столбец

- номер или название столбца

Для каждого столбца области интереса находит все ребра на сетке, которые пересекают границу
ROI и проводит через них границы. По умолчанию это делается для всех столбцов в
входной файл, используя имя карты в качестве имени границы.

-метрическое сглаживание СГЛАЖДАЙТЕ МЕТРИЧЕСКИЙ ФАЙЛ

wb_command -метрическое сглаживание

- поверхность, которую нужно загладить - метрика для сглаживания
- сигма для функции гауссова ядра, в мм
- output - метрика вывода

[-roi] - выбрать интересующую область для сглаживания

- рентабельность инвестиций в сглаживание, как метрика

[-match-columns] - для каждого входного столбца использовать соответствующий столбец

из рентабельности

[-fix-zeros] - обрабатывать нулевые значения как не данные

[-column] - выберите один столбец для сглаживания

- номер или название столбца

[-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо их вычисления из

поверхность - исправленные вершинные площади, как метрика

[-method] - выбрать метод сглаживания, по умолчанию GEO_GAUSS_AREA

- название метода сглаживания

Выровняйте метрический напильник по поверхности.
По умолчанию сглаживает все входные столбцы

на всей поверхности указать -колонка использовать только один входной столбец и -рои в
сглаживание только там, где показатель рентабельности инвестиций больше 0, вывод нулей в других местах.

Когда используешь -рои, входные данные за пределами области интереса не используются для вычисления сглаженного
ценности. По умолчанию первый столбец метрики рентабельности инвестиций используется для всех входных данных.
столбцы. Когда -match-столбцы указывается в -рои вариант, ввод и рентабельность инвестиций
метрики должны иметь одинаковое количество столбцов, а для индекса каждого входного столбца
тот же индекс столбца используется в метрике рентабельности инвестиций. Если -match-столбцы вариант
-рои используется в то время как -колонка опция также используется, количество столбцов должно
соответствие между рентабельностью инвестиций и входной метрикой, и он будет использовать столбец рентабельности инвестиций с
индекс выбранного входного столбца.

The -исправить-нули опция заставляет сглаживание не использовать входное значение, если оно равно нулю,
но все равно записать сглаженное значение в вершину. Это полезно для нулей, которые
указывают на недостаток информации, не позволяя им снизить интенсивность
соседние вершины, давая нулю экстраполированное значение.

The -исправленные-площади вариант предназначен для случаев, когда неизбежно сглаживание
средняя поверхность группы, это лишь приблизительная поправка на уменьшение
структура в группе средней поверхности. Данные лучше сгладить на
по возможности перед усреднением.

Допустимые значения для являются:

GEO_GAUSS_AREA - использует геодезическое гауссовское ядро ​​и нормализует на основе вершины
площадь для более надежной работы на неровных поверхностях

GEO_GAUSS_EQUAL - использует геодезическое гауссовское ядро ​​и нормализует каждое
вершина имеет одинаковую важность

GEO_GAUSS - соответствует геодезическому гауссовскому сглаживанию из каретки 5, но не проверяет
ядра из-за неравной важности

Метод GEO_GAUSS_AREA используется по умолчанию, потому что обычно это правильный выбор.
GEO_GAUSS_EQUAL может быть правильным выбором, когда сумма значений вершин больше
имеет смысл тогда поверхностный интеграл (сумма значений. * площадей), например, когда
сглаживание площадей вершин (сумма - это общая площадь поверхности, а поверхность
интеграл - это сумма квадратов площадей вершин). Метод GEO_GAUSS не
рекомендуется, он существует в основном для воспроизведения методов исследований, проведенных с помощью caret5.
геодезическое сглаживание.

-метрика-статистика ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТАТИСТИКА НА МЕТРИЧЕСКОМ ФАЙЛЕ

wb_command -метрика-статистика

- входная метрика

[-reduce] - использовать операцию сокращения

- операция редукции

[-percentile] - укажите значение в процентиле

- процентиль для поиска

[-column] - отображать вывод только для одного столбца

- номер или название столбца

[-roi] - рассматривать только данные внутри roi

- рентабельность инвестиций в виде файла с показателями

[-match-maps] - каждый столбец ввода использует соответствующий столбец

из файла roi

[-show-map-name] - печатать индекс и имя карты перед каждым выводом

Для каждого столбца ввода печатается одно число, полученное в результате
указанное сокращение или процентильная операция. Использовать -колонка чтобы дать результат только для
один столбец. Использовать -рои рассматривать только данные в пределах региона. Ровно один из
-уменьшать or -процентиль необходимо указать.

Аргумент против -уменьшать вариант должен быть одним из следующих:

MAX: максимальное значение MIN: минимальное значение INDEXMAX: отсчитываемый от 1 индекс
максимальное значение INDEXMIN: отсчитываемый от 1 индекс минимального значения SUM: сложить все значения
ПРОДУКТ: умножить все значения MEAN: среднее значение данных STDEV: стандарт
отклонение (знаменатель N) SAMPSTDEV: стандартное отклонение выборки (N-1
знаменатель) РАЗБИРАТЕЛЬНОСТЬ: дисперсия данных. МЕДИАНА: медиана данных.
MODE: режим данных COUNT_NONZERO: количество ненулевых элементов в
данным

-метрика-tfce СДЕЛАТЬ TFCE НА МЕТРИЧЕСКОМ ФАЙЛЕ

wb_command -метрика-tfce

- поверхность для вычислений - метрика для запуска TFCE
- output - метрика вывода

[-presmooth] - сгладить метрику перед запуском TFCE

- сигма для ядра сглаживания Гаусса, в мм

[-roi] - выбрать интересующий регион для запуска TFCE.

- область для запуска TFCE в качестве метрики

[-parameters] - установить параметры для интеграла TFCE

- экспонента для кластерной области (по умолчанию 1.0) - экспонента для порогового значения
(по умолчанию 2.0)

[-column] - выбрать один столбец

- номер или название столбца

[-corrected-sizes] - области вершин для использования вместо их вычисления из

поверхность - исправленные вершинные площади, как метрика

Безпороговое усиление кластера - это метод увеличения относительного значения
регионы, которые будут формировать кластеры в стандартном пороговом тесте. Это
достигается путем оценки интеграла:

е (h, p) ^ E * h ^ H * dh

в каждой вершине p, где h изменяется от 0 до максимального значения в данных, а e (h,
p) - протяженность кластера, содержащего вершину p на пороге h. Отрицательный
значения аналогичным образом улучшаются за счет отрицания данных, запуска одного и того же процесса и
отрицая результат.

Когда используешь -пресглаживание -исправленные-площади, обратите внимание, что это приблизительный
коррекция в рамках алгоритма сглаживания (коррекция TFCE точная). Делает
сглаживание отдельных поверхностей перед усреднением / TFCE предпочтительнее, когда это возможно,
чтобы лучше привязать размер ядра сглаживания к исходному размеру элемента.

Метод TFCE объясняется в: Smith SM, Nichols TE., «Беспороговый кластер.
улучшение: решение проблем сглаживания, пороговой зависимости и
локализация в кластерном выводе ». Neuroimage. 2009 января 1;44(1): 83-98. PMID:
18501637

-сопоставление метрики с объемом СОСТАВИТЬ МЕТРИЧЕСКИЙ ФАЙЛ НА ОБЪЕМ

wb_command -сопоставление метрики с объемом

- входной файл метрики - поверхность для использования координат от
- файл тома в желаемом пространстве выходного тома -
output - файл выходного тома

[-nearest-vertex] - использовать значение из вершины, ближайшей к вокселю

центр - как далеко от поверхности отображать значения в воксели, в мм

[-ribbon-constrained] - использовать алгоритм сопоставления с ограничением ленты

- внутренняя поверхность ленты - внешняя поверхность
лента

[-voxel-subdiv] - деление вокселей при оценке веса вокселей

- количество подразделений, по умолчанию 3

Отображает значения из файла метрики в файл тома.
Вы должны указать

ровно один вариант метода сопоставления.
The -ближайшая-вершина метод использует

значение из вершины, ближайшей к центру вокселя (полезно для целочисленных значений). В
-привязанный лентой метод использует тот же метод, что и в -Volume-to-Surface-Отображение,
затем использует веса в обратном порядке.

-метрическая-векторная-операция ВЫПОЛНЯЙТЕ ВЕКТОРНЫЕ ОПЕРАЦИИ С МЕТРИЧЕСКИМИ ФАЙЛАМИ

wb_command -метрическая-векторная-операция

- первый векторный входной файл - второй векторный файл ввода
- какую векторную операцию делать - output - выходной файл

[-normalize-a] - нормализовать векторы первого ввода

[-normalize-b] - нормализовать векторы второго входа

[-normalize-output] - нормализовать выходные векторы (не действует для точки

продукт)

[-magnitude] - вывести величину результата (не действует для точки

продукт)

Выполняет векторную операцию с двумя метрическими файлами (число которых должно быть кратно 3
столбцы). Любой из входов может иметь несколько векторов (более 3 столбцов),
но не оба (по крайней мере, в одном должно быть ровно 3 столбца). В -величина и
-нормализовать-выход параметры нельзя указывать вместе или с операцией, которая
возвращает скаляр (скалярный продукт). В параметр должен быть одним из
следующие:

ТОЧКА ПЕРЕКРЕСТНАЯ ДОБАВИТЬ ВЫЧЕТ

-metric-vector-to-roi УЗНАЙТЕ, НАПРАВЛЯЮТ ЛИ ВЕКТОРЫ НА Рентабельность инвестиций

wb_command -metric-vector-to-roi

- поверхность для вычислений - рентабельность инвестиций для поиска самого короткого
путь к - output - метрика вывода

[-roi] - не вычислять вершины за пределами ROI

- регион для вычисления внутри, как метрика

В каждой вершине вычислите вектор от начала кратчайшего пути к ROI.

