Это приложение для Linux под названием CAMPARI для запуска в Linux онлайн, последний выпуск которого можно загрузить как campari_v3_09052017.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием CAMPARI, чтобы работать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
CAMPARI для запуска в Linux онлайн
Ad
ОПИСАНИЕ
Мы рады представить вам версию 3 CAMPARI. Это большой шаг по сравнению с версией 2 в первую очередь из-за всесторонней поддержки OpenMP (параллелизм потоков) и значительных улучшений как в удобстве использования, так и в производительности. Мы также снова добавили ряд новых алгоритмов из недавней литературы, и CAMPARI, конечно же, продолжает поддерживать парадигму силового поля ABSINTH и модель неявной сольватации.CAMPARI - это совместный пакет для выполнения и анализа моделирования молекул, в частности полимеров, имеющих биологическое значение. Он ориентирован на широкую доступность алгоритмов для (расширенного) отбора проб и способен бесшовно комбинировать метод Монте-Карло и молекулярно-динамический отбор проб. CAMPARI предлагает пользователю очень высокий уровень контроля над всеми реализованными функциями. Для получения дополнительной информации и возможностей посетите домашнюю страницу проекта по адресу http://campari.sourceforge.net. Версия 2 больше не поддерживается, но окончательная версия остается доступной.
Особенности
- Комбинированный отбор проб MC и MD, MD в декартовом пространстве или пространстве на кручение / твердое тело
- Эффективное распараллеливание OpenMP всех основных подпрограмм Energy / Force
- Анализ на лету или выполнение в качестве инструмента анализа траектории (также параллельно)
- Многие встроенные процедуры анализа (DSSP, карты контактов, функции парной корреляции и т. Д.)
- Поддержка нескольких структурной кластеризации и связанных алгоритмов, а также анализа модели состояния Маркова.
- Полностью документирован (html) и, кроме того, поставляется с 13 учебными пособиями.
- Очень высокий уровень контроля (например, пользовательские голономные ограничения в МД)
- Широкая поддержка методов параллельного моделирования нескольких реплик, таких как обмен репликами при гибридном параллельном выполнении MPI / OpenMP
- Автономное средство анализа средств кластеризации / модели состояния Маркова
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Консоль / Терминал
Язык программирования
Фортран
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/campari/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
