xml2dcm - Интернет в облаке

ПРОГРАММА:

ИМЯ

xml2dcm - Преобразование XML-документа в файл или набор данных DICOM

СИНТАКСИС

xml2dcm [параметры] xmlfile-in dcmfile-out

ОПИСАНИЕ

Ассоциация xml2dcm утилита конвертирует содержимое документа XML (Extensible Markup Language)
в файл или набор данных DICOM. Ожидается, что XML-документ будет проверяться на соответствие DTD.
(Определение типа документа), который описан в файле dcm2xml.dtd. Соответствующий файл XML
можно создать с помощью dcm2xml инструмент (опция + Wb рекомендуется включать двоичные данные).

ПАРАМЕТРЫ

xmlfile-in входное имя XML-файла для преобразования (stdin: "-")

dcmfile-out выходное имя файла DICOM

ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ

Генеральная кредита
-ч --помощь
распечатайте этот текст справки и выйдите

--версия
распечатать информацию о версии и выйти

- аргументы
распечатать развернутые аргументы командной строки

-q --тихий
тихий режим, печать без предупреждений и ошибок

-v --подробный
подробный режим, детали обработки печати

-d --отладка
режим отладки, печать отладочной информации

-ll --log-level [l] evel: строковая константа
(фатальный, ошибка, предупреждение, информация, отладка, трассировка)
использовать уровень l для регистратора

-lc --log-config [f] имя_файла: строка
используйте файл конфигурации f для регистратора

вход кредита
формат входного файла:

+ f - читать-мета-информация
читать метаинформацию, если есть (по умолчанию)

-f --игнорировать метаинформацию
игнорировать метаинформацию файла

обработка кредита
Проверка:

+ Vd --validate-document
проверить XML-документ на соответствие DTD

+ Vn --check-namespace
проверьте пространство имен XML в корне документа

уникальные идентификаторы:

+ Ug --generate-new-uids
создать новый UID экземпляра исследования / серии / СОП

-Uo --dont-overwrite-uids
не перезаписывать существующие UID (по умолчанию)

+ Uo --overwrite-uids
перезаписать существующие UID

выходной кредита
формат выходного файла:

+ F - записать файл
записать формат файла (по умолчанию)

-F --запись-набор данных
записывать набор данных без метаинформации файла

+ Fu --update-meta-info
обновить метаинформацию конкретного файла

синтаксис передачи вывода:

+ t = --write-xfer-same
писать с тем же TS в качестве ввода (по умолчанию)

+ te --write-xfer-little
написать с явным VR little endian TS

+ tb --write-xfer-big
писать с явным обратным порядком байтов VR с прямым порядком байтов TS

+ ti --write-xfer-implicit
писать с неявным обратным порядком байтов VR с прямым порядком байтов TS

+ td --write-xfer-deflated
написать с дефлированным явным VR little endian TS

ценностные представления после 1993 года:

+ u --enable-new-vr
включить поддержку новых VR (UN / UT) (по умолчанию)

-u --disable-новый-vr
отключить поддержку новых VR, конвертировать в OB

кодирование длины группы:

+ g = --group-length-recalc
пересчитать длину группы, если она есть (по умолчанию)

+ g --group-length-create
всегда пишите с элементами длины группы

-g --группа-длина-удалить
всегда писать без элементов длины группы

кодирование длины в последовательностях и элементах:

+ e - длина-явный
писать с явной длиной (по умолчанию)

-e - длина-undefined
писать с неопределенной длиной

Завершающее заполнение набора данных (кроме --write-dataset):

-p = --padding-сохранить
не изменять заполнение (по умолчанию, если не --write-dataset)

-p --отступ от заполнения
без заполнения (неявно, если --write-dataset)

+ p --padding-create [f] ile-pad [i] tem-pad: целое число
выровнять файл по нескольким байтам и элементам по
кратно i байтам

уровень сжатия deflate (только с --write-xfer-deflated):

+ cl --compression-level [l] уровень: целое число (по умолчанию: 6)
0 = без сжатия, 1 = самое быстрое, 9 = наилучшее сжатие

ПРИМЕЧАНИЯ

Базовая структура ожидаемого ввода XML выглядит следующим образом:



<формат файла xmlns="http://dicom.offis.de/dcmtk">

<element tag="0002,0000" vr="UL" vm="1" len="4"
name = "MetaElementGroupLength">
166

...
<element tag="0002,0013" vr="SH" vm="1" len="16"
name = "ImplementationVersionName">
ОФИС_DCMTK_353



<element tag="0008,0005" vr="CS" vm="1" len="10"
name = "SpecificCharacterSet">
ISO_IR 100

...


<element tag="0028,3002" vr="xs" vm="3" len="6"
name = "LUTDescriptor">
256 \ 0 \ 8

...

...

...
<element tag="7fe0,0010" vr="OW" vm="1" len="262144"
name = "PixelData" loaded = "no" binary = "hidden">




Теги «формат файла» и «мета-заголовок» могут отсутствовать для наборов данных DICOM.