-метрическая взвешенная статистика ВЕСОВАЯ ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТАТИСТИКА НА МЕТРИЧЕСКОМ ФАЙЛЕ

wb_command -метрическая взвешенная статистика

- входная метрика

[-area-surface] - использовать площади вершин как веса

- поверхность для использования в вершинных областях

[-weight-metric] - использовать веса из файла метрики

- файл метрики, содержащий веса

[-column] - отображать вывод только для одного столбца

- номер или название столбца

[-roi] - рассматривать только данные внутри roi

- рентабельность инвестиций в виде файла с показателями

[-match-maps] - каждый столбец ввода использует соответствующий столбец

из файла roi

[-mean] - вычислить средневзвешенное значение

[-stdev] - вычислить взвешенное стандартное отклонение

[-sample] - оценить стандартное отклонение совокупности по выборке

[-percentile] - вычислить взвешенный процентиль

- процентиль для поиска

[-sum] - вычислить взвешенную сумму

[-show-map-name] - печатать индекс и имя карты перед каждым выводом

Для каждого столбца ввода печатается одно число, полученное в результате
указанная операция. Использовать -колонка чтобы получить результат только для одного столбца. Использовать
-рои рассматривать только данные в пределах региона. Ровно один из -уменьшать or
-процентиль должен быть указан, и ровно один из -жадный, -stdev, -процентиль or
-сумма необходимо указать.

. -сумма -площадь (или -вес-метрика с метрикой, содержащей аналогичные
data) эквивалентно интегрированию по площади поверхности. Например, если
вы хотите найти площадь поверхности в пределах рентабельности инвестиций, сделайте следующее:

$ wb_command -метрическая взвешенная статистика roi.func.gii -сумма -площадь-поверхность

Midthickness.surf.gii

-nifti-информация ИНФОРМАЦИЯ О ДИСПЛЕЕ ОБ NIFTI / CIFTI ФАЙЛЕ

wb_command -nifti-информация

- файл nifti / cifti для изучения

[-print-header] - отображать содержимое заголовка

[-print-matrix] - выводить значения в матрицу (только cifti)

[-print-xml] - распечатать cifti XML (только cifti)

[-version] - преобразовать XML в конкретную версию CIFTI (по умолчанию

версия файла cifti) - используемая версия CIFTI

Вы должны указать хотя бы один -Распечатать-* вариант.

-probtrackx-точка-конвертировать ПРЕОБРАЗОВАТЬ ФАЙЛ .DOT ИЗ PROBTRACKX в CIFTI

wb_command -probtrackx-точка-конвертировать

- входной файл .dot - output - выходной файл cifti

[-row-voxels] - выводимое отображение по строке будет вокселами

- текстовый файл, содержащий индексы IJK для вокселей

использовал

- объем этикетки с используемыми размерами и формой, с

структурные метки

[-row-surface] - выводимое отображение по строке будет вершинами поверхностей

- файл метрики с положительными значениями на всех используемых узлах

[-row-cifti] - взять отображение по строке из файла cifti

- файл cifti, из которого нужно взять отображение - какой размер
возьмите карту, СТРОКА или КОЛОННА

[-col-voxels] - выходное отображение по столбцу будет вокселами

- текстовый файл, содержащий индексы IJK для вокселей

использовал

- объем этикетки с используемыми размерами и формой, с

структурные метки

[-col-surface] - выходное отображение вдоль столбца будет поверхностным

вершины - файл метрики с положительными значениями на всех используемых узлах

[-col-cifti] - взять отображение по столбцу из файла cifti

- файл cifti, из которого нужно взять отображение - какой размер
возьмите карту, СТРОКА или КОЛОННА

[-transpose] - транспонировать входную матрицу

[-make-simric] - преобразовать входной полуквадрат в выход полной матрицы

ПРИМЕЧАНИЕ: ровно один -строка вариант и один -кол опция должна быть использована.

Если во входном файле индексы не отсортированы в правильном порядке, это
команда может занять больше времени, чем ожидалось. Указание -транспонировать перенесет
входную матрицу, прежде чем пытаться поместить ее значения в файл cifti, который
в настоящее время требуется по крайней мере для matrix2, чтобы отображать его должным образом. Как
файл cifti отображается на основе которого -строка указана опция: если -ровоксели
указан, то он будет отображать данные по срезам тома. Названия этикеток в
Том (ы) метки должны иметь следующие имена, другие имена игнорируются:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT МОЗЖОЧЕК ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT КОРА
DIENCEPHALO_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALO_VENTRAL_RIGHT ГИППОКАМПУС_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

-set-карты-имена УСТАНОВИТЕ ИМЯ ОДНОЙ ИЛИ НЕСКОЛЬКИХ КАРТ В ФАЙЛЕ

wb_command -set-карты-имена

- файл для установки названий карт

[-name-file] - использовать текстовый файл для замены всех названий карт

- текстовый файл, содержащий названия карт, по одному в каждой строке

[-map] - repeatable - указать карту для установки имени

- индекс карты для изменения названия - имя, которое нужно установить для
карта

Устанавливает имя одной или нескольких карт для метрики, формы, метки, объема, cifti scalar или
файлы этикеток cifti. Если -имя-файла опция не указана, -map вариант должен
указывать хотя бы один раз. В -map опция не может быть использована, когда -имя-файла is
указано.

-множество-структура УСТАНОВИТЬ СТРУКТУРУ ФАЙЛА ДАННЫХ

wb_command -множество-структура

- файл для установки структуры - структура для установки
файл в

[-surface-type] - установить тип поверхности (используется только если файл

поверхностный файл) - название типа поверхности

[-surface-secondary-type] - установить вторичный тип поверхности (только

используется, если файл является поверхностным файлом) - наименование вторичного типа поверхности

Существующий файл изменяется и перезаписывается с тем же именем файла.
Действительный

значения для имени структуры:

CORTEX_LEFT CORTEX_RIGHT МОЗЖОЧЕК ACCUMBENS_LEFT ACCUMBENS_RIGHT ALL_GREY_MATTER
ALL_WHITE_MATTER AMYGDALA_LEFT AMYGDALA_RIGHT BRAIN_STEM CAUDATE_LEFT CAUDATE_RIGHT
CEREBELLAR_WHITE_MATTER_LEFT CEREBELLAR_WHITE_MATTER_RIGHT CEREBELLUM_LEFT
CEREBELLUM_RIGHT CEREBRAL_WHITE_MATTER_LEFT CEREBRAL_WHITE_MATTER_RIGHT КОРА
DIENCEPHALO_VENTRAL_LEFT DIENCEPHALO_VENTRAL_RIGHT ГИППОКАМПУС_LEFT
HIPPOCAMPUS_RIGHT INVALID OTHER OTHER_GREY_MATTER OTHER_WHITE_MATTER PALLIDUM_LEFT
PALLIDUM_RIGHT PUTAMEN_LEFT PUTAMEN_RIGHT THALAMUS_LEFT THALAMUS_RIGHT

Допустимые имена для типа поверхности:

НЕИЗВЕСТНАЯ РЕКОНСТРУКЦИЯ АНАТОМИЧЕСКОГО НАДУВНОГО ОЧЕНЬ СФЕРИЧЕСКОГО ПОЛУСФЕРИЧЕСКОГО
ЭЛЛИПСОИДНЫЙ ПЛОСКИЙ КОРПУС

Допустимые имена для вторичного типа поверхности:

НЕДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ СЕРЫЙ_БЕЛЫЙ ПИАЛ СРЕДНЕЙ ТОЛЩИНЫ

-шоу-сцена ПЕРЕДАЧА СЦЕНЫ В ФАЙЛ ИЗОБРАЖЕНИЯ ЗА ЭКРАНОМ

wb_command -шоу-сцена

- файл сцены - имя или номер (начиная с единицы)
сцены в

файл сцены

- имя файла выходного изображения - ширина выходных изображений
- высота выходных изображений

Рендеринг содержимого окон браузера, отображаемых в сцене, в файлы изображений. В
имя файла изображения должно быть похоже на «capture.png». Если нужно только одно изображение
render, имя изображения не изменится. Если нужно отобразить более одного изображения,
в имя изображения будет вставлен индекс: "capture_01.png", "capture_02.png"
и так далее

Формат изображения определяется расширением файла изображения. Форматы изображений
в этой системе доступны:

bmp ico jpeg jpg png ppm tif tiff xbm xpm

Примечание. Доступные форматы изображений зависят от операционной системы.

-знаковое расстояние до поверхности ВЫЧИСЛЕНИЕ ЗАПИСАННОГО РАССТОЯНИЯ ОТ ОДНОЙ ПОВЕРХНОСТИ ДО ДРУГОЙ

wb_command -знаковое расстояние до поверхности

- поверхность сравнения для измерения расстояния со знаком
- контрольная поверхность, определяющая расстояние со знаком

функция

- output - метрика вывода

[-winding] - метод намотки для проверки точечной внутренней поверхности

- название метода (по умолчанию EVEN_ODD)

Вычислить функцию расстояния со знаком для опорной поверхности в каждой вершине на
поверхность сравнения. ПРИМЕЧАНИЕ: это отношение НЕ симметрично, линия от
вершина к ближайшей точке на поверхности 'ref' (той, которая определяет подписанный
distance) будет выравниваться только по нормали к поверхности 'ref'. Действительный
Спецификаторы методов намотки следующие:

EVEN_ODD (по умолчанию) ОТРИЦАТЕЛЬНЫЙ НЕНУЛЕВОЙ НОРМАЛЬНЫЙ

В методе NORMALS используются нормали треугольников и ребер или ближайший треугольник.
попадание лучом из точки. Этот метод может быть немного быстрее, но только
надежен для закрытых поверхностей, которые не пересекаются сами собой. Все остальные
методы подсчитывают входное (положительное) и выходное (отрицательное) пересечение вертикального луча из
точка, затем считается внутренней, если сумма нечетная, отрицательная или отличная от нуля,
соответственно.

-spec-файл-слияние ОБЪЕДИНЕНИЕ ДВУХ ФАЙЛОВ В ОДИН

wb_command -spec-файл-слияние

- первый файл спецификации для слияния - второй файл спецификации для слияния
- output - выходной файл спецификации

Выходной файл спецификации содержит все файлы, которые есть в любом из входных файлов спецификации.

-поверхностная-аффинная-регрессия РЕГРЕССИРУЙТЕ АФФИННОЕ ПРЕОБРАЗОВАНИЕ МЕЖДУ ПОВЕРХНОСТЬЮ НА ОДНОЙ СЕТЕ

wb_command -поверхностная-аффинная-регрессия

- поверхность деформироваться - поверхность для соответствия координатам
- output - выходной аффинный файл

Используйте линейную регрессию, чтобы вычислить аффинное значение, которое минимизирует сумму квадратов
разность координат между целевой поверхностью и деформированной исходной поверхностью.
Обратите внимание, что это имеет тенденцию сжимать деформируемую поверхность. Выход
записывается как «мировая» матрица НИФТИ, см. -конвертировать-аффинно преобразовать его для использования в
другое программное обеспечение.

-поверхность-применить-аффинный ПРИМЕНИТЬ AFFINE ПРЕОБРАЗОВАНИЕ К ПОВЕРХНОСТНОМУ ФАЙЛУ

wb_command -поверхность-применить-аффинный

- поверхность для преобразования - аффинный файл - вывод
- выходная преобразованная поверхность

[-flirt] - ДОЛЖЕН использоваться, если affine является аффинным flirt.

- исходный объем, используемый при генерации аффинного
- целевой объем, используемый при генерации аффинного

Для матриц флирта необходимо использовать -флиртовать вариант, потому что матрицы флирта не
полное описание преобразования координат, которое они представляют. Если -флиртовать
вариант отсутствует, аффинное значение должно быть изящным аффинным "миром", которое может быть
полученный с -конвертировать-аффинно command или aff_conv из пакета 4dfp.

-поверхность-применить-варпполе ПРИМЕНИТЬ WARPFIELD К ПОВЕРХНОСТНОМУ ФАЙЛУ

wb_command -поверхность-применить-варпполе

- поверхность для преобразования - ОБРАТНОЕ варп-поле
- output - выходная преобразованная поверхность

[-fnirt] - ДОЛЖЕН использоваться при использовании fnirt warpfield

- переднее варп-поле

ПРИМЕЧАНИЕ: для деформации поверхности требуется ОБРАТНОЕ поле искривления, используемое для деформации поверхности.
объем, с которым он совпадает. Заголовок передней основы необходим для -фнирт
вариант, чтобы правильно интерпретировать смещения в поле искривления fnirt.

Если же линия индикатора -фнирт опции нет, варп-поле должно быть изящным 'миром'
поле искривления, которое можно получить с помощью -конвертировать-варпполе команда.

-поверхность-средняя СРЕДНИЕ ПОВЕРХНОСТНЫЕ ФАЙЛЫ ВМЕСТЕ

wb_command -поверхность-средняя

- output - выход усредненной поверхности

[-stddev] - вычислить стандартное отклонение трехмерной выборки

- output - метрика вывода для 3D образца

стандартное отклонение

[-неопределенность] - вычислить caret5 'неопределенность'

- output - метрика выхода для неопределенности

[-surf] - repeatable - указать поверхность, которую нужно включить в среднее значение.

- напильником для усреднения

Стандартное отклонение трехмерной выборки вычисляется как sqrt (sum (squaredlength (xyz -
среднее (xyz))) / (n - 1)) '.

Неопределенность - это устаревшая мера, используемая в caret5, и вычисляется как сумма (длина (xyz
- означает (xyz))) / n '.

-поверхность-ближайшая-вершина НАЙДИТЕ БЛИЖАЙШУЮ ПОВЕРХНОСТЬ К КООРДИНАТАМ

wb_command -поверхность-ближайшая-вершина

- поверхность для использования - текстовый файл с координатами
- output - выходной текстовый файл с номерами вершин

Для каждой тройки координат XYZ найдите ближайшую вершину на поверхности и выведите
номер его вершины в текстовый файл.

-поверхность-координаты-метрики СОЗДАТЬ МЕТРИЧЕСКИЙ ФАЙЛ ПОВЕРХНОСТНЫХ КООРДИНАТ

wb_command -поверхность-координаты-метрики

- поверхность для использования координат - вывод -
выходная метрика

Помещает координаты поверхности в метрический файл с тремя картами в виде x, y, z.

-поверхностный-корковый-слой СОЗДАЙТЕ ПОВЕРХНОСТЬ, АППРОКСИМАЦИЯ КОРТИКАЛЬНОГО СЛОЯ

wb_command -поверхностный-корковый-слой

- поверхность белого вещества - пиальная поверхность
- в какой объемной доле размещать слой - вывод -
выходная поверхность

[-placement-out] - вывести размещение как долю расстояния от пиала

к белому - output - метрика вывода

[-untwist] - временная опция для сравнения методов, указать использовать старую

метод

Входные поверхности должны иметь соответствие вершин.
Выходная поверхность

создается путем размещения вершин между двумя поверхностями таким образом, чтобы замкнутая
объем внутри любого небольшого участка новой и белой поверхности - это заданная доля
объема того же пятна между пиальной и белой поверхностями (т. е.
указание 0 даст белую поверхность, 1 даст пиальную поверхность).

-поверхность-создать-сферу СОЗДАЙТЕ СФЕРУ С СОГЛАСОВАННЫМИ ЗОНАМИ ВЕРТЕКСА

wb_command -поверхность-создать-сферу

- желаемое количество вершин - вывод - вывод
сфера

Создает сферу, регулярно разделяя треугольники икосаэдра.
как можно ближе к желаемому количеству вершин и изменив его, чтобы
очень похожие области вершин для всех вершин. Чтобы сгенерировать пару совпадающих по вершинам
левую и правую сферы, используйте эту команду, затем -поверхность-флип-lr для создания
другая сфера, тогда -множество-структура на каждом. Например:

$ wb_command -surface-create-Sphere 6000 Sphere.6k.R.surf.gii
$ wb_command -surface-flip-lr Sphere.6k.R.surf.gii Sphere.6k.L.surf.gii
$ wb_command -set-structure Sphere.6k.R.surf.gii CORTEX_RIGHT
$ wb_command -set-structure Sphere.6k.L.surf.gii CORTEX_LEFT

-поверхностный вырез-повторная выборка ПОВТОРИТЬ ОБРЕЗАННУЮ ПОВЕРХНОСТЬ

wb_command -поверхностный вырез-повторная выборка

- файл поверхности для ресамплинга - поверхность сферы
с сеткой, что входная поверхность

в настоящее время на

- поверхность сферы, которая совпадает с

и имеет желаемую выходную сетку

- output - файл выходной поверхности

Повторная выборка файла поверхности с учетом двух совпадающих сферических поверхностей.
Используется барицентрическая передискретизация, потому что она обычно лучше передискретизирует
поверхностей, и потому что это необходимо в любом случае для определения новой топологии.

-поверхностное искажение ИЗМЕРЬТЕ ИСКАЖЕНИЯ МЕЖДУ ПОВЕРХНОСТЬЮ

wb_command -поверхностное искажение

- эталонная поверхность - искаженный
поверхность - output - метрика выходных искажений

[-smooth] - сгладить данные области

- сигма сглаживающего ядра в мм

[-caret5-method] - использовать метод искажения поверхности из caret5

[-edge-method] - вычислить искажение длин кромок, а не площадей

Эта команда, когда не используется -caret5-метод or -красный метод, эквивалентно использованию
-поверхности-вершины-области на каждой поверхности, сглаживая обе выходные метрики с помощью
GEO_GAUSS_EQUAL на поверхности, откуда они пришли, если -гладкий; плавный указано, и
затем используя формулу 'ln (искажено / ссылка) /ln(2) 'на сглаженных результатах.

Когда используешь -caret5-метод, он использует метод искажения поверхности из caret5, который
берет логарифм по основанию 2 отношения площадей тайлов, затем усредняет эти результаты на
каждую вершину, а затем сглаживает результат на опорной поверхности.

Когда используешь -красный метод, -гладкий; плавный параметр игнорируется, и вывод на каждом
вершина - это среднее значение 'abs (ln (refEdge / distortEdge) /ln(2)) 'по всем ребрам
подключен к вершине.

-поверхность-флип-lr ОТЗЕРКАЙТЕ ПОВЕРХНОСТЬ ЧЕРЕЗ САМОЛЕТ YZ

wb_command -поверхность-флип-lr

- переворачиваемая поверхность - output - вывод перевернутой поверхности

Эта команда отменяет координату x каждой вершины и переворачивает поверхность.
нормали, так что у вас есть поверхность противоположной стороны с такими же характеристиками
и соответствие узлов с нормалями, согласованными с исходной поверхностью. Тот
если нормали входной поверхности обращены наружу, выходная поверхность также будет
иметь нормали, обращенные наружу.

-поверхность-флип-нормали ПЕРЕВОЗКА ВСЕ ПЛИТКИ НА ПОВЕРХНОСТИ

wb_command -поверхность-флип-нормали

- поверхность для отражения нормалей - вывод - вывод
поверхность

Переворачивает все треугольники на поверхности, в результате чего нормали поверхности зеркально отражаются.
другое направление (внутрь vs наружу). Если вы трансформируете поверхность с помощью аффинного
имеющий отрицательный детерминант или поле искривления, которое аналогичным образом переворачивает поверхность, вы
может иметь поверхность, нормали которой направлены внутрь, что может иметь отображение
проблемы. Использование этой команды решит эту проблему.

-поверхность-генерировать-надутый НАДУВНАЯ ПОВЕРХНОСТЬ

wb_command -поверхность-генерировать-надутый

- анатомическая поверхность - вывод -
выходная надутая поверхность - вывод - вывод очень
надутая поверхность

[-iterations-scale] - необязательное масштабирование итераций

- значение масштаба итераций

Создавайте надутые и очень надутые поверхности. Выходные поверхности совпадают
(имеют тот же диапазон XYZ) к анатомической поверхности. В большинстве случаев масштаб итераций
1.0 (по умолчанию) достаточно. Однако, если поверхность содержит большое количество
узлов (150,000 2.5), попробуйте масштаб итераций XNUMX.

-поверхностное-геодезическое-расстояние ВЫЧИСЛИТЕ ГЕОДЕЗИЧЕСКОЕ РАССТОЯНИЕ ОТ ОДНОЙ ВЕРТИКИ ДО ВСЕЙ ПОВЕРХНОСТИ

wb_command -поверхностное-геодезическое-расстояние

- поверхность для вычислений - вершина для вычисления геодезической
расстояние от - output - метрика вывода

[-naive] - использовать только соседей, не ползать по треугольникам (не рекомендуется)

[-limit] - остановиться на определенном расстоянии

- расстояние в мм до остановки

Если не -предел задано, вычисляет геодезическое расстояние от указанного
вершина ко всем остальным. Результат выводится в виде файла метрик с одним столбцом с
Значение -1 для вершин, для которых расстояние не вычислялось. Если -наивный Не
указано, он использует не только непосредственных соседей, но и соседей, производных от
ползать по парам треугольников, имеющих общую грань.