Характер Кодирование
Кодировка символов DICOM определяется автоматически из элемента с тегом
«0008,0005» (специальный набор символов) - если присутствует. Следующие наборы символов
в настоящее время поддерживается (требуется LibXML включить Iconv поддержка, см. --версия выход):

ASCII (ISO_IR 6) (UTF-8)
UTF-8 "ISO_IR 192" (UTF-8)
ISO Latin 1 «ISO_IR 100» (ISO-8859-1)
ISO Latin 2 «ISO_IR 101» (ISO-8859-2)
ISO Latin 3 «ISO_IR 109» (ISO-8859-3)
ISO Latin 4 «ISO_IR 110» (ISO-8859-4)
ISO Latin 5 «ISO_IR 148» (ISO-8859-9)
Кириллица «ISO_IR 144» (ISO-8859-5)
Арабский "ISO_IR 127" (ISO-8859-6)
Греческий "ISO_IR 126" (ISO-8859-7)
Иврит «ISO_IR 138» (ISO-8859-8)

Множественные наборы символов не поддерживаются (только первое значение параметра 'Specific Character
Set 'используется для кодировки символов в случае множественности значений).

Читать dcm2xml документация для получения более подробной информации о структуре XML.

Двоичный Данные
Двоичные данные могут быть закодированы как последовательность шестнадцатеричных чисел, разделенных обратной косой чертой.
'\' или в формате Base64 (двоичный = 'base64'). Кроме того, двоичные данные также могут быть прочитаны из
файл (двоичный = 'файл'). В этом случае имя файла должно быть указано как значение элемента,
например

подкаталог / pixeldata.raw

Обратите внимание, что содержимое файла будет прочитано как есть. Ожидается, что данные OW будут
Заказано с прямым порядком байтов и при необходимости будет заменено местами. Никаких проверок для обеспечения
что объем данных является разумным с точки зрения других атрибутов, таких как строки или
Колонны.

компрессия
Если libxml скомпилирован с поддержкой zlib, входной файл (xml-вход) так же может быть
сжатый с помощью ZIP, что обычно приводит к уменьшению размера файлов. См. Вывод опции
--версия чтобы проверить, доступна ли поддержка zlib.

ограничения
Различные версии libxml могут иметь разные ограничения на максимальную длину XML.
значение элемента. Следовательно, следует избегать использования очень длинных значений элементов (например, для
данные пикселей).

Обратите внимание, что xml2dcm в настоящее время не полностью поддерживает файлы DICOMDIR. Конкретно,
значение различных элементов данных смещения не обновляется автоматически этим инструментом.

ВЕДЕНИЕ ЖУРНАЛА

Уровень вывода журнала различных инструментов командной строки и базовых библиотек может
указывается пользователем. По умолчанию в стандарт записываются только ошибки и предупреждения.
поток ошибок. Использование опции --подробный также информационные сообщения, такие как детали обработки
сообщаются. Вариант --отлаживать можно использовать для получения более подробной информации о внутренней деятельности,
например, для отладки. Другие уровни ведения журнала можно выбрать с помощью опции --бревно-
уровень. В --тихий сообщается только о фатальных ошибках. В таких случаях очень серьезных ошибок
приложение обычно закрывается. Для получения дополнительной информации о различных уровнях ведения журнала,
см. документацию модуля oflog.

В случае, если вывод журнала должен быть записан в файл (необязательно с ротацией файла журнала),
в системный журнал (Unix) или в журнал событий (Windows). --log-config может быть использован. Этот
файл конфигурации также позволяет направлять только определенные сообщения на конкретный вывод
поток и для фильтрации определенных сообщений на основе модуля или приложения, в котором они
генерируются. Пример файла конфигурации представлен в /logger.cfg.

КОМАНДА ЛИНИЯ

Все инструменты командной строки используют следующие обозначения параметров: квадратные скобки заключают
необязательные значения (0-1), три точки в конце указывают, что разрешено несколько значений
(1-n), комбинация обоих означает от 0 до n значений.

Параметры командной строки отличаются от параметров ведущим знаком "+" или "-",
соответственно. Обычно порядок и положение параметров командной строки произвольное (т. Е. Они
может появиться где угодно). Однако, если варианты являются взаимоисключающими, крайний правый вид
используется. Такое поведение соответствует стандартным правилам оценки обычных оболочек Unix.

Кроме того, один или несколько командных файлов можно указать с помощью знака «@» в качестве префикса к
имя файла (например, @ command.txt). Такой аргумент команды заменяется содержимым
соответствующий текстовый файл (несколько пробелов рассматриваются как один разделитель, если
они помещаются между двумя кавычками) перед дальнейшей оценкой. Обратите внимание, что
командный файл не может содержать другой командный файл. Этот простой, но эффективный подход
позволяет суммировать общие комбинации опций / параметров и избегает длинных и
запутанные командные строки (пример приведен в файле /dumppat.txt).

ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА

Ассоциация xml2dcm Утилита попытается загрузить словари данных DICOM, указанные в
ДКМДИКТПУТЬ переменная окружения. По умолчанию, т.е. если ДКМДИКТПУТЬ переменная среды
не установлен, файл /dicom.dic будет загружен, если словарь не построен
в приложение (по умолчанию для Windows).

Поведение по умолчанию должно быть предпочтительным, а ДКМДИКТПУТЬ только переменная окружения
используется, когда требуются альтернативные словари данных. В ДКМДИКТПУТЬ переменная среды
имеет тот же формат, что и оболочка Unix PATH переменная, в которой двоеточие (':') разделяет
записи. В системах Windows в качестве разделителя используется точка с запятой (';'). Словарь данных
код попытается загрузить каждый файл, указанный в ДКМДИКТПУТЬ переменная окружения. Это
является ошибкой, если невозможно загрузить словарь данных.

Использование xml2dcm в Интернете с помощью сервисов onworks.net