-поверхность-геодезическая-rois ПОЛУЧИТЕ GEODESIC LIMITED ROIS НА ВЕРСИЯХ

wb_command -поверхность-геодезическая-rois

- поверхность для рисования - предел геодезического расстояния от вершины,
в мм - текстовый файл, содержащий вершины для рисования ROI

женщин-заключенных

- output - метрика вывода

[-gaussian] - генерировать гауссовское ядро ​​вместо плоского ROI

- сигма гауссова ядра в мм

[-overlap-logic] - как обрабатывать перекрывающиеся области интереса, по умолчанию РАЗРЕШИТЬ

- метод устранения перекрытий

[-names] - назвать столбцы из текстового файла

- текстовый файл, содержащий имена столбцов, по одному в каждой строке

Для каждой вершины в файле списка создается столбец в выходной метрике и
В этом столбце отображается область интереса вокруг этой вершины. В каждом столбце показателей будут нули.
вне геодезического расстояния, разделенного , и по умолчанию будет иметь
значение 1.0 внутри него. Если -гауссовский опция указана, значения внутри
ROI вместо этого сформирует гауссовский с указанным значением сигмы, нормализованный
так что сумма ненулевых значений в столбце метрики равна 1.0. В
аргумент -забавка-логика должен иметь одно из значений РАЗРЕШИТЬ, БЛИЖАЙШИЙ или ИСКЛЮЧИТЬ. РАЗРЕШИТЬ
по умолчанию и означает, что области интереса обрабатываются независимо и могут перекрываться. БЛИЖАЙШИЙ
означает, что области интереса могут не перекрываться, и что ни одна область интереса не содержит более близких вершин.
в другую исходную вершину. EXCLUDE означает, что ROI не могут перекрываться, и что любой
вершина в пределах диапазона более чем одной области интереса не принадлежит ни одной области интереса.

-поверхность-инфляция ПОВЕРХНОСТНАЯ ИНФЛЯЦИЯ

wb_command -поверхность-инфляция

- анатомическая поверхность - файл поверхности для
надуть - количество циклов сглаживания
- сила сглаживания (диапазоны [0.0 - 1.0])
- итерации сглаживания - коэффициент инфляции
- output - выходной файл поверхности

Накачивайте поверхность, выполняя циклы, состоящие из сглаживания, за которым следует
надувание (чтобы исправить усадку, вызванную сглаживанием).

-поверхность-информация ДИСПЛЕЙ ИНФОРМАЦИЯ О ПОВЕРХНОСТИ

wb_command -поверхность-информация

- Поверхность, для которой отображается информация

Отображается информация о поверхности, включая вершины, треугольники, ограничивающую рамку,
и интервал.

-поверхность-совпадение ПОВЕРХНОСТНОЕ МАТЧИ

wb_command -поверхность-совпадение

- Соответствующая (справочная) поверхность - Файл
содержащая поверхность, которая будет преобразована - Файл поверхности
после трансформации

Входной файл поверхности будет преобразован так, что его диапазоны координат (ограничивающие
box) соответствует таковому в файле Match Surface

-поверхность-изменить-сферу ИЗМЕНИТЬ РАДИУС И ОБЯЗАТЕЛЬНО ПОЛУЧИТЬ СФЕРУ

wb_command -поверхность-изменить-сферу

- сфера для модификации - радиус выходной сферы должен
имеют - output - сфера вывода

[-recenter] - центрировать сферу заново с помощью ограничивающей рамки.

Эта команда может быть полезна, если вы использовали -поверхность-ресемпл чтобы пересчитать сферу,
который может страдать от проблем, которых обычно нет в
-поверхность-сфера-проект-непроект. Если сфера уже должна быть отцентрирована вокруг
происхождение, используя -рецентрировать может немного сместить его перед изменением радиуса,
что, вероятно, будет нежелательным.

Если не близок к сферической или не центрирован вокруг начала координат и
-рецентрировать не используется, выводится предупреждение.

-поверхность-нормали ВЫВОДИТЕ НОРМАЛЬНЫЕ ВЕРСИИ В КАЧЕСТВЕ МЕТРИЧЕСКОГО ФАЙЛА

wb_command -поверхность-нормали

- поверхность для вывода нормалей - вывод - нормальный
векторы

Вычисляет векторы нормалей файла поверхности и выводит их в виде трех столбцов.
метрический файл.

-поверхность-ресемпл ПРИМЕР ПОВЕРХНОСТИ НА ДРУГУЮ СЕТЬ

wb_command -поверхность-ресемпл

- файл поверхности для ресамплинга - поверхность сферы
с сеткой, что входная поверхность

в настоящее время на

- поверхность сферы, которая совпадает с

и имеет желаемую выходную сетку

- название метода - output - файл выходной поверхности

[-area-surfs] - указать поверхности для коррекции площади вершин на основе

- соответствующая поверхность с сетка - а
соответствующая поверхность с сетка

[-area-metrics] - указать метрики площади вершины для коррекции площади на основе

на - файл метрики с площадями вершин для

сетке

- файл метрики с площадями вершин для сетка

Повторная выборка файла поверхности для двух совпадающих сферических поверхностей. Если
метод корректирует площадь, точно один из -площадь-серфинг or -площадь-метрики обязательно
быть уточненным. Эта опция не используется в обычных обстоятельствах, но предусмотрена для
полнота.

В аргумент должен быть одним из следующих:

ADAP_BARY_AREA БАРИЦЕНТРИЧЕСКИЙ

БАРИЦЕНТРИЧЕСКИЙ метод рекомендуется для анатомических поверхностей, если они не
довольно грубый, чтобы минимизировать сглаживание.

Для поверхностей среза (включая плоские карты) используйте -поверхностный вырез-повторная выборка.

Вместо повторной выборки сферической поверхности -поверхность-сфера-проект-непроект
команда рекомендуется.

-поверхностное сглаживание Сглаживание ПОВЕРХНОСТИ

wb_command -поверхностное сглаживание

- поверхность напильником разгладить - сглаживающая сила
(диапазоны [0.0–1.0]) - итерации сглаживания -
output - файл выходной поверхности

Сглаживает поверхность путем усреднения узлов с их соседями.

-поверхность-сфера-проект-непроект ДЕФОРМИРОВАТЬ СФЕРУ ПО РЕГИСТРАЦИИ

wb_command -поверхность-сфера-проект-непроект

- сфера с желаемой выходной сеткой - а
сфера, которая совпадает со сферой внутри - сфера-проект-к
деформирован в выходное пространство - output - сфера вывода

Каждая вершина предполагается чтобы получить
барицентрические веса, которые затем используются для отмены проекции из .
Это приводит к сфере с топологией , но координаты сдвинуты
деформацией между и .
и должны иметь ту же топологию, что и все
другое, но может иметь разную топологию.

-поверхность-поверхность-3D-расстояние ВЫЧИСЛИТЕ РАССТОЯНИЕ МЕЖДУ СООТВЕТСТВУЮЩИМИ ВЕРТИКАМИ

wb_command -поверхность-поверхность-3D-расстояние

- поверхность для сравнения с эталоном - в
поверхность для использования в качестве эталона - output - выходные расстояния

[-vectors] - вывести векторы смещения

- output - выходные векторы

Вычисляет разность векторов между вершинами каждой поверхности с одинаковым
index, as (comp - ref), и выведите величины и, возможно, смещение
векторы.

-поверхности-вершины-области ИЗМЕРИТЬ ПОВЕРХНОСТЬ ЗА КАЖДЫЙ VERTEX НЕСЕТ ОТВЕТСТВЕННОСТЬ

wb_command -поверхности-вершины-области

- поверхность для измерения - output - метрика вывода

Каждая вершина получает треть площади каждого треугольника, частью которого она является.

-поверхность-клин-объем ИЗМЕРЬТЕ ПЕРВЕРТНЫЙ ОБЪЕМ МЕЖДУ ПОВЕРХНОСТЬЮ

wb_command -поверхность-клин-объем

- внутренняя поверхность - внешняя поверхность -
output - метрика вывода

Вычислите объем площади каждой вершины от одной поверхности до другой. Поверхности
должно иметь соответствие узлов.

-модульный тест

-volume-affine-resample ПРИМЕР ОБЪЕМА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ AFFINE TRANSFORM

wb_command -volume-affine-resample

- объем для передискретизации - аффинный файл для применения
- файл тома в том пространстве, которое вы хотите для

выходной

- метод передискретизации - output - объем вывода

[-flirt] - ДОЛЖЕН использоваться, если affine является аффинным flirt.

- исходный объем, используемый при генерации аффинного
- целевой объем, используемый при генерации аффинного

Передискретизируйте файл тома с помощью аффинного преобразования.
Рекомендуется

методы - CUBIC (кубический сплайн) для большинства данных и ENCLOSING_VOXEL для данных меток.
Параметр должен быть одним из:

КУБИЧЕСКАЯ ОКРУЖАЮЩАЯ_ВОКСЕЛЬНАЯ ТРИЛИНЕЙНАЯ

-volume-all-labels-to-rois ДОПОЛНИТЕЛЬНАЯ ДОРОЖНОСТЬ ОТ ВСЕХ ЯРЛЫКОВ В ОБЪЕМНОЙ КАДРЕ

wb_command -volume-all-labels-to-rois

- файл метки входного объема - номер или название этикетки
карта для использования - output - файл выходного тома

Выходной том имеет рамку для каждой метки в указанном входном кадре, остальные
чем ??? метка, каждая из которых содержит ROI всех вокселей, которые установлены на
соответствующий ярлык.

-объем-захват-плоскость ИНТЕРПОЛИРУЙТЕ ИЗОБРАЖЕНИЕ С ПЛОСКОСТИ ПО ОБЪЕМУ

wb_command -объем-захват-плоскость

- файл тома для интерполяции из - название или номер
подобъем для использования - тип интерполяции - ширина выходного изображения,
в пикселях - высота выходного изображения в пикселях - значение для рендеринга
как черный - значение для рендеринга как белое - x-координата
нижний левый угол выходного изображения - координата Y дна
слева от выходного изображения - z-координата левого нижнего угла
выходное изображение - x-координата нижнего правого угла вывода
изображение - Y-координата нижнего правого угла выходного изображения
- z-координата нижнего правого угла выходного изображения
- x-координата левого верхнего угла выходного изображения -
Y-координата левого верхнего угла выходного изображения - z-координата
верхний левый угол выходного изображения - output - изображение на выходе

ПРИМЕЧАНИЕ. Если вы хотите создать изображение со всеми возможностями графического интерфейса
рендеринг, см. -шоу-сцена.

Визуализирует изображение произвольной плоскости через файл объема с простым
линейная палитра оттенков серого. Параметр должен быть одним из:

КУБИЧЕСКАЯ ОКРУЖАЮЩАЯ_ВОКСЕЛЬНАЯ ТРИЛИНЕЙНАЯ

-volume-copy-extension КОПИРОВАТЬ РАСШИРЕННЫЕ ДАННЫЕ В ДРУГОЙ ФАЙЛ ОБЪЕМА

wb_command -volume-copy-extension

- файл тома, содержащий данные вокселей для использования
- файл тома, содержащий используемые расширения - вывод -
выходной объем

[-drop-unknown] - не копировать расширения, которые Workbench не понимает

Эта команда копирует информацию в файл тома, который не является важной частью
стандартный заголовок или матрица данных, например названия карт, настройки палитры, таблицы меток.
If -drop-неизвестно не указан, он также копирует аналогичный набор информации
другим программным обеспечением.

-объем-создать СОЗДАТЬ ПУСТОЙ ФАЙЛ ОБЪЕМА

wb_command -объем-создать

- длина первого измерения - длина второго измерения -
длина третьего измерения - output - объем вывода

[-plumb] - устанавливается через порядок осей и интервал / смещение

- строка типа 'XYZ', указывающая, какой индекс находится рядом

какое пространственное измерение

- изменение координаты x от увеличения соответствующего

индекс

- изменение координаты y от увеличения соответствующего

индекс

- изменение координаты z при увеличении соответствующего

индекс

- координата x первого воксела - координата Y
первый воксель - координата z первого воксела

[-sform] - устанавливается через изящную форму

- увеличение координаты x от увеличения индекса i
- увеличение координаты x от увеличения индекса j - увеличить в
Координата x от увеличения индекса k - координата x первого воксела
- увеличение координаты y от увеличения индекса i
- увеличение координаты y от увеличения индекса j - увеличить в
Координата y от увеличения индекса k - координата y первого воксела
- увеличение координаты z от увеличения индекса i
- увеличение координаты z от увеличения индекса j - увеличить в
координата z от увеличения индекса k - координата z первого воксела

Создает файл тома, полный нулей.
Именно один из -отвес or -сформовать

необходимо указать.

-объем-расширить РАСШИРЯТЬ ФАЙЛ ОБЪЕМА

wb_command -объем-расширить

- объем для расширения - расстояние в мм до расширения -
метод расширения для использования - output - объем вывода

[-bad-voxel-roi] - указать срок действия вокселей для перезаписи, а не

воксели с нулевым значением - файл тома, положительные значения обозначают воксели для
встали на сторону

их ценности заменили

[-data-roi] - укажите ROI, где находятся данные

- файл тома, положительные значения обозначают воксели, которые имеют

данным

[-subvolume] - выбрать один подобъем для расширения

- номер или название подобтома

Для всех вокселей, обозначенных как плохие, если они соседствуют с неплохим вокселем с
данные или находятся на указанном расстоянии от такого воксела, замените значение в
плохой воксель со значением, вычисленным из соседних неплохих вокселей, у которых есть данные,
в противном случае установите значение равным нулю. Неважно насколько маленький есть, расширение будет
всегда используйте по крайней мере воксели соседа лица.

По умолчанию воксели, содержащие данные со значением 0, являются плохими, укажите -плохой воксель-рои
считать вокселы плохими только в том случае, если они выбраны ROI. Если -данные-рои Не
задано, предполагается, что все воксели имеют данные.

Допустимые значения для являются:

NEAREST - используйте значение ближайшего хорошего вокселя. WEIGHTED - используйте взвешенное значение.
среднее по расстоянию

-объем-оценка-fwhm ОЦЕНИТЬ ГЛАДКОСТЬ ОБЪЕМА ПО ШИШИНЕ

wb_command -объем-оценка-fwhm

- входной объем

[-roi] - использовать только данные в пределах ROI

- объем для использования в качестве ROI

[-subvolume] - выбрать один подобъем для оценки гладкости

- номер или название подобтома

Оценивает плавность входного объема по осям X, Y и Z отдельно,
печать оценок для стандартного вывода. Если -подобъем не указано, каждый
подобъём оценивается и отображается отдельно.

-объем-экстремум НАЙТИ ЭКСТРЕМАЛЬНЫЙ ФАЙЛ В ОБЪЕМНОМ ФАЙЛЕ

wb_command -объем-экстремум

- файл тома для поиска экстремумов - минимальное расстояние
между выявленными экстремумами одного и того же

напишите

- output - объем выходных экстремумов

[-presmooth] - сгладить объем до нахождения экстремумов

- сигма для ядра сглаживания Гаусса, в мм

[-roi] - игнорировать значения за пределами выделенной области

- область поиска экстремумов

[-threshold] - игнорировать мелкие экстремумы

- наибольшее значение, которое следует рассматривать как минимум - самый маленький
значение, которое следует учитывать как максимальное

[-sum-subvols] - вывести сумму экстремальных подобъемов вместо каждого

подобъём отдельно

[-consolidate-mode] - использовать консолидацию локальных минимумов вместо

большой район

[-only-maxima] - найти только максимумы

[-only-minima] - найти только минимумы

[-subvolume] - выбрать один подобъем для поиска экстремумов

- номер или название подобтома

Находит экстремумы в файле тома, при которых не может быть двух экстремумов одного типа.
в пределах друг друга. Экстремумы помечены как -1 для минимумов, 1 для
максимумы, 0 в противном случае. Если -только-максимум or -только-минимумы указано, тогда он будет
игнорировать экстремумы не указанного типа. Эти варианты исключают друг друга.

If -sum-subvols задано, эти экстремальные подобъемы суммируются, и вывод
имеет единственный подобъем с этим результатом.

По умолчанию точка данных является экстремальной, только если она более экстремальна, чем любая другая.
точка данных, которая находится внутри от него. Если -consolidate-режим используется, это
вместо этого начинается с поиска всех точек данных, которые являются более экстремальными, чем их непосредственные
соседей, то пока есть экстремумы внутри друг друга, возьмите
два ближайших друг к другу экстремума и объединить их в один средневзвешенным
на основе того, сколько исходных экстремумов было объединено в каждый из них.

По умолчанию все входные подобъемы используются без сглаживания, используйте -подобъем в
укажите единственный подобъем для использования и -пресглаживание чтобы сгладить ввод перед
поиск экстремумов.

-volume-fill-hole ЗАПОЛНИТЕ ОТВЕРСТИЯ В ОБЪЕМЕ ROI

wb_command -volume-fill-hole

- входной объем ROI - output - объем ROI на выходе

Находит все связанные с гранями части, которые не включены в область интереса, и заполняет все, кроме
самый большой с единицами.

-объем-найти-кластеры ФИЛЬТРУЮЩИЕ КЛАСТЕРЫ ПО ОБЪЕМУ

wb_command -объем-найти-кластеры

- входной объем - порог значений данных
- порог объема скопления, мм ^ 3 - вывод -
выходной объем

[-less-than] - найти значения меньше чем , скорее, чем

большой

[-roi] - выбрать интересующий регион

- рентабельность инвестиций в виде файла тома

[-subvolume] - выбрать один подобъем

- номер или название подобтома

[-size-ratio] - игнорировать кластеры меньше заданной доли

самый большой кластер на карте - доля от объема наибольшего кластера

[-distance] - игнорировать кластеры дальше заданного расстояния от объекта

самый большой кластер - насколько далеко от самого большого кластера может быть кластер,
край

до кромки, в мм

[-start] - начать размечать кластеры со значения, отличного от 1

- значение для первого найденного кластера

Выводит объем с ненулевыми целыми числами для всех вокселей в пределах достаточно большого
кластер и нули в другом месте. Целые числа обозначают членство в кластере (по умолчанию
первый найденный кластер будет использовать значение 1, второй кластер 2 и т. д.). По умолчанию значения
лучше чем считаются находящимися в кластере, используйте -меньше, чем в
тест на значения меньше порогового. Чтобы применить это как маску к данным, или
чтобы сделать более сложную пороговую обработку, см. -объем-математика.

-объемный градиент ГРАДИЕНТ ФАЙЛА ОБЪЕМА

wb_command -объемный градиент

- входной объем - output - выходной градиент
величина объема

[-presmooth] - сгладить объем перед вычислением градиента

- сигма для гауссовой весовой функции, в мм

[-roi] - выбрать интересующую область для получения градиента

- область, в которой будет приниматься градиент

[-vectors] - выходные векторы

- вывод - векторы в виде файла тома

[-subvolume] - выберите один подобъем, чтобы взять градиент

- номер или название подобтома

Вычисляет градиент объема, выполняя линейную регрессию для каждого воксела,
учитывая только его лицевых соседей, если только не существует слишком мало лицевых соседей. В
вектор градиента строится из частных производных полученного линейного
функция, а величина этого вектора является выходом. Если указано, объем
векторный вывод упорядочен с компонентами x, y и z из подобъема как
последовательные подобъемы.

-объем-метка-экспорт-таблица ЭКСПОРТИРОВАТЬ ТАБЛИЦУ ЭТИКЕТК ИЗ ТОМА КАК ТЕКСТ

wb_command -объем-метка-экспорт-таблица

- файл метки входного объема - номер или название этикетки
карта для использования - output - выходной текстовый файл

Берет таблицу меток из карты меток тома и записывает ее в текстовый формат
соответствие тому, что ожидается -объем-метка-импорт.

-объем-метка-импорт ИМПОРТИРОВАТЬ ОБЪЕМ ЭТИКЕТКИ В ФОРМАТ CARET

wb_command -объем-метка-импорт

- объем этикетки для импорта - текстовый файл, содержащий
значения и имена для этикеток - output - объем вывода метки рабочего места

[-discard-others] - установить любые воксели со значениями, не указанными в метке

список к ??? метка

[-unlabeled-value] - установить значение, которое будет интерпретироваться как немаркированное

- числовое значение для немаркированного (по умолчанию 0)

[-subvolume] - выбрать один subvolume для импорта

- номер или название подобтома

[-drop-unused-labels] - удалить все неиспользуемые значения метки из метки.

(см. таблицу ниже)

Создает новый том с информацией о метке в заголовке в каретке nifti
формат расширения. Вы можете указать пустую строку ('' будет работать на linux / mac) для
, который будет рассматриваться как пустой файл. Список этикеток
файл должен содержать строки следующего формата:



Не указывайте в файле "немаркированный" ключ, предполагается, что 0 означает не
помечены, если -непомеченное-значение указан. Имена ярлыков должны быть на отдельном
строка, но может содержать пробелы или другие необычные символы (но не новую строку).
Пробелы удаляются с обоих концов имени метки, но сохраняются, если они находятся в
середина этикетки. Значения красного, зеленого, синего и альфа должны быть целыми числами от
От 0 до 255, и будет указывать цвет, которым будет нарисована метка (альфа 255 означает
непрозрачный, что, вероятно, вам и нужно). По умолчанию он устанавливает новые имена меток.
с именами LABEL_ # для любых встреченных значений, не упомянутых в списке
файл, укажите -discard-другие вместо этого установить эти вокселы на «немаркированный» ключ.

-метка тома в ROI СДЕЛАЙТЕ ЭТИКЕТКУ ОБЪЕМА В ОБЪЕМ ROI

wb_command -метка тома в ROI

- файл метки входного объема - output - объем вывода
файл

[-name] - выбрать ярлык по названию

- название лейбла, рентабельность которого вы хотите получить

[-key] - выбрать ярлык по клавише

- ключ ярлыка, рентабельность которого вы хотите получить

[-map] - выбрать одну карту меток для использования

- номер карты или название

Для каждой карты в , карта создается в где все локации
с надписью или с ключом дается значение 1, а
всем остальным локациям присваивается 0. Ровно одно из -имя и -ключ необходимо указать.
Указывать -map использовать только одну карту из .

-отображение метки объема на поверхность СОЗДАТЬ ОБЪЕМ ЭТИКЕТКИ НА ПОВЕРХНОСТНЫЙ ФАЙЛ ЭТИКЕТКИ

wb_command -отображение метки объема на поверхность

- объем для отображения данных из - поверхность для отображения данных на
- output - выходной файл метки gifti

[-subvol-select] - выбрать один подобтом для сопоставления

- номер или название подобтома

Использует включающий метод сопоставления вокселей для сопоставления данных метки с файлом метки gifti.

-объем-математика ОЦЕНИТЬ ВЫРАЖЕНИЕ ОБЪЕМНЫХ ФАЙЛОВ

wb_command -объем-математика

- выражение для оценки, в кавычках - вывод -
выходной объем

[-fixnan] - заменить NaN результат на значение

- значение для замены NaN на

[-var] - repeatable - файл тома для использования в качестве переменной

- имя переменной, используемое в выражении - громкость
файл для использования в качестве этой переменной

[-subvolume] - выбрать один подобъем

- номер или название подобтома

[-repeat] - повторно использовать один подобъем для каждого подобома расчета

Эта команда оценивает в каждом вокселе независимо.
Там

должен быть хотя бы один -вар вариант (получить пространство тома), даже если
указанное в нем не используется в . Все тома должны иметь одинаковый объем
космос. Имена файлов недействительны в используйте имя переменной и -вар
вариант с сопоставлением чтобы указать входной файл. Если -подобъем опция
отдано любому -вар вариант, из этого файла используется только один подобтом. Если -повторить is
указан, файл должен иметь только один подобъем или -подобъем
опция указана. Все файлы, которые не используются -повторить должно иметь такое же количество
подтомы, запрошенные для использования. Формат как следует:

Выражения состоят из констант, переменных, операторов, скобок и функций,
в инфиксной записи, например, ехр (-x + 3) * масштаб '. Переменные - это строки любого
длина, используя символы az, AZ, 0-9 и _, но не может принимать имя
именованная константа. В настоящее время существует только одна именованная константа, PI. Операторы
- это +, -, *, /, ^,>, <,> =, <=, ==,! =,!, &&, ||. Они ведут себя как в C, за исключением
что ^ - это возведение в степень, то есть pow (x, y), и имеет более высокий приоритет, чем другие
бинарные операторы (также '-3 ^ -4 ^ -5' означает '- (3 ^ (- (4 ^ -5)))'). Знаки <=,> =, == и! =
операторам предоставляется небольшое пространство для маневра, равное одной миллионной части
меньшее из абсолютных значений сравниваемых значений.

Операторы сравнения и логические операторы возвращают 0 или 1, вы можете выполнять маскировку с помощью выражений.
как 'x * (маска> 0)'. Для всех логических операторов вход считается истинным, если и только если
он больше 0. Выражение «0 <x <5» синтаксически не ошибочно, но
он НЕ будет делать то, что требуется, потому что он оценивается слева направо, т.е. '((0
x) <5) ', который всегда будет возвращать 1, поскольку оба возможных результата сравнения
меньше 5. При обнаружении выражения этого типа выдается предупреждение.
Используйте что-то вроде 'x> 0 && x <5', чтобы получить желаемое поведение.

Пробелы между элементами игнорируются, sin (2 * x) эквивалентно
'sin (2 * x)', но 's in (2 * x)' является ошибкой. Подразумеваемое умножение не допускается,
выражение «2x» будет проанализировано как переменная. Круглые скобки (), не использовать
[] или {}. Функции требуют скобок, выражение «sin x» является ошибкой.

Поддерживаются следующие функции:

sin: 1 аргумент, синус аргумента (единицы - радианы) cos: 1 аргумент,
косинус аргумента (единицы - радианы) tan: 1 аргумент, тангенс
аргумент (единицы - радианы) asin: 1 аргумент, обратный синусу аргумента,
в радианах acos: 1 аргумент, величина, обратная косинусу аргумента, в радианах
atan: 1 аргумент, величина, обратная тангенсу аргумента, в радианах atan2: 2
аргументов, atan2 (y, x) возвращает значение, обратное касательной к

(y / x) в радианах, определяя квадрант по знаку обоих аргументов

аргумент sinh: 1, гиперболический синус аргумента cosh: 1 аргумент,
гиперболический косинус аргумента tanh: 1 аргумент, гиперболический тангенс аргумента
аргумент asinh: 1 аргумент, обратный гиперболический синус аргумента acosh: 1
аргумент, обратный гиперболический косинус аргумента atanh: 1 аргумент,
обратный гиперболочный тангенс аргумента ln: 1 аргумент, натуральный логарифм
аргумент exp: 1 аргумент, константа e возведена в степень аргумента
log: 1 аргумент, десятичный логарифм аргумента sqrt: 10 аргумент, квадрат
корень аргумента abs: 1 аргумент, абсолютное значение аргумента floor: 1
аргумент, наибольшее целое число, не большее, чем аргумент round: 1 аргумент,
ближайшее целое число с округлением связей от

нуль

ceil: 1 аргумент, наименьшее целое число не меньше аргумента min: 2 аргумента,
min (x, y) возвращает y, если (x> y), x иначе max: 2 аргумента, max (x, y) возвращает y
if (x <y), x иначе mod: 2 аргумента, mod (x, y) = x - y * floor (x / y) или 0, если
y == 0 ограничение: 3 аргумента, ограничение (x, low, high) = min (max (x, low), high)

-объем-слияние ОБЪЕДИНИТЬ ФАЙЛЫ ОБЪЕМА В НОВЫЙ ФАЙЛ

wb_command -объем-слияние

- output - файл выходного тома

[-volume] - repeatable - указать файл входного тома

- файл тома для использования подобтомов из

[-subvolume] - repeatable - выбрать один подобъем для использования

- номер или название подобтома

[-up-to] - использовать полный диапазон подобъемов

- номер или имя последнего подтома, который нужно

включают

[-reverse] - использовать диапазон в обратном порядке

Берет один или несколько файлов тома и создает новый файл тома путем объединения
подобъемы из них. Входные файлы тома должны иметь одинаковое пространство тома.

Пример: wb_command -объем-слияние аут.нии -VOLUME первый.нии -подобъем 1 -VOLUME
второй.нии

В этом примере будет использоваться первый подобъем из first.nii, за которым следуют все
подтомы из second.nii и записать их в out.nii.

-объем-палитра УСТАНОВИТЕ ПАЛИТРУ ФАЙЛА ОБЪЕМА

wb_command -объем-палитра

- файл тома, который нужно изменить - режим отображения

[-subvolume] - выбрать один подобъем

- номер или название подобтома

[-pos-percent] - мин / макс процент для положительной раскраски данных

- процентиль для наименее положительных данных - в
процентиль для наиболее положительных данных

[-neg-percent] - мин / макс процент для раскраски негативных данных

- процентиль для наименее отрицательных данных - в
процентиль для наиболее отрицательных данных

[-pos-user] - пользовательские минимальные / максимальные значения для положительной раскраски данных

- значение наименее положительных данных - Значение
за самые положительные данные

[-neg-user] - пользовательские минимальные / максимальные значения для раскраски отрицательных данных

- значение для наименее отрицательных данных - Значение
для самых негативных данных

[-interpolate] - интерполировать цвета

- логическое значение, следует ли интерполировать

[-disp-pos] - отображать положительные данные

- логическое значение, отображать ли

[-disp-neg] - отображать положительные данные

- логическое значение, отображать ли

[-disp-zero] - отображать данные ближе к нулю, чем минимальная отсечка

- логическое значение, отображать ли

[-palette-name] - установить используемую палитру

- название палитры

[-thresholding] - установить порог

- установка порога - показывать значения внутри или вне пороговых значений
- нижний порог - верхний порог

Исходный файл тома заменяется измененной версией.
By

по умолчанию все столбцы файла тома настроены на новые настройки, используйте
-подобъем возможность изменить только один подобъем. Параметры сопоставления не указаны в
параметры будут взяты из первого подтома. В аргумент должен быть одним из
следующие:

MODE_AUTO_SCALE MODE_AUTO_SCALE_ABSOLUTE_PERCENTAGE MODE_AUTO_SCALE_PERCENTAGE
MODE_USER_SCALE

В аргумент -имя-палитры должно быть одним из следующих:

PSYCH PSYCH-NO-NONE ROY-BIG ROY-BIG-BL Оранжевый-желтый Gray_Interp_Positive
Gray_Interp clear_brain videen_style фидл raich4_clrmid raich6_clrmid HSB8_clrmid
RBGYR20 RBGYR20P POS_NEG красно-желтый сине-голубой FSL power_surf fsl_red fsl_green
fsl_blue fsl_yellow JET256

В аргумент -пороговая обработка должно быть одним из следующих:

THRESHOLD_TYPE_OFF THRESHOLD_TYPE_NORMAL

В аргумент -пороговая обработка должно быть одним из следующих:

THRESHOLD_TEST_SHOW_OUTSIDE THRESHOLD_TEST_SHOW_INSIDE

-объем-посылка-ресемплинг ГЛАДКИЕ И ОБЪЕМНЫЕ ПОСЫЛКИ

wb_command -объем-посылка-ресемплинг

- объем входных данных - объем этикетки, где
посылки в настоящее время - объем этикетки, где должны быть посылки
- сигма гауссова ядра для сглаживания во время передискретизации -
output - выходной объем

[-fix-zeros] - обрабатывать нулевые значения как не данные

[-subvolume] - выбрать один subvolume в качестве входных.

- номер или название подобтома

Сглаживает и передискретизирует область внутри каждой метки в cur-parcels до области
такое же название ярлыка в новых посылках. Любые воксели в области выходной метки, но
вне области метки ввода будет экстраполировано из ближайших данных. В
-исправить-нули опция заставляет сглаживание не использовать входное значение, если оно равно нулю, но
по-прежнему записывает сглаженное значение в воксель, и после завершения сглаживания он будет
проверьте все оставшиеся нулевые значения и заполните их экстраполированными значениями.

Примечание: все тома должны иметь одинаковые размеры и интервалы.
Чтобы использовать

другое пространство вывода, см. -volume-parcel-resampling-generic.

-volume-parcel-resampling-generic ГЛАДКИЕ И ОБЪЕМНЫЕ ПОСЫЛКИ РАЗНОГО ОБЪЕМА
SPACE

wb_command -volume-parcel-resampling-generic

- объем входных данных - объем этикетки, где
посылки в настоящее время - объем этикетки, где должны быть посылки
- сигма гауссова ядра для сглаживания во время передискретизации -
output - выходной объем

[-fix-zeros] - обрабатывать нулевые значения как не данные

[-subvolume] - выбрать один subvolume в качестве входных.

- номер или название подобтома

Сглаживает и передискретизирует область внутри каждой метки в cur-parcels до области
такое же название ярлыка в новых посылках. Любые воксели в области выходной метки, но
вне области метки ввода будет экстраполировано из ближайших данных. В
-исправить-нули опция заставляет сглаживание не использовать входное значение, если оно равно нулю, но
по-прежнему записывает сглаженное значение в воксель, и после завершения сглаживания он будет
проверьте все оставшиеся нулевые значения и заполните их экстраполированными значениями.
Выходной том будет использовать пространство тома новых участков, в котором нет необходимости.
находиться в том же пространстве тома, что и вход.

-volume-parcel-сглаживание ГЛАДКИЕ ПОСЫЛКИ В РАЗМЕРЕ ОТДЕЛЬНО

wb_command -volume-parcel-сглаживание

- объем для сглаживания - том этикетки, содержащий
посылки сгладить - сигма ядра сглаживания Гаусса, в мм
- output - объем вывода

[-fix-zeros] - обрабатывать нулевые значения как не данные

[-subvolume] - выбрать один подобъем для сглаживания

- номер или название подобтома

Объем сглаживается внутри каждой метки в объеме меток с использованием данных только из
внутри этикетки. Эквивалентно сглаживанию текущего объема с соответствующими областями интереса.
наклеить отдельно, потом сложить получившиеся объемы, но быстрее.

-volume-уменьшить ВЫПОЛНЯЙТЕ ОПЕРАЦИЮ ПО СОКРАЩЕНИЮ НА ОБЪЕМАХ

wb_command -volume-уменьшить

- файл тома для уменьшения - оператор сокращения для использования
- output - объем вывода

[-exclude-outliers] - исключать выбросы из каждого таймсерии по стандарту

отклонение - количество стандартных отклонений ниже среднего до

включают

- количество стандартных отклонений выше среднего до

включают

Для каждого воксела принимает данные по подобъемам как вектор и выполняет
указанное уменьшение на нем, помещая результат в единый выходной объем при этом
воксель. Операторы редукции следующие:

MAX: максимальное значение MIN: минимальное значение INDEXMAX: отсчитываемый от 1 индекс
максимальное значение INDEXMIN: отсчитываемый от 1 индекс минимального значения SUM: сложить все значения
ПРОДУКТ: умножить все значения MEAN: среднее значение данных STDEV: стандарт
отклонение (знаменатель N) SAMPSTDEV: стандартное отклонение выборки (N-1
знаменатель) РАЗБИРАТЕЛЬНОСТЬ: дисперсия данных. МЕДИАНА: медиана данных.
MODE: режим данных COUNT_NONZERO: количество ненулевых элементов в
данным

-volume-remove-острова УДАЛИТЕ ОСТРОВА ИЗ ОБЪЕМА ROI

wb_command -volume-remove-острова

- входной объем ROI - output - объем ROI на выходе

Находит все части области интереса, соединенные гранями, и обнуляет все, кроме самой большой.

-объем-переориентация ИЗМЕНИТЬ ПОРЯДОК ВОКСЕЛЯ В ФАЙЛЕ ОБЪЕМА

wb_command -объем-переориентация

- объем переориентировать - желаемая ориентация
- out - переориентированный объем

Изменяет порядок вокселей и информацию о расстоянии / происхождении заголовка таким образом, чтобы
значение любой пространственной точки не меняется. Строки ориентации выглядят как LPI,
что означает, что первый указатель расположен слева направо, второй - кзади от переднего, и
третье ниже высшего. Допустимые символы:

L слева направо

R справа налево

P сзади кпереди

От переднего до заднего

Я ниже высшего

S от высшего до низшего

-объем-поворот от-экстремумов СОЗДАВАЙТЕ ОБЪЕМНЫЕ КАРТЫ ROI ИЗ ЭКСТРЕМАЛЬНЫХ КАРТ

wb_command -объем-поворот от-экстремумов

- входной объем - ограничение расстояния от центра вокселя, в мм
- output - объем вывода

[-gaussian] - генерировать гауссовское ядро ​​вместо плоского ROI

- сигма гауссова ядра в мм

[-roi] - выбрать интересующий регион для использования

- регион для использования

[-overlap-logic] - как обрабатывать перекрывающиеся области интереса, по умолчанию РАЗРЕШИТЬ

- метод устранения перекрытий

[-subvolume] - выберите один подобъем, чтобы взять градиент

- номер или название подобтома

Для каждого ненулевого значения на каждой карте создайте карту с ROI вокруг этого местоположения.
Если же линия индикатора -гауссовский задана опция, то выводятся нормализованные гауссовские ядра
вместо ROI. В аргумент -забавка-логика должно быть одним из РАЗРЕШИТЬ,
БЛИЖАЙШИЙ или ИСКЛЮЧИТЬ. РАЗРЕШИТЬ - это значение по умолчанию, означающее, что РИ обрабатываются.
независимо и могут перекрываться. БЛИЖАЙШИЙ означает, что рентабельность инвестиций не может пересекаться, и что
ни одна область интереса не содержит вершин, которые находятся ближе к другой исходной вершине. ИСКЛЮЧИТЬ означает
что области интереса не могут перекрываться, и что любая вершина в пределах диапазона более чем одной области интереса
не принадлежит ни к какой рентабельности инвестиций.

-volume-set-space ИЗМЕНИТЬ ИНФОРМАЦИЮ ОБ ОБЪЕМНОМ МЕСТЕ

wb_command -volume-set-space

- входной объем - output - объем вывода

[-plumb] - устанавливается через порядок осей и интервал / смещение

- строка типа 'XYZ', указывающая, какой индекс находится рядом

какое пространственное измерение

- изменение координаты x от увеличения соответствующего

индекс

- изменение координаты y от увеличения соответствующего

индекс

- изменение координаты z при увеличении соответствующего

индекс

- координата x первого воксела - координата Y
первый воксель - координата z первого воксела

[-sform] - устанавливается через изящную форму

- увеличение координаты x от увеличения индекса i
- увеличение координаты x от увеличения индекса j - увеличить в
Координата x от увеличения индекса k - координата x первого воксела
- увеличение координаты y от увеличения индекса i
- увеличение координаты y от увеличения индекса j - увеличить в
Координата y от увеличения индекса k - координата y первого воксела
- увеличение координаты z от увеличения индекса i
- увеличение координаты z от увеличения индекса j - увеличить в
координата z от увеличения индекса k - координата z первого воксела

Записывает копию файла тома с изменением информации о интервале как
указано. Переупорядочения данных вокселей не происходит. Ровно один из -отвес or
-сформовать необходимо указать.

-объемное-сглаживание СГЛАЖДАЙТЕ ФАЙЛ ОБЪЕМА

wb_command -объемное-сглаживание

- объем для сглаживания - сигма ядра сглаживания Гаусса,
в мм - output - объем вывода

[-roi] - сглаживание только по данным в пределах ROI

- объем для использования в качестве ROI

[-fix-zeros] - обрабатывать нулевые значения как не данные

[-subvolume] - выбрать один подобъем для сглаживания

- номер или название подобтома

Гауссово сглаживание для объемов.
По умолчанию сглаживает все подобъемы с помощью

нет ROI, если ROI задан, только положительные воксели в объеме ROI имеют свои значения
используется, а все остальные воксели установлены в ноль. Сглаживание неортогонального объема приведет к
быть значительно медленнее, потому что операцию нельзя разделить на
Одномерные сглаживания без искажения формы ядра.

The -исправить-нули опция заставляет сглаживание не использовать входное значение, если оно равно нулю,
но все же записать сглаженное значение в воксель. Это полезно для нулей, которые
указывают на недостаток информации, не позволяя им снизить интенсивность
соседние воксели, давая нулю экстраполированное значение.

-объемная статистика ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТАТИСТИКА НА ОБЪЕМНОМ ФАЙЛЕ

wb_command -объемная статистика

- входной объем

[-reduce] - использовать операцию сокращения

- операция редукции

[-percentile] - укажите значение в процентиле

- процентиль для поиска

[-subvolume] - отображать вывод только для одного подобтома

- номер или название подобтома

[-roi] - рассматривать только данные внутри roi

- рентабельность инвестиций в виде файла тома

[-match-maps] - каждый подобъем ввода использует соответствующий

подобъем из файла roi

[-show-map-name] - печатать индекс и имя карты перед каждым выводом

Для каждого подобъема ввода печатается одно число, полученное в результате
указанное сокращение или процентильная операция. Использовать -подобъем только дать результат
для одного подобъема. Использовать -рои рассматривать только данные в пределах региона.
Именно один из -уменьшать or -процентиль необходимо указать.

Аргумент против -уменьшать вариант должен быть одним из следующих:

MAX: максимальное значение MIN: минимальное значение INDEXMAX: отсчитываемый от 1 индекс
максимальное значение INDEXMIN: отсчитываемый от 1 индекс минимального значения SUM: сложить все значения
ПРОДУКТ: умножить все значения MEAN: среднее значение данных STDEV: стандарт
отклонение (знаменатель N) SAMPSTDEV: стандартное отклонение выборки (N-1
знаменатель) РАЗБИРАТЕЛЬНОСТЬ: дисперсия данных. МЕДИАНА: медиана данных.
MODE: режим данных COUNT_NONZERO: количество ненулевых элементов в
данным

-объем-tfce СДЕЛАТЬ TFCE НА ФАЙЛЕ ОБЪЕМА

wb_command -объем-tfce

- объем для запуска TFCE - output - объем вывода

[-presmooth] - сгладить громкость перед запуском TFCE

- сигма для ядра сглаживания Гаусса, в мм

[-roi] - выбрать интересующий регион для запуска TFCE.

- область для запуска TFCE в виде тома

[-parameters] - установить параметры для интеграла TFCE

- показатель объема кластера (по умолчанию 0.5) - экспонента для порогового значения
(по умолчанию 2.0)

[-subvolume] - выбрать один подобъем

- номер или название подобтома

Безпороговое усиление кластера - это метод увеличения относительного значения
регионы, которые будут формировать кластеры в стандартном пороговом тесте. Это
достигается путем оценки интеграла:

е (h, p) ^ E * h ^ H * dh

в каждой вершине p, где h изменяется от 0 до максимального значения в данных, а e (h,
p) - протяженность кластера, содержащего вершину p на пороге h. Отрицательный
значения аналогичным образом улучшаются за счет отрицания данных, запуска одного и того же процесса и
отрицая результат.

Этот метод объясняется в: Smith SM, Nichols TE., «Беспороговый кластер.
улучшение: решение проблем сглаживания, пороговой зависимости и
локализация в кластерном выводе ». Neuroimage. 2009 января 1;44(1): 83-98. PMID:
18501637

-Volume-to-Surface-Отображение КАРТА ОБЪЕМ НА ПОВЕРХНОСТИ

wb_command -Volume-to-Surface-Отображение

- объем для отображения данных из - поверхность для отображения данных на
- output - выходной файл метрики

[-trilinear] - использовать трехлинейную объемную интерполяцию

[-enclosing] - использовать значение включающего воксела

[-cubic] - использовать кубические шлицы

[-ribbon-constrained] - использовать алгоритм сопоставления с ограничением ленты

- внутренняя поверхность ленты - внешняя поверхность
лента

[-volume-roi] - использовать объем roi

- файл тома

[-voxel-subdiv] - деление вокселей при оценке веса вокселей

- количество подразделений, по умолчанию 3

[-output-weights] - записать веса вокселей для вершины в объем

файл - номер вершины, для которой нужно получить веса вокселей, отсчитываемый от 0
- output - объем для записи весов

[-myelin-style] - использовать метод картирования миелина

- объем корковой ленты для этого

полушарие

- метрический файл толщины коры - ядро ​​гуасиана в мм
для взвешивания вокселов в пределах диапазона

[-subvol-select] - выбрать один подобтом для сопоставления

- номер или название подобтома

Вы должны указать ровно один метод сопоставления.
Заключительный воксель использует

значение из вокселя, внутри которого находится вершина, а трилинейный - трехмерный линейный
интерполяция на основе вокселей непосредственно на каждой стороне вершины
позиции.

Метод ленточного отображения строит многогранник из соседей вершины на
каждой поверхности и оценивает объем этого многогранника, который падает
внутри любых ближайших вокселей, чтобы использовать их в качестве весов для выборки. Объем ROI составляет
полезно для исключения эффектов частичного объема вокселей, через которые проходят поверхности, и
приведет к тому, что отображение будет игнорировать воксели, которые не имеют положительного значения в
маска. Номер подразделения указывает, как он приблизительно соответствует количеству
объем, который пересекает многогранник, разбивая каждый воксель на NxNxN частей, и
проверка, находится ли центр каждой части внутри многогранника. Если у вас есть
очень большие воксели, подумайте об увеличении этого параметра, если на выходе вы получите нули.

Метод стиля миелина использует часть команды сопоставления миелина caret5 для выполнения
отображение: для каждой вершины поверхности выберите все воксели ближе, чем толщина на
вершины, которые находятся в пределах области интереса ленты и на расстоянии менее половины значения толщины
от вершины по направлению нормали к поверхности и примените гауссовский
ядро с указанной сигмой, чтобы получить используемые веса.

-объем-вектор-операция ВЫПОЛНЯЙТЕ ВЕКТОРНЫЕ ОПЕРАЦИИ С ОБЪЕМНЫМИ ФАЙЛАМИ

wb_command -объем-вектор-операция

- первый векторный входной файл - второй векторный файл ввода
- какую векторную операцию делать - output - выходной файл

[-normalize-a] - нормализовать векторы первого ввода

[-normalize-b] - нормализовать векторы второго входа

[-normalize-output] - нормализовать выходные векторы (не действует для точки

продукт)

[-magnitude] - вывести величину результата (не действует для точки

продукт)

Выполняет векторную операцию над двумя файлами томов (число которых должно быть кратно 3
подобъемы). Любой из входов может иметь несколько векторов (более 3
подобтомов), но не обоих (по крайней мере, у одного должно быть ровно 3 подобома). В
-величина и -нормализовать-выход параметры нельзя указывать вместе или с
DOT операция. В параметр должен быть одним из следующих:

ТОЧКА ПЕРЕКРЕСТНАЯ ДОБАВИТЬ ВЫЧЕТ

-volume-warpfield-resample ПРИМЕР ОБЪЕМА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ WARPFIELD

wb_command -volume-warpfield-resample

- объем для передискретизации - поле искривления, которое нужно применить
- файл тома в том пространстве, которое вы хотите для

выходной

- метод передискретизации - output - объем вывода

[-fnirt] - ДОЛЖЕН использоваться при использовании fnirt warpfield

- объем источника, используемый при генерации поля деформации

Передискретизируйте файл тома с помощью поля деформации.
Рекомендуемые методы:

CUBIC (кубический сплайн) для большинства данных и ENCLOSING_VOXEL для данных меток. В
параметр должен быть одним из:

КУБИЧЕСКАЯ ОКРУЖАЮЩАЯ_ВОКСЕЛЬНАЯ ТРИЛИНЕЙНАЯ

-объемно-взвешенная статистика ВЕСОВАЯ ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТАТИСТИКА НА ОБЪЕМНОМ ФАЙЛЕ

wb_command -объемно-взвешенная статистика

- входной объем

[-weight-volume] - использовать веса из файла тома

- файл тома, содержащий веса

[-subvolume] - отображать вывод только для одного подобтома

- номер или название подобтома

[-roi] - рассматривать только данные внутри roi

- рентабельность инвестиций в виде файла тома

[-match-maps] - каждый подобъем ввода использует соответствующий

подобъем из файла roi

[-mean] - вычислить средневзвешенное значение

[-stdev] - вычислить взвешенное стандартное отклонение

[-sample] - оценить стандартное отклонение совокупности по выборке

[-percentile] - вычислить взвешенный процентиль

- процентиль для поиска

[-sum] - вычислить взвешенную сумму

[-show-map-name] - печатать индекс и имя карты перед каждым выводом

Для каждого подобъема ввода печатается одно число, полученное в результате
указанная операция. Если -вес-объем не указано, объем каждого вокселя равен
использовал. Использовать -подобъем чтобы выдать результат только для одного подобъема. Использовать -рои в
рассматривать только данные в пределах региона. Ровно один из -жадный, -stdev, -процентиль
or -сумма необходимо указать.

. -сумма без -вес-объем эквивалентно интегрированию по
Объем.

-wbsparse-слияние-плотный ОБЪЕДИНЕНИЕ ФАЙЛОВ WBSPARSE ПО ПЛОТНОМУ РАЗМЕРУ

wb_command -wbsparse-слияние-плотный

- по какому измерению объединить, СТРОКА или КОЛОННА - вывод
- выходной файл wbsparse

[-wbsparse] - repeatable - указать входной файл wbsparse

- файл wbsparse для слияния

Входные файлы wbsparse должны иметь соответствующие сопоставления в направлении, отличном от
указано, и отображение в указанном направлении должно быть моделями мозга.

-zip-файл сцены ZIP ФАЙЛ СЦЕНЫ И ЕГО ФАЙЛЫ ДАННЫХ

wb_command -zip-файл сцены

- файл сцены, из которого создается zip-файл - название
папки, созданной, когда zip-файл

с расстегнутой молнией

- out - zip файл, который будет создан

[-base-dir] - указать каталог, в котором где-то находятся все файлы данных

внутри он станет корнем структуры каталогов zip-файла.
- справочник

Если zip-файл уже существует, он будет перезаписан.
If -базовый-дир Не

указано, каталог, содержащий файл сцены, используется в качестве базового каталога.
Файл сцены должен содержать только относительные пути, и никакие файлы данных не могут находиться за пределами
базовый каталог.

-zip-spec-файл ЗАПИСАТЬ ФАЙЛ SPEC И ЕГО ФАЙЛЫ ДАННЫХ

wb_command -zip-spec-файл

- файл спецификации для добавления в zip-файл - название
папки, созданной, когда zip-файл

с расстегнутой молнией

- out - zip файл, который будет создан

[-base-dir] - указать каталог, в котором где-то находятся все файлы данных

внутри он станет корнем структуры каталогов zip-файла.
- справочник

Если zip-файл уже существует, он будет перезаписан.
If -базовый-дир Не

указано, каталог, содержащий файл спецификации, используется в качестве базового каталога.
Файл спецификации должен содержать только относительные пути, и никакие файлы данных не могут находиться за пределами
базовый каталог. Файлы сцены внутри файлов спецификации не проверяются для каких файлов
они ссылаются, убедитесь, что все файлы данных, на которые ссылаются файлы сцены, также
ссылка на файл спецификации.

Используйте wb_command онлайн с помощью сервисов onworks.net